More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6654 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6654  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  100 
 
 		 292 aa  591  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147178  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03410  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  77.08 
 
 		 293 aa  464  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0401967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4180  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  75.17 
 
 		 293 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.112992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2763  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  72.57 
 
 		 300 aa  441  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010329  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2335  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  71.78 
 
 		 307 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.243672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2230  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.82 
 
 		 290 aa  422  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.615659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3810  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  69.15 
 
 		 292 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0625  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.01 
 
 		 290 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.150141 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2131  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.78 
 
 		 297 aa  402  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0838  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.48 
 
 		 293 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22071  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1079  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.19 
 
 		 296 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.857116  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3933  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.9 
 
 		 296 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.527502  normal  0.192647 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4056  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.48 
 
 		 296 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.05 
 
 		 293 aa  392  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4290  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.48 
 
 		 290 aa  391  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.314543 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2263  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.46 
 
 		 305 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1786  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.19 
 
 		 292 aa  389  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.61 
 
 		 289 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1238  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.73 
 
 		 296 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.94 
 
 		 289 aa  383  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1798  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.83 
 
 		 287 aa  384  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.85 
 
 		 289 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112189  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2896  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.76 
 
 		 288 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.257197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1319  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.45 
 
 		 291 aa  381  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0322301 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2899  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.76 
 
 		 287 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4022  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.21 
 
 		 286 aa  383  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5841  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.21 
 
 		 286 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.572504 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0924  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  63.07 
 
 		 293 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.37 
 
 		 296 aa  380  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.942362  decreased coverage  0.00289209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0702  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.12 
 
 		 307 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00504967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3029  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.96 
 
 		 291 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.32 
 
 		 296 aa  378  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6247  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.02 
 
 		 298 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0385422  normal  0.992107 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1399  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.76 
 
 		 290 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4018  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.72 
 
 		 305 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3118  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.07 
 
 		 290 aa  378  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3121  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.86 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2319  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.38 
 
 		 293 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2858  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.12 
 
 		 289 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0450568  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6649  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.02 
 
 		 298 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01945  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.92 
 
 		 292 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3186  glucose-1-phosphate-thymidylyltransferase  63.12 
 
 		 304 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2539  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.41 
 
 		 289 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0621  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.07 
 
 		 293 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3038  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.02 
 
 		 292 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2342  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.7 
 
 		 292 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1494  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.54 
 
 		 287 aa  374  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1983  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.9 
 
 		 287 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2829  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.02 
 
 		 289 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2458  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.63 
 
 		 291 aa  374  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3386  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.67 
 
 		 298 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.76 
 
 		 293 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0399407 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2889  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.41 
 
 		 286 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4055  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2240  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.35 
 
 		 305 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.572666 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03667  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.9 
 
 		 293 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.9 
 
 		 293 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0331  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.54 
 
 		 291 aa  372  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.284071  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001807  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.46 
 
 		 293 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4300  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.9 
 
 		 293 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.671584  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0166  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.9 
 
 		 293 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4028  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.25 
 
 		 310 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1603  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.21 
 
 		 292 aa  371  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.982513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1011  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.16 
 
 		 292 aa  371  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0478  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.86 
 
 		 293 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543511  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.9 
 
 		 293 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1270  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.46 
 
 		 289 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106852  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0517  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.25 
 
 		 293 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0048  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.46 
 
 		 294 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.231271  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0555  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.02 
 
 		 296 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.46 
 
 		 289 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25108  normal  0.28241 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4006  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.9 
 
 		 293 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3286  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60 
 
 		 288 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.25 
 
 		 293 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1059  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.24 
 
 		 291 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1194  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.56 
 
 		 292 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4153  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.9 
 
 		 293 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.07 
 
 		 289 aa  372  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.310491  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1449  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.68 
 
 		 291 aa  371  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1224  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  60.9 
 
 		 289 aa  374  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5902  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.07 
 
 		 293 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03616  hypothetical protein  62.9 
 
 		 293 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0865  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.72 
 
 		 294 aa  371  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000171087 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4132  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.9 
 
 		 293 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4021  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.32 
 
 		 289 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2220  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.15 
 
 		 294 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281714  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0754  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.67 
 
 		 299 aa  368  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  61.54 
 
 		 291 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4255  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.94 
 
 		 296 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2330  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.21 
 
 		 292 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0550352  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0208  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.41 
 
 		 287 aa  370  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2009  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.02 
 
 		 292 aa  369  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2662  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.15 
 
 		 289 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3052  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.25 
 
 		 298 aa  368  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.664934  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0390  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.28 
 
 		 297 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.98 
 
 		 296 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15940  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.67 
 
 		 293 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0872  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.28 
 
 		 297 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1380  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.06 
 
 		 286 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2597  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.28 
 
 		 297 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3489  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.81 
 
 		 295 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.374251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>