More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4721 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_4721  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  100 
 
 
302 aa  615  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249172 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4814  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  70.24 
 
 
292 aa  438  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2721  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.7 
 
 
293 aa  421  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2328  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.67 
 
 
294 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2220  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.32 
 
 
294 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281714  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2321  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.67 
 
 
294 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00736153 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.67 
 
 
294 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000187637 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2435  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.98 
 
 
294 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000704371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2760  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.21 
 
 
293 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01945  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.76 
 
 
292 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1618  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.85 
 
 
293 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952229  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3810  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.71 
 
 
292 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1603  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.37 
 
 
292 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.982513  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0255  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.67 
 
 
309 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2330  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.72 
 
 
292 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0550352  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2652  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.11 
 
 
291 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.94 
 
 
289 aa  382  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  65.14 
 
 
291 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1270  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.51 
 
 
289 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106852  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1059  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.49 
 
 
291 aa  383  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1194  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.94 
 
 
292 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.51 
 
 
289 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25108  normal  0.28241 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01934  hypothetical protein  65.79 
 
 
270 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0279  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.99 
 
 
309 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.643202  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1983  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.37 
 
 
287 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967411  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3556  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.98 
 
 
294 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305082  normal  0.867096 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001807  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.02 
 
 
293 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1224  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  61.94 
 
 
289 aa  378  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1494  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.37 
 
 
287 aa  378  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3052  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.37 
 
 
298 aa  374  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.664934  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0838  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.32 
 
 
293 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22071  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2342  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.66 
 
 
292 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1079  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.68 
 
 
296 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.857116  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0555  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.46 
 
 
296 aa  373  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4290  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.94 
 
 
290 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.314543 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0714  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.17 
 
 
295 aa  371  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4056  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.32 
 
 
296 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2889  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.98 
 
 
286 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4055  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.9 
 
 
289 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112189  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2677  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.81 
 
 
292 aa  371  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2009  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.19 
 
 
292 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0403  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.95 
 
 
303 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.504553 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0625  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.54 
 
 
290 aa  371  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.150141 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3121  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.89 
 
 
293 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3933  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.03 
 
 
296 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.527502  normal  0.192647 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.63 
 
 
289 aa  372  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.310491  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1798  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.15 
 
 
287 aa  373  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2263  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.58 
 
 
305 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1380  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.19 
 
 
286 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2597  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.77 
 
 
297 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.27 
 
 
296 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0123  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.68 
 
 
291 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1283  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.72 
 
 
295 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2539  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.63 
 
 
289 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3970  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.9 
 
 
297 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00629806  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4021  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.76 
 
 
289 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401685  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4290  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.96 
 
 
294 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4018  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.07 
 
 
305 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2733  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.5 
 
 
292 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0872  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.97 
 
 
297 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0684  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase protein  61.46 
 
 
292 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0434  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.92 
 
 
287 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.824963 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1779  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.41 
 
 
293 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.149846  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5902  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.76 
 
 
293 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1073  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.9 
 
 
296 aa  364  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1007  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.72 
 
 
300 aa  365  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0754  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.38 
 
 
299 aa  364  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0843  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.97 
 
 
297 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0237145 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0639  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.46 
 
 
294 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.477683 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15940  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.76 
 
 
293 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2318  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.46 
 
 
297 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.233006 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0390  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.97 
 
 
297 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2131  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.21 
 
 
297 aa  364  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2319  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.76 
 
 
293 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6247  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.7 
 
 
298 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0385422  normal  0.992107 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0752  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.15 
 
 
297 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.42 
 
 
293 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0399407 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6649  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.7 
 
 
298 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0210  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.25 
 
 
301 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375545  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0478  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.11 
 
 
293 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543511  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0153  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.41 
 
 
358 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.34957 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1491  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.9 
 
 
290 aa  364  1e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1565  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.7 
 
 
292 aa  363  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3386  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.06 
 
 
298 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1011  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.5 
 
 
292 aa  363  1e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1382  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.79 
 
 
293 aa  363  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585484 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0621  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.34 
 
 
293 aa  364  1e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0924  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  59.72 
 
 
293 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3162  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.37 
 
 
312 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1399  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.42 
 
 
290 aa  363  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5509  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.86 
 
 
296 aa  363  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1470  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.55 
 
 
312 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.759037  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3286  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.82 
 
 
288 aa  363  2e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3140  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.54 
 
 
297 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2754  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.54 
 
 
297 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0924  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.54 
 
 
297 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3019  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  58.82 
 
 
295 aa  363  2e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.313086  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2377  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.56 
 
 
299 aa  363  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217402  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.54 
 
 
297 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0791129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1851  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.54 
 
 
297 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>