More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1914 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1914  IS5 family transposase orfB  100 
 
 		 76 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.346093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  96 
 
 		 286 aa  154  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  96 
 
 		 286 aa  154  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  96 
 
 		 286 aa  154  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  96 
 
 		 286 aa  154  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  96 
 
 		 286 aa  154  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  89.47 
 
 		 286 aa  148  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0188  integrase catalytic region  80.88 
 
 		 287 aa  114  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  69.44 
 
 		 286 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  69.44 
 
 		 286 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  69.44 
 
 		 286 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  69.44 
 
 		 286 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  69.44 
 
 		 286 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  69.44 
 
 		 286 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  69.44 
 
 		 286 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  69.44 
 
 		 286 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  69.44 
 
 		 286 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  69.44 
 
 		 286 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  69.44 
 
 		 286 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  68.06 
 
 		 286 aa  107  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  68.06 
 
 		 286 aa  107  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  68.06 
 
 		 286 aa  107  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  59.7 
 
 		 289 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  59.7 
 
 		 289 aa  87.8  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  59.7 
 
 		 289 aa  87.8  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2722  integrase catalytic subunit  54.41 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  60 
 
 		 274 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  60 
 
 		 286 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  52.86 
 
 		 281 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  54.17 
 
 		 280 aa  80.5  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  54.17 
 
 		 280 aa  80.5  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  54.17 
 
 		 280 aa  80.5  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  57.35 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  57.35 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0765  integrase catalytic subunit  55.22 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  61.9 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3089  integrase catalytic region  52.78 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  55.22 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  55.07 
 
 		 286 aa  78.2  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  56.72 
 
 		 296 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  56.72 
 
 		 296 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  56.72 
 
 		 296 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  56.72 
 
 		 296 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  55.07 
 
 		 286 aa  78.2  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  55.07 
 
 		 286 aa  78.2  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  57.35 
 
 		 270 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  56.72 
 
 		 296 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  56.72 
 
 		 296 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  55.07 
 
 		 286 aa  78.2  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  57.35 
 
 		 270 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  57.35 
 
 		 270 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  57.35 
 
 		 270 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  57.35 
 
 		 270 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1358  integrase catalytic subunit  53.03 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278768 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  55.07 
 
 		 286 aa  78.2  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36460  Integrase, catalytic domain-containing protein  55.07 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2230  integrase catalytic subunit  56.72 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.226944  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0359  ISEc16, orfB  56.52 
 
 		 207 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1397  transposase-like  53.73 
 
 		 279 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102463  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1744  transposase-like  53.73 
 
 		 279 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.71737  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  52.78 
 
 		 269 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  52.78 
 
 		 267 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  52.78 
 
 		 267 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2872  transposase-like  53.73 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.274716  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  49.32 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  51.47 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  52.17 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  51.47 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  51.47 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01360  IS3 element protein InsF  53.62 
 
 		 288 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  53.62 
 
 		 288 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  53.62 
 
 		 288 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  53.62 
 
 		 288 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  53.62 
 
 		 288 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  53.62 
 
 		 288 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  53.62 
 
 		 288 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0624  putative transposase B  51.47 
 
 		 272 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3747  ISRSO8-transposase orfB protein  51.47 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.916581  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3750  putative transposase B  51.47 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01035  hypothetical protein  53.62 
 
 		 288 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1146  IS3, transposase orfB  53.62 
 
 		 288 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2570  integrase catalytic region  53.62 
 
 		 288 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0458433 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01028  putative transposase for IS3  53.62 
 
 		 271 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  53.62 
 
 		 288 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02696  putative transposase for IS3  53.62 
 
 		 268 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.367073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3746  integrase catalytic region  53.62 
 
 		 288 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.05522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  53.62 
 
 		 288 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  49.28 
 
 		 294 aa  74.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  53.62 
 
 		 288 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  53.62 
 
 		 298 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4847  IS3, transposase orfB  53.62 
 
 		 288 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  53.62 
 
 		 288 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1686  ISCps9, transposase orfB  49.25 
 
 		 295 aa  73.9  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1896  ISCps9, transposase orfB, truncated  49.25 
 
 		 266 aa  73.9  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2857  ISCps9, transposase orfB  49.25 
 
 		 295 aa  73.9  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0915718  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2962  ISCps9, transposase orfB  49.25 
 
 		 295 aa  73.9  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3122  ISCps9, transposase orfB  49.25 
 
 		 295 aa  73.9  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0654  ISRSO8-transposase orfB protein  60 
 
 		 71 aa  73.9  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00557481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1130  ISRSO8-transposase orfB protein  60 
 
 		 71 aa  73.9  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.59317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3700  integrase catalytic subunit  53.73 
 
 		 301 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.484261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>