More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1703 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1703  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 421 aa  874    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  40.23 
 
 		 443 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  39.63 
 
 		 454 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  38.66 
 
 		 444 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  38.66 
 
 		 444 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  38.66 
 
 		 444 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  38.66 
 
 		 444 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  38.89 
 
 		 444 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  38.66 
 
 		 444 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  38.66 
 
 		 444 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  38.19 
 
 		 444 aa  309  8e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  38.19 
 
 		 444 aa  309  8e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  38.15 
 
 		 444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  38.52 
 
 		 443 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  39.72 
 
 		 448 aa  306  4.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  39.72 
 
 		 448 aa  306  4.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1236  glutamyl-tRNA reductase  39.81 
 
 		 448 aa  302  7.000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116001  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  31.24 
 
 		 464 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  30.9 
 
 		 451 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  28.77 
 
 		 464 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  28.57 
 
 		 441 aa  194  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  27.19 
 
 		 443 aa  195  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  29.7 
 
 		 443 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  29.17 
 
 		 441 aa  193  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  28.81 
 
 		 438 aa  190  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  27.7 
 
 		 458 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  27.56 
 
 		 468 aa  186  9e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  30.54 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  31.51 
 
 		 443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  31.51 
 
 		 443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  28.57 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  28.57 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  29.34 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  28.57 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  28.89 
 
 		 436 aa  179  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  28.07 
 
 		 436 aa  179  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  28.29 
 
 		 432 aa  177  4e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  29.14 
 
 		 421 aa  176  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1254  glutamyl-tRNA reductase  27.87 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.094771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  31.34 
 
 		 434 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  26.56 
 
 		 455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  28.31 
 
 		 436 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  28.32 
 
 		 422 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  27.83 
 
 		 440 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08281  glutamyl-tRNA reductase  28.31 
 
 		 436 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0174  glutamyl-tRNA reductase  28.54 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  27.47 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  27.48 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  29.28 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  27.83 
 
 		 458 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08061  glutamyl-tRNA reductase  27.55 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.752768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0776  glutamyl-tRNA reductase  27.59 
 
 		 436 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  27.98 
 
 		 435 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  27.36 
 
 		 434 aa  170  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  27.5 
 
 		 432 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  27.5 
 
 		 428 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  28.82 
 
 		 434 aa  169  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  28.11 
 
 		 434 aa  169  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  28.21 
 
 		 419 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  24.88 
 
 		 458 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  28.84 
 
 		 446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  26.53 
 
 		 425 aa  167  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  26.91 
 
 		 448 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  28.84 
 
 		 446 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  25.36 
 
 		 440 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  27.12 
 
 		 443 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  27.68 
 
 		 428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  25.17 
 
 		 456 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  27.68 
 
 		 428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  28.7 
 
 		 446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08151  glutamyl-tRNA reductase  27.13 
 
 		 435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.374123  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  27.18 
 
 		 456 aa  164  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  26.13 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  26.41 
 
 		 429 aa  163  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  27.55 
 
 		 438 aa  162  7e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  28.5 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  27.34 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  30.07 
 
 		 426 aa  160  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0581  glutamyl-tRNA reductase  28.5 
 
 		 435 aa  160  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.226139 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  27.18 
 
 		 431 aa  159  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  28.54 
 
 		 465 aa  159  7e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  27.49 
 
 		 455 aa  159  9e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  26.55 
 
 		 428 aa  159  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  26.46 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  31.09 
 
 		 427 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  26.46 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  26.16 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  25.97 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  26.46 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  26.55 
 
 		 425 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  25.82 
 
 		 435 aa  157  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  25.97 
 
 		 432 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  26.95 
 
 		 430 aa  156  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  27.88 
 
 		 453 aa  156  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  27.7 
 
 		 418 aa  156  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  27.18 
 
 		 428 aa  156  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  27.55 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  24.94 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  27.16 
 
 		 425 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  26.55 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>