More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1090 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1090  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 275 aa  575  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406253  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0034  exonuclease III  66.91 
 
 		 275 aa  394  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1508  3'-exo-deoxyribonuclease  65.45 
 
 		 275 aa  391  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000904963  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1563  exodeoxyribonuclease  65.09 
 
 		 275 aa  380  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0841  exonuclease III  64.54 
 
 		 285 aa  369  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.193898  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  64.47 
 
 		 274 aa  362  3e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.88161  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1528  exonuclease III  61.23 
 
 		 272 aa  335  3.9999999999999995e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1659  exonuclease III  55.96 
 
 		 273 aa  309  2.9999999999999997e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0110  exodeoxyribonuclease III Xth  46.35 
 
 		 259 aa  231  1e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0939885 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  43.01 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  42.75 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  43.91 
 
 		 250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  38.22 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  43.91 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  42.03 
 
 		 252 aa  208  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  41.24 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  40.58 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  40.58 
 
 		 252 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  40.94 
 
 		 252 aa  205  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  40.58 
 
 		 252 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  40.58 
 
 		 252 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  43.43 
 
 		 250 aa  205  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  40.22 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  41.16 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  41.37 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  40.94 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  39.56 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  40.07 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1689  exonuclease III  41.45 
 
 		 268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000145715  hitchhiker  0.000000000000014729 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1311  exodeoxyribonuclease III Xth  39.71 
 
 		 253 aa  195  7e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  40.44 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  40 
 
 		 257 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  39.29 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  37.82 
 
 		 255 aa  179  5.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  38.04 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  38.75 
 
 		 249 aa  175  6e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  38.75 
 
 		 249 aa  175  7e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  38.77 
 
 		 248 aa  175  8e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  35.53 
 
 		 247 aa  162  6e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  34.06 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  34.42 
 
 		 252 aa  159  5e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  35.4 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  34.31 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.75 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  32.97 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  34.06 
 
 		 253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  33.45 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  35.02 
 
 		 254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_5808  predicted protein  34.98 
 
 		 273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000562371  normal  0.329515 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  34.51 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  32.18 
 
 		 268 aa  142  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  33.94 
 
 		 251 aa  142  8e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  31.05 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  32.26 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  31.88 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  33.21 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  31.43 
 
 		 252 aa  139  7e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  31.88 
 
 		 254 aa  139  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  31.79 
 
 		 252 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  31.27 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  31.9 
 
 		 253 aa  135  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  31.9 
 
 		 255 aa  135  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  32.74 
 
 		 259 aa  135  9e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  32.01 
 
 		 252 aa  135  9e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  31.9 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5639  predicted protein  36.72 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.149213  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  30.96 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  32.74 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  30.94 
 
 		 254 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47361  predicted protein  29.27 
 
 		 489 aa  132  6.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  34.75 
 
 		 264 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  31.65 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  33.07 
 
 		 251 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1739  exodeoxyribonuclease III Xth  34.44 
 
 		 237 aa  128  9.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  31.05 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  31.21 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  30.66 
 
 		 254 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  30.91 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  29.96 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0948  exodeoxyribonuclease III Xth  30.6 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.875165  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  28.47 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  28.47 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6423  exodeoxyribonuclease III Xth  29.14 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  29.21 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6475  exodeoxyribonuclease III Xth  30.68 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  29.41 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  29.59 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2415  exodeoxyribonuclease III Xth  27.01 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0350  exodeoxyribonuclease III Xth  31.03 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0362795  normal  0.625114 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  28.68 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0070  exodeoxyribonuclease III Xth  29.43 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  27.55 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0113  AP endonuclease  28.21 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0233  exodeoxyribonuclease III Xth  28.31 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0277  exodeoxyribonuclease III Xth  28.31 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273673  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0057  exodeoxyribonuclease III Xth  29.43 
 
 		 259 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0227  exodeoxyribonuclease III Xth  27.94 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  26.62 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>