More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1192 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 		 250 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  98.8 
 
 		 250 aa  513  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  75.3 
 
 		 250 aa  401  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  69.92 
 
 		 251 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  70.16 
 
 		 252 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  71.66 
 
 		 251 aa  382  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  72.06 
 
 		 250 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  69.35 
 
 		 252 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  68.95 
 
 		 252 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  69.35 
 
 		 252 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  69.76 
 
 		 252 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  69.35 
 
 		 252 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  68.95 
 
 		 252 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  67.34 
 
 		 252 aa  367  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  68.95 
 
 		 251 aa  363  1e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  65.34 
 
 		 253 aa  355  2.9999999999999997e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  64.8 
 
 		 257 aa  343  1e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0110  exodeoxyribonuclease III Xth  62.95 
 
 		 259 aa  342  5e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0939885 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  63.6 
 
 		 249 aa  340  1e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  60.08 
 
 		 262 aa  340  2e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  62 
 
 		 249 aa  340  2e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  62.65 
 
 		 249 aa  338  4e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  61.85 
 
 		 252 aa  328  4e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  53.87 
 
 		 285 aa  319  3e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  58.96 
 
 		 253 aa  297  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1311  exodeoxyribonuclease III Xth  52.02 
 
 		 253 aa  293  1e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  55.02 
 
 		 253 aa  293  3e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1689  exonuclease III  53.44 
 
 		 268 aa  289  3e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000145715  hitchhiker  0.000000000000014729 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  52.99 
 
 		 255 aa  282  3.0000000000000004e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.6 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  49.01 
 
 		 257 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  48.21 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  48.21 
 
 		 254 aa  249  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  49.8 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  48.61 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  47.08 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  47.67 
 
 		 256 aa  238  6.999999999999999e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  45.42 
 
 		 251 aa  237  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  47.62 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  44.58 
 
 		 255 aa  234  7e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  43.31 
 
 		 254 aa  231  9e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  45.49 
 
 		 253 aa  230  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  46.06 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1528  exonuclease III  44.78 
 
 		 272 aa  227  2e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  45.02 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  44.22 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  46.61 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  46.06 
 
 		 255 aa  218  6e-56  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  43.08 
 
 		 256 aa  218  7.999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  42.57 
 
 		 247 aa  217  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  41.9 
 
 		 257 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  46.85 
 
 		 252 aa  214  8e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  43.87 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  42.91 
 
 		 259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1090  exodeoxyribonuclease III Xth  43.91 
 
 		 275 aa  212  3.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406253  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1508  3'-exo-deoxyribonuclease  43.17 
 
 		 275 aa  211  9e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000904963  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  46.22 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  40.94 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  41.51 
 
 		 268 aa  209  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  42.86 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.46 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1659  exonuclease III  43.8 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  42.06 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  39.53 
 
 		 255 aa  206  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  43.58 
 
 		 252 aa  205  6e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  39.53 
 
 		 253 aa  205  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0034  exonuclease III  41.54 
 
 		 275 aa  205  6e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  42.06 
 
 		 254 aa  204  8e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1563  exodeoxyribonuclease  42.34 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0841  exonuclease III  43.06 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.193898  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  43.31 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  43.12 
 
 		 274 aa  201  7e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.88161  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  43.25 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  42.52 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  39.29 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  40.31 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  42.91 
 
 		 259 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6475  exodeoxyribonuclease III Xth  38.34 
 
 		 264 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3043  exodeoxyribonuclease III Xth  38.25 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3160  exodeoxyribonuclease III Xth  38.25 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485064  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  41.2 
 
 		 257 aa  191  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  40.08 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_5808  predicted protein  42.96 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000562371  normal  0.329515 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  37.05 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  37.85 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  39.61 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  37.45 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2008  exodeoxyribonuclease III Xth  39.13 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0057  exodeoxyribonuclease III Xth  38.25 
 
 		 259 aa  188  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  37.45 
 
 		 256 aa  188  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0186  exodeoxyribonuclease III  37.05 
 
 		 256 aa  188  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0167  exodeoxyribonuclease III  37.05 
 
 		 256 aa  188  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.580227  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0371  exodeoxyribonuclease III  37.05 
 
 		 256 aa  188  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0175  exodeoxyribonuclease III  37.05 
 
 		 256 aa  188  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2379  exodeoxyribonuclease III  37.05 
 
 		 256 aa  188  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124522  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2299  exodeoxyribonuclease III  37.05 
 
 		 256 aa  188  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87728  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2780  exodeoxyribonuclease III  37.05 
 
 		 256 aa  188  9e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  39.04 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1725  exodeoxyribonuclease III Xth  38.34 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.569641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0151  exodeoxyribonuclease III  37.45 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>