More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0441 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  100 
 
 
264 aa  546  1e-154  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  51.72 
 
 
258 aa  287  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  50.59 
 
 
251 aa  263  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  48.45 
 
 
257 aa  251  7e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  46.72 
 
 
255 aa  249  2e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  49.62 
 
 
257 aa  249  4e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  50.77 
 
 
259 aa  248  7e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  50.58 
 
 
255 aa  247  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  50.58 
 
 
253 aa  246  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  45.7 
 
 
255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  47.67 
 
 
336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  46.12 
 
 
252 aa  229  5e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  45.91 
 
 
254 aa  228  6e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  46.18 
 
 
259 aa  227  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  46.36 
 
 
252 aa  227  1e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  46.18 
 
 
259 aa  226  2e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  45.42 
 
 
259 aa  224  9e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  44.62 
 
 
262 aa  223  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  43.85 
 
 
256 aa  223  3e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  44.57 
 
 
252 aa  223  3e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.37 
 
 
237 aa  222  6e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  43.8 
 
 
255 aa  221  7e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  45.53 
 
 
248 aa  221  9e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  43.75 
 
 
268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  47.33 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  42.41 
 
 
255 aa  219  5e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  45.77 
 
 
252 aa  218  7.999999999999999e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  42.25 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  41.63 
 
 
249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  42.52 
 
 
249 aa  211  9e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  41.63 
 
 
249 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  41.41 
 
 
254 aa  209  5e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  42.86 
 
 
252 aa  208  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  43.19 
 
 
251 aa  208  9e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  40.47 
 
 
257 aa  206  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  42.41 
 
 
252 aa  206  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  42.41 
 
 
252 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  42.41 
 
 
252 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  42.41 
 
 
252 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  40.38 
 
 
261 aa  205  6e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  42.91 
 
 
252 aa  205  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  42.47 
 
 
252 aa  204  9e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  40.62 
 
 
254 aa  204  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  42.8 
 
 
252 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  42.19 
 
 
255 aa  202  4e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2415  exodeoxyribonuclease III Xth  41.22 
 
 
270 aa  201  9e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6423  exodeoxyribonuclease III Xth  38.16 
 
 
301 aa  199  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  42.25 
 
 
253 aa  199  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  39.92 
 
 
253 aa  199  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  40.86 
 
 
254 aa  198  6e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  43.3 
 
 
253 aa  198  7.999999999999999e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  39.46 
 
 
254 aa  198  7.999999999999999e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  42.64 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  39.15 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  39.38 
 
 
254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  40.91 
 
 
257 aa  196  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  39.92 
 
 
256 aa  196  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  40.31 
 
 
250 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  40.31 
 
 
250 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  39.31 
 
 
258 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  40.86 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  37.6 
 
 
258 aa  188  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  40.15 
 
 
262 aa  187  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  40.46 
 
 
251 aa  186  4e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0151  exodeoxyribonuclease III  36.86 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  37.64 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  39.53 
 
 
253 aa  183  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  40.86 
 
 
252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  36.47 
 
 
257 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  36.43 
 
 
254 aa  181  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  37.93 
 
 
259 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0167  exodeoxyribonuclease III  36.86 
 
 
256 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.580227  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2379  exodeoxyribonuclease III  36.86 
 
 
256 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124522  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2780  exodeoxyribonuclease III  36.86 
 
 
256 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0371  exodeoxyribonuclease III  36.86 
 
 
256 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2299  exodeoxyribonuclease III  36.86 
 
 
256 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0175  exodeoxyribonuclease III  36.86 
 
 
256 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0186  exodeoxyribonuclease III  36.86 
 
 
256 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1311  exodeoxyribonuclease III Xth  37.4 
 
 
253 aa  179  4e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.74 
 
 
259 aa  178  7e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3043  exodeoxyribonuclease III Xth  37.45 
 
 
257 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3160  exodeoxyribonuclease III Xth  37.45 
 
 
257 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485064  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1689  exonuclease III  38.04 
 
 
268 aa  178  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000145715  hitchhiker  0.000000000000014729 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  37.25 
 
 
260 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  37.25 
 
 
260 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  36.36 
 
 
259 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2491  exodeoxyribonuclease III (xth)  36.47 
 
 
257 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3121  exodeoxyribonuclease III Xth  36.47 
 
 
257 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3105  exodeoxyribonuclease III Xth  36.47 
 
 
257 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  36.47 
 
 
256 aa  175  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0042  exodeoxyribonuclease III Xth  35.55 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.169682 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0110  exodeoxyribonuclease III Xth  38.95 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0939885 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0036  exodeoxyribonuclease III Xth  35.55 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  36.25 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0057  exodeoxyribonuclease III Xth  36.25 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  35.86 
 
 
259 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0350  exodeoxyribonuclease III Xth  35.53 
 
 
269 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0362795  normal  0.625114 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0140  putative exodeoxyribonuclease III protein  34.38 
 
 
261 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  35.52 
 
 
285 aa  169  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1725  exodeoxyribonuclease III Xth  35.14 
 
 
260 aa  169  6e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.569641  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>