More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1311 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1311  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 253 aa  528  1e-149  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1689  exonuclease III  57.94 
 
 		 268 aa  306  3e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000145715  hitchhiker  0.000000000000014729 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  52.02 
 
 		 250 aa  293  1e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  53.44 
 
 		 251 aa  292  3e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  51.61 
 
 		 250 aa  293  3e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  52.44 
 
 		 251 aa  292  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  51.01 
 
 		 250 aa  282  4.0000000000000003e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  50.2 
 
 		 250 aa  276  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  51 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  50.6 
 
 		 253 aa  269  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  50.2 
 
 		 252 aa  269  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  50.6 
 
 		 252 aa  269  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0110  exodeoxyribonuclease III Xth  49.19 
 
 		 259 aa  268  5e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0939885 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  47.98 
 
 		 257 aa  268  7e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  49.8 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  49.4 
 
 		 252 aa  265  5e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  49.4 
 
 		 252 aa  265  5e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  49.4 
 
 		 252 aa  265  5e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  46.77 
 
 		 249 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  49 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  46.37 
 
 		 249 aa  263  3e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  45.56 
 
 		 249 aa  259  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  49.4 
 
 		 252 aa  257  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  44.96 
 
 		 262 aa  256  3e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  41.94 
 
 		 285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  46.99 
 
 		 251 aa  251  8.000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  44.66 
 
 		 253 aa  237  2e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  44.05 
 
 		 255 aa  235  4e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  43.82 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.57 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  41.9 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  41.04 
 
 		 248 aa  209  5e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  42.46 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  43.72 
 
 		 247 aa  202  4e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  41.18 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  41.83 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1090  exodeoxyribonuclease III Xth  39.71 
 
 		 275 aa  195  6e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406253  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  42.4 
 
 		 251 aa  195  6e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  40.39 
 
 		 336 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1528  exonuclease III  39.93 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  40.64 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  39.22 
 
 		 254 aa  191  9e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  38.25 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  38.65 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0034  exonuclease III  37.68 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  37.4 
 
 		 257 aa  189  5e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  40.56 
 
 		 255 aa  188  9e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  41.34 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  37.74 
 
 		 259 aa  184  9e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  37.85 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  37.85 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  38.37 
 
 		 262 aa  182  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  37.11 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1659  exonuclease III  38.15 
 
 		 273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  37.4 
 
 		 264 aa  179  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  37.6 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  38.24 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.88161  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  35.57 
 
 		 254 aa  174  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  37.21 
 
 		 258 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  36.4 
 
 		 252 aa  171  9e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  35.88 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  37.3 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  36.51 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_5808  predicted protein  39.63 
 
 		 273 aa  169  6e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000562371  normal  0.329515 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  36.65 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  35.46 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1508  3'-exo-deoxyribonuclease  35.06 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000904963  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1563  exodeoxyribonuclease  35.29 
 
 		 275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  37.55 
 
 		 260 aa  161  9e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  37.55 
 
 		 260 aa  161  9e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  34.65 
 
 		 254 aa  161  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  35.32 
 
 		 261 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  34.88 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  33.73 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  35.29 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0841  exonuclease III  36.69 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.193898  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  33.85 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.9 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1725  exodeoxyribonuclease III Xth  34.39 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.569641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3160  exodeoxyribonuclease III Xth  34.39 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485064  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3043  exodeoxyribonuclease III Xth  34.39 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  36.29 
 
 		 252 aa  155  4e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  33.99 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2415  exodeoxyribonuclease III Xth  32.41 
 
 		 270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  37.65 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  33.07 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2008  exodeoxyribonuclease III Xth  33.99 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  33.07 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  34.66 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  33.2 
 
 		 256 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0042  exodeoxyribonuclease III Xth  35.29 
 
 		 261 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169682 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0036  exodeoxyribonuclease III Xth  35.29 
 
 		 261 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0140  putative exodeoxyribonuclease III protein  34.1 
 
 		 261 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47361  predicted protein  30.28 
 
 		 489 aa  150  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0350  exodeoxyribonuclease III Xth  34.22 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0362795  normal  0.625114 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3121  exodeoxyribonuclease III Xth  33.2 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2491  exodeoxyribonuclease III (xth)  33.2 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3105  exodeoxyribonuclease III Xth  33.2 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1739  exodeoxyribonuclease III Xth  37.55 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  33.2 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>