More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6475 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6475  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 264 aa  536  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5745  exodeoxyribonuclease III Xth  66.92 
 
 		 294 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05100  exodeoxyribonuclease III  66.92 
 
 		 265 aa  364  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3225  exodeoxyribonuclease III Xth  67.3 
 
 		 265 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  hitchhiker  0.00000209509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1541  AP endonuclease  65.65 
 
 		 267 aa  358  6e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2193  exodeoxyribonuclease III Xth  67.17 
 
 		 267 aa  335  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000941808  hitchhiker  0.000239022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4873  exodeoxyribonuclease III Xth  55.39 
 
 		 274 aa  300  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0668549  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0948  exodeoxyribonuclease III Xth  56.41 
 
 		 272 aa  296  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.875165  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1556  exodeoxyribonuclease III Xth  53.9 
 
 		 270 aa  288  6e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1211  exodeoxyribonuclease III (xth)  57.25 
 
 		 263 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1228  exodeoxyribonuclease III Xth  57.25 
 
 		 263 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1238  exodeoxyribonuclease III Xth  57.25 
 
 		 263 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.15014 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1767  exodeoxyribonuclease III Xth  51.25 
 
 		 278 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  48.86 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.91 
 
 		 259 aa  253  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  46.77 
 
 		 257 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  47.17 
 
 		 257 aa  250  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  45.25 
 
 		 258 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2299  exodeoxyribonuclease III  47.15 
 
 		 256 aa  248  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0175  exodeoxyribonuclease III  47.15 
 
 		 256 aa  248  6e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0167  exodeoxyribonuclease III  47.15 
 
 		 256 aa  248  6e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.580227  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0371  exodeoxyribonuclease III  47.15 
 
 		 256 aa  248  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2379  exodeoxyribonuclease III  47.15 
 
 		 256 aa  248  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124522  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0186  exodeoxyribonuclease III  47.15 
 
 		 256 aa  248  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2780  exodeoxyribonuclease III  47.15 
 
 		 256 aa  248  6e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2491  exodeoxyribonuclease III (xth)  46.39 
 
 		 257 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3121  exodeoxyribonuclease III Xth  46.39 
 
 		 257 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3105  exodeoxyribonuclease III Xth  46.39 
 
 		 257 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  47.15 
 
 		 259 aa  248  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  46.97 
 
 		 259 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2008  exodeoxyribonuclease III Xth  45.08 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  46.39 
 
 		 256 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  44.27 
 
 		 259 aa  246  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  47.53 
 
 		 259 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0057  exodeoxyribonuclease III Xth  48.29 
 
 		 259 aa  246  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3043  exodeoxyribonuclease III Xth  46.59 
 
 		 257 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3160  exodeoxyribonuclease III Xth  46.59 
 
 		 257 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485064  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  45.25 
 
 		 256 aa  246  4e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0151  exodeoxyribonuclease III  46.77 
 
 		 256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1725  exodeoxyribonuclease III Xth  45.08 
 
 		 260 aa  244  8e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.569641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  45.63 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  46.39 
 
 		 261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0070  exodeoxyribonuclease III Xth  47.33 
 
 		 257 aa  242  5e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3979  exodeoxyribonuclease III Xth  49.45 
 
 		 273 aa  242  6e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.573727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0140  putative exodeoxyribonuclease III protein  46.01 
 
 		 261 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  47.25 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000488572 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  45.63 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0042  exodeoxyribonuclease III Xth  45.45 
 
 		 261 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169682 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0036  exodeoxyribonuclease III Xth  45.45 
 
 		 261 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21350  exodeoxyribonuclease III Xth  51.09 
 
 		 273 aa  235  5.0000000000000005e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2985  exodeoxyribonuclease III Xth  49.26 
 
 		 269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04750  exodeoxyribonuclease III  48.91 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.989341  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0288  exodeoxyribonuclease III Xth  42.01 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0277  exodeoxyribonuclease III Xth  40.07 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273673  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10160  exodeoxyribonuclease III  41.21 
 
 		 307 aa  217  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3929  exodeoxyribonuclease III  40.67 
 
 		 263 aa  216  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2277  exodeoxyribonuclease III Xth  44.41 
 
 		 291 aa  215  5.9999999999999996e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0698  exodeoxyribonuclease III Xth  44.07 
 
 		 287 aa  215  7e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.13034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0227  exodeoxyribonuclease III Xth  39.34 
 
 		 267 aa  214  9e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0233  exodeoxyribonuclease III Xth  39.34 
 
 		 267 aa  214  9e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  39.77 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  39.77 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2498  exodeoxyribonuclease III Xth  50.92 
 
 		 276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30930  exodeoxyribonuclease III Xth  42.72 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27900  exodeoxyribonuclease III Xth  45.79 
 
 		 266 aa  211  7e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.408548  normal  0.79978 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1121  exodeoxyribonuclease III Xth  45.42 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.442392  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  39.71 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0121  exodeoxyribonuclease III Xth  41.97 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00155792  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0258  exonuclease III  40.64 
 
 		 286 aa  209  5e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.209471  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0490  putative exodeoxyribonuclease III  40.42 
 
 		 288 aa  209  5e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.114528 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0138  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.61 
 
 		 266 aa  205  5e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.287048  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1619  exodeoxyribonuclease III Xth  41.33 
 
 		 266 aa  204  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0167  exodeoxyribonuclease III Xth  35 
 
 		 319 aa  203  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  40.15 
 
 		 254 aa  203  3e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0295  exodeoxyribonuclease III Xth  40.29 
 
 		 266 aa  201  9e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0403  exodeoxyribonuclease III  38.26 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0089  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.03 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02934  exodeoxyribonuclease III  41.03 
 
 		 266 aa  199  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0757  exodeoxyribonuclease III Xth  45.36 
 
 		 279 aa  198  7e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.198669  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1784  exodeoxyribonuclease III  37.88 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  38.08 
 
 		 254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  38.46 
 
 		 254 aa  193  3e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  38.34 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  39.76 
 
 		 252 aa  192  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  38.98 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4050  exodeoxyribonuclease III Xth  40.52 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121179 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  38.34 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  40 
 
 		 336 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  39.08 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  37.94 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  39.93 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.86 
 
 		 258 aa  189  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  38.58 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  38.58 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  38.58 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  38.58 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  36.64 
 
 		 256 aa  185  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  38.19 
 
 		 252 aa  185  8e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  40.23 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  38.58 
 
 		 252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>