More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47361 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_47361  predicted protein  100 
 
 		 489 aa  1019    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  35.09 
 
 		 250 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  35 
 
 		 253 aa  184  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  33.86 
 
 		 252 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  35 
 
 		 250 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  34.48 
 
 		 250 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  33.54 
 
 		 252 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5639  predicted protein  35.29 
 
 		 269 aa  180  5.999999999999999e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.149213  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  34.69 
 
 		 250 aa  179  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  33.86 
 
 		 252 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  33.86 
 
 		 252 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  33.86 
 
 		 252 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  33.86 
 
 		 252 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  32.29 
 
 		 252 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  33.54 
 
 		 252 aa  177  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_5808  predicted protein  34.66 
 
 		 273 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000562371  normal  0.329515 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  32.39 
 
 		 253 aa  172  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  32.38 
 
 		 249 aa  171  4e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  31.58 
 
 		 257 aa  170  5e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  32.81 
 
 		 249 aa  170  6e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  32.38 
 
 		 249 aa  169  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  34.89 
 
 		 252 aa  167  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  33.02 
 
 		 251 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  32.6 
 
 		 251 aa  166  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  32.7 
 
 		 251 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  34.34 
 
 		 262 aa  162  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  32.39 
 
 		 285 aa  157  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0110  exodeoxyribonuclease III Xth  33.12 
 
 		 259 aa  156  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0939885 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  32.5 
 
 		 253 aa  154  5e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1689  exonuclease III  32.72 
 
 		 268 aa  151  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000145715  hitchhiker  0.000000000000014729 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1311  exodeoxyribonuclease III Xth  30.28 
 
 		 253 aa  150  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  31.15 
 
 		 255 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.69 
 
 		 258 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  31.76 
 
 		 257 aa  141  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  31.37 
 
 		 255 aa  141  3e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0034  exonuclease III  30.49 
 
 		 275 aa  140  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  29.19 
 
 		 257 aa  137  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  29.81 
 
 		 262 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  29.6 
 
 		 255 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  27.83 
 
 		 336 aa  134  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  29.06 
 
 		 254 aa  134  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  31.03 
 
 		 247 aa  133  7.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  30.34 
 
 		 248 aa  132  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  30.22 
 
 		 254 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1090  exodeoxyribonuclease III Xth  29.27 
 
 		 275 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406253  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  29.78 
 
 		 254 aa  131  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  30.84 
 
 		 255 aa  130  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  30.94 
 
 		 253 aa  130  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  29.66 
 
 		 274 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.88161  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1508  3'-exo-deoxyribonuclease  29.18 
 
 		 275 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000904963  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  26.88 
 
 		 254 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  30.84 
 
 		 254 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  30.84 
 
 		 252 aa  128  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  30.22 
 
 		 252 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1528  exonuclease III  29.57 
 
 		 272 aa  127  5e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  27.33 
 
 		 255 aa  126  9e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  27.24 
 
 		 251 aa  126  9e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  31.99 
 
 		 255 aa  124  4e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  27.81 
 
 		 257 aa  124  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  29.22 
 
 		 268 aa  123  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  29.91 
 
 		 252 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  29.85 
 
 		 264 aa  119  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  29.15 
 
 		 254 aa  119  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6423  exodeoxyribonuclease III Xth  27.04 
 
 		 301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  28.04 
 
 		 254 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1659  exonuclease III  30.45 
 
 		 273 aa  117  3.9999999999999997e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1563  exodeoxyribonuclease  28.35 
 
 		 275 aa  117  5e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  28.97 
 
 		 259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  28.84 
 
 		 256 aa  114  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  29.19 
 
 		 259 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0841  exonuclease III  28.44 
 
 		 285 aa  113  7.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.193898  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  27.73 
 
 		 251 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  28.66 
 
 		 252 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  28.57 
 
 		 259 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0157  exodeoxyribonuclease III Xth  28.92 
 
 		 258 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00989742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  27.19 
 
 		 256 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.29 
 
 		 237 aa  111  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  27.1 
 
 		 253 aa  110  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  28.04 
 
 		 256 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  35.8 
 
 		 259 aa  108  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0350  exodeoxyribonuclease III Xth  31.14 
 
 		 269 aa  108  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0362795  normal  0.625114 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2513  exodeoxyribonuclease III Xth  29.6 
 
 		 256 aa  107  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120216  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  27.02 
 
 		 254 aa  106  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2415  exodeoxyribonuclease III Xth  26.02 
 
 		 270 aa  104  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0295  exodeoxyribonuclease III Xth  26.27 
 
 		 266 aa  103  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  24.22 
 
 		 257 aa  102  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04736  DNA lyase Apn2 (AFU_orthologue; AFUA_3G06180)  25.86 
 
 		 612 aa  100  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.847372  normal  0.290859 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  24.69 
 
 		 261 aa  100  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0161  exodeoxyribonuclease III Xth  27.95 
 
 		 256 aa  99.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.011362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  27.08 
 
 		 281 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  25.62 
 
 		 260 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  25.62 
 
 		 260 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0146  exodeoxyribonuclease III Xth  28 
 
 		 258 aa  99  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00325986  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  27.08 
 
 		 281 aa  97.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  28.13 
 
 		 281 aa  97.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  24.7 
 
 		 259 aa  96.3  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  25.31 
 
 		 262 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  25.31 
 
 		 262 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  24.85 
 
 		 257 aa  94.4  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  25.62 
 
 		 260 aa  94  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>