More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0890 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 254 aa  535  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  57.94 
 
 		 254 aa  330  2e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  55.16 
 
 		 254 aa  320  9.999999999999999e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  56.52 
 
 		 254 aa  317  1e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  56.3 
 
 		 254 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  55.12 
 
 		 256 aa  311  5.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  55.12 
 
 		 253 aa  311  6.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  55.51 
 
 		 254 aa  310  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  52.17 
 
 		 254 aa  301  9e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.82 
 
 		 258 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  46.25 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2379  exodeoxyribonuclease III  47.79 
 
 		 256 aa  242  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124522  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0167  exodeoxyribonuclease III  47.79 
 
 		 256 aa  242  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.580227  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0371  exodeoxyribonuclease III  47.79 
 
 		 256 aa  242  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0186  exodeoxyribonuclease III  47.79 
 
 		 256 aa  242  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0175  exodeoxyribonuclease III  47.79 
 
 		 256 aa  242  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2780  exodeoxyribonuclease III  47.79 
 
 		 256 aa  242  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2299  exodeoxyribonuclease III  47.79 
 
 		 256 aa  242  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87728  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  45.82 
 
 		 261 aa  241  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  45.56 
 
 		 249 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  45.42 
 
 		 259 aa  240  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  45.42 
 
 		 257 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0151  exodeoxyribonuclease III  46.99 
 
 		 256 aa  236  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  44.76 
 
 		 249 aa  236  4e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  46.22 
 
 		 257 aa  235  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  46.18 
 
 		 256 aa  234  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  43.5 
 
 		 251 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  43.87 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  45.45 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0403  exodeoxyribonuclease III  43.7 
 
 		 259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3043  exodeoxyribonuclease III Xth  45.78 
 
 		 257 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3160  exodeoxyribonuclease III Xth  45.78 
 
 		 257 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485064  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  43.87 
 
 		 257 aa  231  7.000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0057  exodeoxyribonuclease III Xth  45.42 
 
 		 259 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  43.31 
 
 		 250 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  43.31 
 
 		 250 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  44.83 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  44.83 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3121  exodeoxyribonuclease III Xth  45.42 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  45.82 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2491  exodeoxyribonuclease III (xth)  45.42 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  42.91 
 
 		 253 aa  229  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3105  exodeoxyribonuclease III Xth  45.42 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  45.82 
 
 		 259 aa  229  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  44.71 
 
 		 251 aa  229  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  44.14 
 
 		 262 aa  229  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1784  exodeoxyribonuclease III  43.31 
 
 		 259 aa  228  5e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  45.78 
 
 		 258 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  44.22 
 
 		 258 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.08 
 
 		 259 aa  225  6e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  43.48 
 
 		 255 aa  224  8e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  43.48 
 
 		 253 aa  224  9e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  44.05 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  42.69 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  45.28 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  42.13 
 
 		 250 aa  222  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0070  exodeoxyribonuclease III Xth  43.82 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1725  exodeoxyribonuclease III Xth  44.22 
 
 		 260 aa  221  7e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.569641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  41.04 
 
 		 260 aa  221  9e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  44.71 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  43.87 
 
 		 253 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0140  putative exodeoxyribonuclease III protein  42.58 
 
 		 261 aa  219  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  44.53 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  43.25 
 
 		 256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  41.83 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2008  exodeoxyribonuclease III Xth  43.82 
 
 		 260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  41.83 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  43.14 
 
 		 252 aa  218  6e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  42.91 
 
 		 252 aa  218  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  39.92 
 
 		 255 aa  218  7.999999999999999e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  42.69 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0036  exodeoxyribonuclease III Xth  42.86 
 
 		 261 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  43.08 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0042  exodeoxyribonuclease III Xth  42.86 
 
 		 261 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169682 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  42.13 
 
 		 252 aa  215  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  42.35 
 
 		 257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  42.91 
 
 		 252 aa  214  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  43.53 
 
 		 252 aa  214  8e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  43.24 
 
 		 257 aa  214  9e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  42.13 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  42.13 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  42.13 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  42.52 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  42.69 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  41.73 
 
 		 252 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  41.79 
 
 		 268 aa  211  7e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  43.31 
 
 		 336 aa  210  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3929  exodeoxyribonuclease III  43.24 
 
 		 263 aa  209  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  42.29 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  42.35 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0227  exodeoxyribonuclease III Xth  42.64 
 
 		 267 aa  206  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0233  exodeoxyribonuclease III Xth  42.64 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.53 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  39.53 
 
 		 254 aa  205  5e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0295  exodeoxyribonuclease III Xth  39.31 
 
 		 266 aa  204  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02934  exodeoxyribonuclease III  40.54 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3225  exodeoxyribonuclease III Xth  40.77 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  hitchhiker  0.00000209509 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  42.75 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  43.14 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0277  exodeoxyribonuclease III Xth  40.93 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>