More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0541 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 		 254 aa  535  1e-151  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  61.02 
 
 		 252 aa  328  3e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  60.63 
 
 		 252 aa  328  7e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  59.45 
 
 		 252 aa  319  3e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  58.27 
 
 		 259 aa  315  4e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  57.87 
 
 		 259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  57.87 
 
 		 259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  58.27 
 
 		 252 aa  311  5.999999999999999e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  57.09 
 
 		 251 aa  304  7e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  51.75 
 
 		 257 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  52.36 
 
 		 258 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  52.11 
 
 		 259 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  48.06 
 
 		 262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  49.62 
 
 		 257 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  48.65 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  51.35 
 
 		 255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  47.58 
 
 		 251 aa  241  6e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  45.7 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  46.22 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  45.15 
 
 		 268 aa  228  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  45.91 
 
 		 264 aa  228  6e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  45.88 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  46.27 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  43.7 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  45.49 
 
 		 250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.05 
 
 		 237 aa  221  6e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  45.06 
 
 		 255 aa  221  7e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  45.06 
 
 		 253 aa  221  9e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  45.49 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  46.12 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  45.85 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  43.92 
 
 		 255 aa  214  9e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  42.86 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  43.87 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  42.8 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  42.47 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  43.87 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  43.48 
 
 		 255 aa  212  5.999999999999999e-54  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  44.49 
 
 		 253 aa  211  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  44.49 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  41.8 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  41.86 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  42.47 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  41.7 
 
 		 252 aa  208  8e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  41.7 
 
 		 252 aa  208  8e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  41.7 
 
 		 252 aa  208  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  41.31 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  43.14 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  39.53 
 
 		 254 aa  205  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  43.7 
 
 		 251 aa  205  7e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  43.87 
 
 		 250 aa  203  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  42.86 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  42.13 
 
 		 254 aa  202  5e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  41.27 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  42.86 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  41.25 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  42.13 
 
 		 251 aa  198  9e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  41.02 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  39.13 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  41 
 
 		 256 aa  191  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6423  exodeoxyribonuclease III Xth  36.84 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  39.76 
 
 		 254 aa  188  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  40.39 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  40.39 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  38.91 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  39.53 
 
 		 257 aa  185  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  40 
 
 		 256 aa  185  6e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.19 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  37.01 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  38.98 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3121  exodeoxyribonuclease III Xth  38.98 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2491  exodeoxyribonuclease III (xth)  38.98 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3105  exodeoxyribonuclease III Xth  38.98 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1725  exodeoxyribonuclease III Xth  36.61 
 
 		 260 aa  178  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.569641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0110  exodeoxyribonuclease III Xth  42.69 
 
 		 259 aa  178  7e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0939885 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  37.55 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  38.19 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0167  exodeoxyribonuclease III  37.8 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.580227  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0371  exodeoxyribonuclease III  37.8 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0151  exodeoxyribonuclease III  38.19 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0175  exodeoxyribonuclease III  37.8 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  40 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2780  exodeoxyribonuclease III  37.8 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0186  exodeoxyribonuclease III  37.8 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0057  exodeoxyribonuclease III Xth  38.58 
 
 		 259 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2379  exodeoxyribonuclease III  37.8 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124522  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2299  exodeoxyribonuclease III  37.8 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87728  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2415  exodeoxyribonuclease III Xth  37.65 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  38.19 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  37.15 
 
 		 285 aa  176  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  38.19 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3160  exodeoxyribonuclease III Xth  37.8 
 
 		 257 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485064  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3043  exodeoxyribonuclease III Xth  37.8 
 
 		 257 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0070  exodeoxyribonuclease III Xth  39.13 
 
 		 257 aa  175  8e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  37.15 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2008  exodeoxyribonuclease III Xth  36.22 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  37.4 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  37.5 
 
 		 247 aa  171  7.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  35.83 
 
 		 260 aa  171  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0403  exodeoxyribonuclease III  38.43 
 
 		 259 aa  171  7.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>