More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0521 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 
254 aa  534  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  67.98 
 
 
254 aa  368  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  52.17 
 
 
254 aa  301  9e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  51.98 
 
 
254 aa  291  8e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  51.39 
 
 
254 aa  285  4e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  50 
 
 
254 aa  281  9e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  51.18 
 
 
253 aa  275  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  47.84 
 
 
256 aa  264  8e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  47.84 
 
 
254 aa  263  2e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.46 
 
 
258 aa  232  5e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  41.34 
 
 
255 aa  227  1e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  44.27 
 
 
255 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  44.27 
 
 
253 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  41.18 
 
 
261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  43.08 
 
 
260 aa  218  6e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  43.08 
 
 
260 aa  218  6e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  39.92 
 
 
255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  42.4 
 
 
249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.55 
 
 
237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  41.18 
 
 
257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  38.87 
 
 
251 aa  211  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  41.38 
 
 
262 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  41.34 
 
 
250 aa  209  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  40 
 
 
251 aa  209  3e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  40.94 
 
 
250 aa  209  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  40.71 
 
 
256 aa  207  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  40.4 
 
 
249 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  43.14 
 
 
255 aa  205  7e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  39.76 
 
 
259 aa  205  7e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0403  exodeoxyribonuclease III  38.98 
 
 
259 aa  205  7e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.62 
 
 
259 aa  204  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  41.41 
 
 
260 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  39.13 
 
 
249 aa  203  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  40.71 
 
 
256 aa  203  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  39.06 
 
 
252 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1784  exodeoxyribonuclease III  38.58 
 
 
259 aa  201  8e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0295  exodeoxyribonuclease III Xth  38.72 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  37.8 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  38.28 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  38.98 
 
 
248 aa  201  9.999999999999999e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  39.68 
 
 
251 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  40.23 
 
 
336 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  41.25 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  40.23 
 
 
252 aa  199  3e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  38.67 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  38.67 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  38.67 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  39.3 
 
 
259 aa  199  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  38.67 
 
 
252 aa  198  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  40.55 
 
 
253 aa  198  6e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  38.74 
 
 
251 aa  198  7.999999999999999e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  37.8 
 
 
257 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  41.63 
 
 
257 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  39.92 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  38.19 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  37.89 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  41.11 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  38.28 
 
 
252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3043  exodeoxyribonuclease III Xth  38.19 
 
 
257 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  38.34 
 
 
250 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0277  exodeoxyribonuclease III Xth  39.25 
 
 
267 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273673  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3160  exodeoxyribonuclease III Xth  38.19 
 
 
257 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485064  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  38.74 
 
 
250 aa  196  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2491  exodeoxyribonuclease III (xth)  37.8 
 
 
257 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3121  exodeoxyribonuclease III Xth  37.8 
 
 
257 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3105  exodeoxyribonuclease III Xth  37.8 
 
 
257 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0175  exodeoxyribonuclease III  37.4 
 
 
256 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0186  exodeoxyribonuclease III  37.4 
 
 
256 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0167  exodeoxyribonuclease III  37.4 
 
 
256 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.580227  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2299  exodeoxyribonuclease III  37.4 
 
 
256 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87728  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0371  exodeoxyribonuclease III  37.4 
 
 
256 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  37.8 
 
 
256 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2379  exodeoxyribonuclease III  37.4 
 
 
256 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124522  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2780  exodeoxyribonuclease III  37.4 
 
 
256 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  39.22 
 
 
259 aa  193  3e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  39.76 
 
 
247 aa  192  4e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3929  exodeoxyribonuclease III  41.6 
 
 
263 aa  192  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  40.86 
 
 
252 aa  192  4e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  38.34 
 
 
253 aa  192  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  36.61 
 
 
258 aa  191  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0070  exodeoxyribonuclease III Xth  39.37 
 
 
257 aa  191  7e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4050  exodeoxyribonuclease III Xth  39.54 
 
 
262 aa  191  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121179 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  39.25 
 
 
262 aa  191  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  38.82 
 
 
259 aa  191  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  39.22 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1619  exodeoxyribonuclease III Xth  40.98 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0151  exodeoxyribonuclease III  36.61 
 
 
256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  36.47 
 
 
258 aa  188  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  37.92 
 
 
268 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  40.23 
 
 
259 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  38.13 
 
 
257 aa  187  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0110  exodeoxyribonuclease III Xth  37.5 
 
 
259 aa  187  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0939885 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  37.65 
 
 
259 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  37.65 
 
 
252 aa  186  2e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  38.1 
 
 
253 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0233  exodeoxyribonuclease III Xth  37.74 
 
 
267 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  37.01 
 
 
259 aa  185  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3225  exodeoxyribonuclease III Xth  39.08 
 
 
265 aa  185  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  hitchhiker  0.00000209509 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0227  exodeoxyribonuclease III Xth  37.74 
 
 
267 aa  185  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  37.01 
 
 
259 aa  185  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>