More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0123 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  100 
 
 		 259 aa  539  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  71.71 
 
 		 260 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  70.31 
 
 		 259 aa  387  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1725  exodeoxyribonuclease III Xth  69.11 
 
 		 260 aa  383  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.569641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2008  exodeoxyribonuclease III Xth  67.57 
 
 		 260 aa  378  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  67.19 
 
 		 257 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  63.81 
 
 		 259 aa  358  7e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  62.79 
 
 		 258 aa  352  5e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0140  putative exodeoxyribonuclease III protein  63.08 
 
 		 261 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0036  exodeoxyribonuclease III Xth  64.5 
 
 		 261 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0042  exodeoxyribonuclease III Xth  64.5 
 
 		 261 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169682 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  60.23 
 
 		 257 aa  342  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  63.18 
 
 		 258 aa  342  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0186  exodeoxyribonuclease III  59.85 
 
 		 256 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0175  exodeoxyribonuclease III  59.85 
 
 		 256 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2780  exodeoxyribonuclease III  59.85 
 
 		 256 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0167  exodeoxyribonuclease III  59.85 
 
 		 256 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.580227  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0371  exodeoxyribonuclease III  59.85 
 
 		 256 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2379  exodeoxyribonuclease III  59.85 
 
 		 256 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124522  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2299  exodeoxyribonuclease III  59.85 
 
 		 256 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87728  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4050  exodeoxyribonuclease III Xth  62.84 
 
 		 262 aa  339  2.9999999999999998e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121179 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  59.69 
 
 		 256 aa  338  7e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3043  exodeoxyribonuclease III Xth  59.07 
 
 		 257 aa  337  9e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3160  exodeoxyribonuclease III Xth  59.07 
 
 		 257 aa  337  9e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485064  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0151  exodeoxyribonuclease III  59.39 
 
 		 256 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  62.65 
 
 		 261 aa  335  5e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  60.15 
 
 		 259 aa  332  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3121  exodeoxyribonuclease III Xth  59 
 
 		 257 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2491  exodeoxyribonuclease III (xth)  59 
 
 		 257 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3105  exodeoxyribonuclease III Xth  59 
 
 		 257 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0057  exodeoxyribonuclease III Xth  59.39 
 
 		 259 aa  332  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  60.15 
 
 		 259 aa  332  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  60.31 
 
 		 257 aa  329  3e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0233  exodeoxyribonuclease III Xth  57.89 
 
 		 267 aa  324  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0227  exodeoxyribonuclease III Xth  57.52 
 
 		 267 aa  322  4e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  57.3 
 
 		 267 aa  319  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3929  exodeoxyribonuclease III  56.7 
 
 		 263 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0277  exodeoxyribonuclease III Xth  55.26 
 
 		 267 aa  308  6.999999999999999e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273673  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0288  exodeoxyribonuclease III Xth  55.89 
 
 		 264 aa  305  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0070  exodeoxyribonuclease III Xth  59.07 
 
 		 257 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0167  exodeoxyribonuclease III Xth  50 
 
 		 319 aa  300  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1619  exodeoxyribonuclease III Xth  56.02 
 
 		 266 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0089  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  59.16 
 
 		 263 aa  295  6e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  56.25 
 
 		 256 aa  290  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0403  exodeoxyribonuclease III  52.73 
 
 		 259 aa  286  2e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1784  exodeoxyribonuclease III  52.73 
 
 		 259 aa  284  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0295  exodeoxyribonuclease III Xth  54.85 
 
 		 266 aa  282  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  51.56 
 
 		 260 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  51.56 
 
 		 260 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1541  AP endonuclease  52.47 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241112  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02934  exodeoxyribonuclease III  54.14 
 
 		 266 aa  271  6e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3225  exodeoxyribonuclease III Xth  48.86 
 
 		 265 aa  257  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  hitchhiker  0.00000209509 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0121  exodeoxyribonuclease III Xth  49.25 
 
 		 266 aa  254  6e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00155792  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0138  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.87 
 
 		 266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.287048  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2193  exodeoxyribonuclease III Xth  48.13 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000941808  hitchhiker  0.000239022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6475  exodeoxyribonuclease III Xth  46.97 
 
 		 264 aa  248  9e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05100  exodeoxyribonuclease III  47.37 
 
 		 265 aa  242  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5745  exodeoxyribonuclease III Xth  44.91 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  44.49 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  45.17 
 
 		 256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  43.31 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  42.69 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  43.58 
 
 		 254 aa  216  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0216  exodeoxyribonuclease III (xth)  54.92 
 
 		 349 aa  214  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0618  exodeoxyribonuclease III Xth  39.53 
 
 		 258 aa  211  7.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000157128 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0948  exodeoxyribonuclease III Xth  45.15 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.875165  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70390  catabolite repression control protein  41.86 
 
 		 259 aa  208  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6108  catabolite repression control protein  41.86 
 
 		 259 aa  208  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0466604  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  40.89 
 
 		 277 aa  206  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000488572 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0180  exodeoxyribonuclease III Xth  41.02 
 
 		 259 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  hitchhiker  0.00000710685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5292  exodeoxyribonuclease III Xth  41.41 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.328538 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5341  exodeoxyribonuclease III Xth  41.41 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11599  hitchhiker  0.00893933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5200  exodeoxyribonuclease III Xth  41.41 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02870  catabolite repression control protein; Crc  41.41 
 
 		 259 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0215  exodeoxyribonuclease III xth  41.02 
 
 		 259 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5545  exodeoxyribonuclease III xth  41.02 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0079  exodeoxyribonuclease III, putative  41.02 
 
 		 259 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.22 
 
 		 258 aa  201  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  41.73 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  41.57 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4384  exodeoxyribonuclease III Xth  39.45 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465503  normal  0.053083 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3205  exodeoxyribonuclease III  38.08 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  39.3 
 
 		 254 aa  199  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  37.8 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0461  exodeoxyribonuclease III (xth)  44.36 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  40.15 
 
 		 254 aa  193  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21350  exodeoxyribonuclease III Xth  42.8 
 
 		 273 aa  191  7e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3671  histidine kinase  37.21 
 
 		 261 aa  191  9e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.148225 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4873  exodeoxyribonuclease III Xth  40.81 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0668549  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  38.46 
 
 		 257 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1121  exodeoxyribonuclease III Xth  41.26 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.442392  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  39.62 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1556  exodeoxyribonuclease III Xth  42.59 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27900  exodeoxyribonuclease III Xth  39.55 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.408548  normal  0.79978 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  37.2 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  40.62 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2985  exodeoxyribonuclease III Xth  40.37 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  40.62 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1228  exodeoxyribonuclease III Xth  40.52 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1238  exodeoxyribonuclease III Xth  40.52 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.15014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>