More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0461 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0461  exodeoxyribonuclease III (xth)  100 
 
 		 267 aa  543  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3929  exodeoxyribonuclease III  46.04 
 
 		 263 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0233  exodeoxyribonuclease III Xth  44.81 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0227  exodeoxyribonuclease III Xth  44.44 
 
 		 267 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  43.92 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0288  exodeoxyribonuclease III Xth  44.11 
 
 		 264 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.41 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  44.53 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  44.36 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  44.05 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  40.94 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  41.96 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2008  exodeoxyribonuclease III Xth  41.8 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  43.7 
 
 		 257 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  42 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  42 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0070  exodeoxyribonuclease III Xth  43.6 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0057  exodeoxyribonuclease III Xth  41.6 
 
 		 259 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0277  exodeoxyribonuclease III Xth  43.4 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273673  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1619  exodeoxyribonuclease III Xth  43.56 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  40.94 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1725  exodeoxyribonuclease III Xth  41.41 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.569641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0151  exodeoxyribonuclease III  42.91 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  41.96 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  40.55 
 
 		 259 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  39.44 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  42.63 
 
 		 256 aa  191  8e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0167  exodeoxyribonuclease III  42.91 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.580227  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2299  exodeoxyribonuclease III  42.91 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87728  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2780  exodeoxyribonuclease III  42.91 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0371  exodeoxyribonuclease III  42.91 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  41.34 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0175  exodeoxyribonuclease III  42.91 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2379  exodeoxyribonuclease III  42.91 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124522  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0186  exodeoxyribonuclease III  42.91 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  42.17 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0140  putative exodeoxyribonuclease III protein  40.78 
 
 		 261 aa  188  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3160  exodeoxyribonuclease III Xth  41.57 
 
 		 257 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485064  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3043  exodeoxyribonuclease III Xth  41.57 
 
 		 257 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  42.26 
 
 		 267 aa  188  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3121  exodeoxyribonuclease III Xth  40.94 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2491  exodeoxyribonuclease III (xth)  40.94 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3105  exodeoxyribonuclease III Xth  40.94 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4050  exodeoxyribonuclease III Xth  43.51 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0042  exodeoxyribonuclease III Xth  40 
 
 		 261 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169682 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0036  exodeoxyribonuclease III Xth  40 
 
 		 261 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  41.73 
 
 		 256 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0089  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.87 
 
 		 263 aa  185  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  42.63 
 
 		 256 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02934  exodeoxyribonuclease III  41.54 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5745  exodeoxyribonuclease III Xth  42.64 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6475  exodeoxyribonuclease III Xth  42.64 
 
 		 264 aa  179  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  43.69 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  41.25 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3225  exodeoxyribonuclease III Xth  42.53 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  hitchhiker  0.00000209509 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0167  exodeoxyribonuclease III Xth  36.88 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1541  AP endonuclease  42.91 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241112  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  40 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05100  exodeoxyribonuclease III  41.95 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  37.25 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0403  exodeoxyribonuclease III  36.65 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  40.47 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  38.52 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  35.32 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1784  exodeoxyribonuclease III  36.25 
 
 		 259 aa  168  7e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  35.69 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0121  exodeoxyribonuclease III Xth  40.15 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00155792  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  36.25 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  34.51 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2193  exodeoxyribonuclease III Xth  43.51 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000941808  hitchhiker  0.000239022 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  35.71 
 
 		 262 aa  165  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  36.08 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0948  exodeoxyribonuclease III Xth  40.15 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.875165  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0138  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.78 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.287048  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  35.55 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  34.22 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.43 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  34.22 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  34.22 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27900  exodeoxyribonuclease III Xth  40.15 
 
 		 266 aa  162  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.408548  normal  0.79978 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  33.06 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1556  exodeoxyribonuclease III Xth  40.82 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0295  exodeoxyribonuclease III Xth  39.19 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4873  exodeoxyribonuclease III Xth  39.33 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0668549  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  37.89 
 
 		 253 aa  159  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  36.4 
 
 		 256 aa  158  7e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  35.43 
 
 		 251 aa  158  7e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0757  exodeoxyribonuclease III Xth  42.76 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.198669  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  35.48 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  33.06 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  32.8 
 
 		 249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  36.84 
 
 		 250 aa  155  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  35.29 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  35.86 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2985  exodeoxyribonuclease III Xth  40.52 
 
 		 269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  37.25 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  34.25 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0698  exodeoxyribonuclease III Xth  38.43 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.13034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04750  exodeoxyribonuclease III  41.11 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.989341  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  38.13 
 
 		 253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>