More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1064 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 		 255 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  60.08 
 
 		 336 aa  322  5e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  59.45 
 
 		 257 aa  317  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  58.27 
 
 		 257 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  56.86 
 
 		 259 aa  304  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  52.08 
 
 		 268 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.79 
 
 		 258 aa  280  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  50.99 
 
 		 255 aa  279  2e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  51.82 
 
 		 251 aa  279  3e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  50.78 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  48.41 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  50.2 
 
 		 250 aa  259  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  49.41 
 
 		 251 aa  258  6e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  47.27 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  48.81 
 
 		 251 aa  250  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  49.02 
 
 		 252 aa  248  7e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  46.83 
 
 		 253 aa  248  8e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  46.25 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  49.8 
 
 		 252 aa  244  8e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  45.6 
 
 		 249 aa  244  9e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  46.8 
 
 		 249 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  48.61 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  51.35 
 
 		 254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  48.21 
 
 		 250 aa  241  9e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  46.64 
 
 		 250 aa  239  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  45.06 
 
 		 257 aa  238  5e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  43.48 
 
 		 248 aa  238  5.999999999999999e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  48.25 
 
 		 253 aa  238  6.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.29 
 
 		 237 aa  238  9e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  45.88 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  49.22 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  45.88 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  46.06 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  46.06 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  47.17 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  48.05 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  45.1 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  48.05 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  46.3 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  44.92 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  44.71 
 
 		 252 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  46.88 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  45.88 
 
 		 252 aa  229  5e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  44.31 
 
 		 252 aa  228  8e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  44.31 
 
 		 252 aa  228  8e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  44.31 
 
 		 252 aa  228  8e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  47.45 
 
 		 251 aa  228  8e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  48.24 
 
 		 253 aa  227  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  45.06 
 
 		 255 aa  227  1e-58  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  43.92 
 
 		 252 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  43.25 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  43.8 
 
 		 264 aa  221  7e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  44.71 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  41.3 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  41.5 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  42.97 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  45.88 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  42.13 
 
 		 254 aa  214  7e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  41.8 
 
 		 256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  40.55 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  43.08 
 
 		 254 aa  211  7e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0110  exodeoxyribonuclease III Xth  44.92 
 
 		 259 aa  208  7e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0939885 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  42.29 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  43.14 
 
 		 254 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  42.35 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1689  exonuclease III  37.84 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000145715  hitchhiker  0.000000000000014729 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1311  exodeoxyribonuclease III Xth  41.83 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  39.76 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2415  exodeoxyribonuclease III Xth  40.32 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  40.7 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6423  exodeoxyribonuclease III Xth  37.2 
 
 		 301 aa  185  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  37.15 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.91 
 
 		 259 aa  182  6e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  40 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  38.58 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  38.58 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  35.83 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  35.04 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0036  exodeoxyribonuclease III Xth  36.05 
 
 		 261 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0042  exodeoxyribonuclease III Xth  36.05 
 
 		 261 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169682 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  35.83 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3121  exodeoxyribonuclease III Xth  35.16 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0070  exodeoxyribonuclease III Xth  38.43 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  35.83 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  36.47 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2491  exodeoxyribonuclease III (xth)  35.16 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3105  exodeoxyribonuclease III Xth  35.16 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3043  exodeoxyribonuclease III Xth  35.43 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3160  exodeoxyribonuclease III Xth  35.43 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485064  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2780  exodeoxyribonuclease III  35.04 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0167  exodeoxyribonuclease III  35.04 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.580227  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0186  exodeoxyribonuclease III  35.04 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0371  exodeoxyribonuclease III  35.04 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2299  exodeoxyribonuclease III  35.04 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87728  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  36.86 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2379  exodeoxyribonuclease III  35.04 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124522  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0175  exodeoxyribonuclease III  35.04 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0151  exodeoxyribonuclease III  34.65 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0140  putative exodeoxyribonuclease III protein  36.43 
 
 		 261 aa  175  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0277  exodeoxyribonuclease III Xth  35.74 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>