More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6423 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6423  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 
301 aa  604  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.83 
 
 
258 aa  235  6e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  43.37 
 
 
251 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  43.86 
 
 
255 aa  219  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  43.86 
 
 
253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  37.32 
 
 
255 aa  206  4e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  38.16 
 
 
264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  35.44 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  35.31 
 
 
255 aa  196  5.000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  36.33 
 
 
262 aa  194  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  38.44 
 
 
268 aa  192  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  37.89 
 
 
253 aa  191  9e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  36.84 
 
 
254 aa  190  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  36.36 
 
 
252 aa  189  4e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  36.11 
 
 
252 aa  189  4e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  36.4 
 
 
257 aa  189  5e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  37.5 
 
 
252 aa  186  4e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  37.2 
 
 
255 aa  185  7e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  39.93 
 
 
257 aa  185  7e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  34.72 
 
 
256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  40.62 
 
 
257 aa  183  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.4 
 
 
237 aa  183  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  37.24 
 
 
257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  34.6 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  34.26 
 
 
255 aa  182  8.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  33.33 
 
 
254 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  33.68 
 
 
251 aa  181  1e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  34.6 
 
 
259 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  38.68 
 
 
259 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  33.92 
 
 
252 aa  181  2e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  40.59 
 
 
261 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  34.26 
 
 
259 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0140  putative exodeoxyribonuclease III protein  37.11 
 
 
261 aa  178  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  36.71 
 
 
336 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  35 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  32.75 
 
 
249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  31.93 
 
 
249 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  38.27 
 
 
259 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  33.92 
 
 
258 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  32.26 
 
 
254 aa  171  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2299  exodeoxyribonuclease III  34.84 
 
 
256 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2379  exodeoxyribonuclease III  34.84 
 
 
256 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124522  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0167  exodeoxyribonuclease III  34.84 
 
 
256 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.580227  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0371  exodeoxyribonuclease III  34.84 
 
 
256 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0175  exodeoxyribonuclease III  34.84 
 
 
256 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2780  exodeoxyribonuclease III  34.84 
 
 
256 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0186  exodeoxyribonuclease III  34.84 
 
 
256 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  34.04 
 
 
248 aa  171  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  33.33 
 
 
254 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0036  exodeoxyribonuclease III Xth  35.54 
 
 
261 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  31.94 
 
 
257 aa  169  5e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  31.93 
 
 
249 aa  169  5e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0042  exodeoxyribonuclease III Xth  35.54 
 
 
261 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.169682 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  34.6 
 
 
256 aa  169  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  32.4 
 
 
254 aa  168  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  33.8 
 
 
257 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  33.91 
 
 
250 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3043  exodeoxyribonuclease III Xth  34.15 
 
 
257 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3160  exodeoxyribonuclease III Xth  34.15 
 
 
257 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485064  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  31.79 
 
 
253 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2491  exodeoxyribonuclease III (xth)  33.8 
 
 
257 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3121  exodeoxyribonuclease III Xth  33.8 
 
 
257 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3105  exodeoxyribonuclease III Xth  33.8 
 
 
257 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2415  exodeoxyribonuclease III Xth  37.75 
 
 
270 aa  166  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0151  exodeoxyribonuclease III  33.8 
 
 
256 aa  165  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  30.71 
 
 
254 aa  165  8e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  39.92 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1725  exodeoxyribonuclease III Xth  39 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.569641  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0070  exodeoxyribonuclease III Xth  38.58 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  32.52 
 
 
258 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0403  exodeoxyribonuclease III  34.64 
 
 
259 aa  162  6e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.16 
 
 
259 aa  162  7e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 
251 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0350  exodeoxyribonuclease III Xth  29.55 
 
 
269 aa  161  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0362795  normal  0.625114 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  33.93 
 
 
251 aa  161  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1784  exodeoxyribonuclease III  37.77 
 
 
259 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  35.11 
 
 
257 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2008  exodeoxyribonuclease III Xth  38.17 
 
 
260 aa  161  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  31.12 
 
 
254 aa  160  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  33.45 
 
 
252 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  35.54 
 
 
253 aa  159  5e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  38 
 
 
254 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  35.94 
 
 
256 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  33.45 
 
 
252 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  37.15 
 
 
252 aa  156  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  32.74 
 
 
252 aa  156  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0057  exodeoxyribonuclease III Xth  34.26 
 
 
259 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  39.5 
 
 
260 aa  155  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  33.1 
 
 
252 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  33.1 
 
 
252 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  33.1 
 
 
252 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  30.77 
 
 
250 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  32.74 
 
 
252 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  31.85 
 
 
259 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4050  exodeoxyribonuclease III Xth  38.68 
 
 
262 aa  152  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121179 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  32.74 
 
 
252 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  30.77 
 
 
250 aa  152  8e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  31.63 
 
 
259 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  35.63 
 
 
260 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  35.63 
 
 
260 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>