More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0582 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 274 aa  566  1e-161  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.88161  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1508  3'-exo-deoxyribonuclease  68.5 
 
 		 275 aa  389  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000904963  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0034  exonuclease III  65.2 
 
 		 275 aa  377  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1563  exodeoxyribonuclease  65.69 
 
 		 275 aa  373  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1090  exodeoxyribonuclease III Xth  64.47 
 
 		 275 aa  362  3e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406253  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0841  exonuclease III  57.3 
 
 		 285 aa  311  5.999999999999999e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.193898  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1528  exonuclease III  56.41 
 
 		 272 aa  310  1e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1659  exonuclease III  51.09 
 
 		 273 aa  276  2e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0110  exodeoxyribonuclease III Xth  46.72 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0939885 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  42.34 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  41.58 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  43.12 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  43.12 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  43.16 
 
 		 262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  41.24 
 
 		 250 aa  199  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  41.97 
 
 		 251 aa  198  7e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  40.15 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  39.49 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  40.51 
 
 		 251 aa  191  9e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  40.21 
 
 		 252 aa  191  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  36.69 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  38.79 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  37.72 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  37.72 
 
 		 252 aa  188  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  38.43 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  38.43 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  38.43 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  38.08 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  37.64 
 
 		 249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1689  exonuclease III  39.42 
 
 		 268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000145715  hitchhiker  0.000000000000014729 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  37.78 
 
 		 249 aa  183  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  38.52 
 
 		 249 aa  183  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  40.58 
 
 		 253 aa  181  9.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  40 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  37.01 
 
 		 252 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  38.46 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1311  exodeoxyribonuclease III Xth  38.24 
 
 		 253 aa  176  5e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  36.1 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  36.82 
 
 		 257 aa  158  9e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  34.66 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  34.91 
 
 		 252 aa  149  6e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  35.87 
 
 		 255 aa  149  6e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  33.82 
 
 		 252 aa  149  6e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  33.09 
 
 		 254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  33.93 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_5808  predicted protein  36.3 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000562371  normal  0.329515 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  32.85 
 
 		 254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  31.94 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  32.61 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  33.21 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  33.57 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  32.85 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  34.67 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  33.09 
 
 		 251 aa  142  7e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  32.97 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.09 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  33.7 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  32.85 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  31.75 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  32.61 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.68 
 
 		 237 aa  139  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  30.29 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5639  predicted protein  34.75 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.149213  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  32 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  32.73 
 
 		 256 aa  132  6.999999999999999e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  29.2 
 
 		 254 aa  132  9e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  31.64 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  31.47 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  29.82 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47361  predicted protein  29.66 
 
 		 489 aa  130  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  30.91 
 
 		 254 aa  125  5e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  31.91 
 
 		 251 aa  126  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  30.91 
 
 		 254 aa  125  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1739  exodeoxyribonuclease III Xth  33.21 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  29.2 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  31.05 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  29.75 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  29.75 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  30.55 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  28.83 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2415  exodeoxyribonuclease III Xth  31.39 
 
 		 270 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2513  exodeoxyribonuclease III Xth  32.97 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120216  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0461  exodeoxyribonuclease III (xth)  31.7 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0161  exodeoxyribonuclease III Xth  29.6 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.011362  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  28.99 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  28.99 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6423  exodeoxyribonuclease III Xth  35.76 
 
 		 301 aa  104  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0157  exodeoxyribonuclease III Xth  29.2 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00989742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0460  exodeoxyribonuclease III Xth  30.77 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0431  exodeoxyribonuclease III  30.4 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0459  exodeoxyribonuclease III Xth  31.39 
 
 		 265 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0350  exodeoxyribonuclease III Xth  29.62 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0362795  normal  0.625114 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4139  exodeoxyribonuclease III Xth  27.8 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000428819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  26.04 
 
 		 259 aa  98.6  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0146  exodeoxyribonuclease III Xth  28.73 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00325986  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0113  AP endonuclease  27.9 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  27.78 
 
 		 281 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  28.17 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  29.68 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3225  exodeoxyribonuclease III Xth  27.1 
 
 		 265 aa  96.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  hitchhiker  0.00000209509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>