More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0350 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0350  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 269 aa  557  1e-158  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0362795  normal  0.625114 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2415  exodeoxyribonuclease III Xth  44.91 
 
 		 270 aa  238  5.999999999999999e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.22 
 
 		 258 aa  215  8e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  40.3 
 
 		 257 aa  188  8e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  37.07 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  35.23 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  35.23 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  37.74 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  39.33 
 
 		 255 aa  186  5e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  36.98 
 
 		 255 aa  185  8e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  39.71 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  36.84 
 
 		 254 aa  181  8.000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.1 
 
 		 237 aa  181  9.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  38.35 
 
 		 251 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  36.23 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  38.49 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  36.36 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  38.4 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  36.47 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  37.97 
 
 		 253 aa  175  9e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  36.3 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  38.02 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  37.87 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  37.22 
 
 		 251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  37.08 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  36.19 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  35.45 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  35.45 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  35.45 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  35.53 
 
 		 264 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  35.07 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  38.95 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  35.21 
 
 		 254 aa  171  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  35.58 
 
 		 252 aa  171  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  33.58 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  34.72 
 
 		 251 aa  168  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  35.09 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  35.07 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  35.29 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  35.34 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  35.02 
 
 		 268 aa  166  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  35.02 
 
 		 262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  35.07 
 
 		 252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  35.21 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  35.34 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  39.25 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  35.45 
 
 		 252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  33.96 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  33.46 
 
 		 249 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6423  exodeoxyribonuclease III Xth  29.55 
 
 		 301 aa  161  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  31.46 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  36.33 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  34.57 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  34.46 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  32.96 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  34.46 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0110  exodeoxyribonuclease III Xth  34.91 
 
 		 259 aa  159  7e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0939885 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  33.21 
 
 		 254 aa  158  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1689  exonuclease III  32.96 
 
 		 268 aa  158  9e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000145715  hitchhiker  0.000000000000014729 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  35.32 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  33.21 
 
 		 249 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  35.34 
 
 		 248 aa  155  6e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  34.72 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  31.3 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  32.24 
 
 		 285 aa  152  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  33.21 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  32.58 
 
 		 256 aa  153  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  32.45 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  32.45 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1311  exodeoxyribonuclease III Xth  34.22 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  32.09 
 
 		 253 aa  149  6e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  31.46 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  30.68 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0146  exodeoxyribonuclease III Xth  35.19 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00325986  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  30.08 
 
 		 260 aa  145  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3043  exodeoxyribonuclease III Xth  30.68 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3160  exodeoxyribonuclease III Xth  30.68 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485064  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  30.3 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2379  exodeoxyribonuclease III  30.68 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124522  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0167  exodeoxyribonuclease III  30.68 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.580227  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2780  exodeoxyribonuclease III  30.68 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0371  exodeoxyribonuclease III  30.68 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0175  exodeoxyribonuclease III  30.68 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2299  exodeoxyribonuclease III  30.68 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87728  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0186  exodeoxyribonuclease III  30.68 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0151  exodeoxyribonuclease III  30.68 
 
 		 256 aa  143  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  30.98 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3121  exodeoxyribonuclease III Xth  30.57 
 
 		 257 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0403  exodeoxyribonuclease III  31.06 
 
 		 259 aa  141  9e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2491  exodeoxyribonuclease III (xth)  30.57 
 
 		 257 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3105  exodeoxyribonuclease III Xth  30.57 
 
 		 257 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  31.13 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  31.7 
 
 		 258 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  30.23 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3225  exodeoxyribonuclease III Xth  29.74 
 
 		 265 aa  139  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  hitchhiker  0.00000209509 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1784  exodeoxyribonuclease III  30.68 
 
 		 259 aa  139  7e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  29.17 
 
 		 259 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2513  exodeoxyribonuclease III Xth  33.46 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120216  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  28.79 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>