More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0161 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0161  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 256 aa  523  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.011362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0157  exodeoxyribonuclease III Xth  65.89 
 
 		 258 aa  361  6e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00989742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2513  exodeoxyribonuclease III Xth  58.73 
 
 		 256 aa  326  3e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120216  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0146  exodeoxyribonuclease III Xth  61.9 
 
 		 258 aa  326  3e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00325986  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0113  AP endonuclease  55.95 
 
 		 267 aa  308  4e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4139  exodeoxyribonuclease III Xth  37.7 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000428819 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0459  exodeoxyribonuclease III Xth  37.5 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0460  exodeoxyribonuclease III Xth  37.5 
 
 		 264 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0431  exodeoxyribonuclease III  37.01 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  37.65 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.71 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  36.86 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  37.11 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  36.15 
 
 		 260 aa  156  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  36.72 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  36.86 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  36.47 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  37.5 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  35.43 
 
 		 252 aa  151  8e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  34.9 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  35.57 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  33.99 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  34.36 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  35.04 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  34.12 
 
 		 252 aa  148  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  34.25 
 
 		 255 aa  148  9e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  34.51 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  34.51 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  34.51 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  34.51 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  34.12 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  35.43 
 
 		 259 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  34.12 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  34.88 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  34.9 
 
 		 252 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  35.66 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  34.12 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  34.66 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  35.18 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  34.25 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  34.78 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  33.46 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  33.86 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  34.5 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  34.5 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  34.24 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  34.25 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  34.78 
 
 		 249 aa  141  9e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.13 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  34.25 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  32.42 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3378  exodeoxyribonuclease III Xth  34.48 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  33.99 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  33.33 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  33.07 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5537  exodeoxyribonuclease III Xth  33.96 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  35.41 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  32.33 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  33.2 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  33.98 
 
 		 251 aa  139  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  34.24 
 
 		 254 aa  138  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  32.81 
 
 		 256 aa  138  7.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  35.25 
 
 		 259 aa  138  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  35.43 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  31.82 
 
 		 260 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0921  exodeoxyribonuclease III  31.15 
 
 		 261 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  35 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09930  putative exonuclease III  31.54 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0994533  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  37.01 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  32.57 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  29.81 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  33.6 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  32.71 
 
 		 282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  32.95 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  31.34 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  31.34 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  34.51 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0057  exodeoxyribonuclease III Xth  33.85 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02430  exodeoxyribonuclease III  33.09 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.977241  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  33.2 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  32.94 
 
 		 250 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  33.86 
 
 		 259 aa  135  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  33.73 
 
 		 260 aa  135  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  33.98 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4050  exodeoxyribonuclease III Xth  35.91 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121179 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  32.41 
 
 		 251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3068  exodeoxyribonuclease III Xth  34.5 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2415  exodeoxyribonuclease III Xth  34.65 
 
 		 270 aa  132  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  32.68 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.16 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  31.46 
 
 		 281 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3423  exodeoxyribonuclease III  34.88 
 
 		 255 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2085  exonuclease III  33.96 
 
 		 268 aa  131  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40103  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1976  exonuclease III  33.96 
 
 		 268 aa  131  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000370761  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0350  exodeoxyribonuclease III Xth  32.84 
 
 		 269 aa  131  7.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0362795  normal  0.625114 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2340  exonuclease III  33.96 
 
 		 268 aa  131  7.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000518305  normal  0.0191888 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  32.59 
 
 		 268 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  32.42 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  34.62 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>