More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0034 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0034  exonuclease III  100 
 
 		 275 aa  575  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1090  exodeoxyribonuclease III Xth  66.91 
 
 		 275 aa  394  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406253  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1563  exodeoxyribonuclease  66.91 
 
 		 275 aa  392  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1508  3'-exo-deoxyribonuclease  65.45 
 
 		 275 aa  389  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000904963  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  65.2 
 
 		 274 aa  377  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.88161  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0841  exonuclease III  59.22 
 
 		 285 aa  348  4e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.193898  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1528  exonuclease III  57.25 
 
 		 272 aa  320  1.9999999999999998e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1659  exonuclease III  52.9 
 
 		 273 aa  286  2e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0110  exodeoxyribonuclease III Xth  45.45 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0939885 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  41.76 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  43.01 
 
 		 251 aa  215  8e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  41.46 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  42.12 
 
 		 251 aa  210  3e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  40.22 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  41.76 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  39.64 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  41.24 
 
 		 250 aa  206  4e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  40.43 
 
 		 252 aa  205  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  41.54 
 
 		 250 aa  205  7e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  39.64 
 
 		 252 aa  204  9e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  41.91 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  38.55 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  39.71 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  38.55 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  38.55 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  38.55 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  38.55 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  35.92 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1689  exonuclease III  40.36 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000145715  hitchhiker  0.000000000000014729 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  40.36 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  40.29 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  39.85 
 
 		 249 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1311  exodeoxyribonuclease III Xth  37.68 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  40.15 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  40 
 
 		 249 aa  189  4e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  38.77 
 
 		 248 aa  180  2.9999999999999997e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  38.18 
 
 		 253 aa  180  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  37.09 
 
 		 255 aa  175  8e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  35.64 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  35.51 
 
 		 252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  33.82 
 
 		 254 aa  165  8e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  35.61 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  36.23 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  32.25 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  33.45 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  36.23 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  35.77 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  31.72 
 
 		 268 aa  152  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  33.7 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_5808  predicted protein  35.79 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000562371  normal  0.329515 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  32.85 
 
 		 252 aa  152  7e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  34.55 
 
 		 253 aa  151  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.55 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  32.49 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  32.61 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  32.61 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  32.61 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  35.38 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  33.1 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  34.53 
 
 		 247 aa  145  6e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  32.13 
 
 		 336 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  32.37 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  31.99 
 
 		 256 aa  142  8e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  32.85 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47361  predicted protein  30.49 
 
 		 489 aa  140  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  32.85 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  31.75 
 
 		 254 aa  139  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.73 
 
 		 237 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  32.82 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  29.35 
 
 		 259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  32.73 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  31.43 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  31.65 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  29.71 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5639  predicted protein  34.16 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.149213  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  32.12 
 
 		 264 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  29.28 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  29.93 
 
 		 260 aa  123  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  29.93 
 
 		 260 aa  123  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0948  exodeoxyribonuclease III Xth  29.93 
 
 		 272 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.875165  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  29.35 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  29.35 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2415  exodeoxyribonuclease III Xth  30.18 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  29.71 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1739  exodeoxyribonuclease III Xth  32.1 
 
 		 237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0350  exodeoxyribonuclease III Xth  32.87 
 
 		 269 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0362795  normal  0.625114 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  27.54 
 
 		 260 aa  116  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.16 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0233  exodeoxyribonuclease III Xth  29.3 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  29.56 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0227  exodeoxyribonuclease III Xth  29.3 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  27.74 
 
 		 259 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  28.16 
 
 		 257 aa  112  9e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  28.73 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0277  exodeoxyribonuclease III Xth  27.94 
 
 		 267 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273673  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  27.34 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6423  exodeoxyribonuclease III Xth  28.67 
 
 		 301 aa  108  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1556  exodeoxyribonuclease III Xth  28.52 
 
 		 270 aa  109  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0431  exodeoxyribonuclease III  27.7 
 
 		 262 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0070  exodeoxyribonuclease III Xth  29.7 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>