More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_5639 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009357  OSTLU_5639  predicted protein  100 
 
 
269 aa  552  1e-156  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.149213  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_5808  predicted protein  45 
 
 
273 aa  202  5e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000562371  normal  0.329515 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  42.26 
 
 
252 aa  182  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47361  predicted protein  35.29 
 
 
489 aa  180  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  40.68 
 
 
252 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  41.89 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  41.89 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  41.89 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  41.51 
 
 
252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  40.75 
 
 
252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  38.58 
 
 
250 aa  172  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  40 
 
 
250 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  40.75 
 
 
252 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  39.55 
 
 
250 aa  168  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  39.02 
 
 
251 aa  168  8e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  39.18 
 
 
250 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  37.31 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  37.69 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0110  exodeoxyribonuclease III Xth  38.01 
 
 
259 aa  161  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0939885 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  37.31 
 
 
251 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  34.7 
 
 
249 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  34.83 
 
 
249 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  34.83 
 
 
249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  38.2 
 
 
253 aa  152  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  34.08 
 
 
257 aa  152  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  38.15 
 
 
252 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  36.67 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  33.99 
 
 
285 aa  144  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  37.64 
 
 
253 aa  142  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  35.19 
 
 
247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1528  exonuclease III  36.8 
 
 
272 aa  139  7e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  36.06 
 
 
257 aa  138  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  35 
 
 
262 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  34.75 
 
 
274 aa  136  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.88161  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1090  exodeoxyribonuclease III Xth  36.72 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406253  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1689  exonuclease III  32.34 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000145715  hitchhiker  0.000000000000014729 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  34.2 
 
 
248 aa  130  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0034  exonuclease III  34.16 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  32.22 
 
 
257 aa  128  8.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  33.08 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0841  exonuclease III  35.64 
 
 
285 aa  124  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.193898  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.21 
 
 
258 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1311  exodeoxyribonuclease III Xth  38.24 
 
 
253 aa  124  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1659  exonuclease III  35.77 
 
 
273 aa  124  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1508  3'-exo-deoxyribonuclease  32.74 
 
 
275 aa  123  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000904963  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  32.37 
 
 
255 aa  122  6e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  32.86 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  31.23 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  32.48 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  33.7 
 
 
336 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  31.97 
 
 
256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1563  exodeoxyribonuclease  31.49 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  33.71 
 
 
259 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  31 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  32.48 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  32.71 
 
 
257 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1739  exodeoxyribonuclease III Xth  30.26 
 
 
237 aa  108  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  31.37 
 
 
262 aa  109  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  31 
 
 
252 aa  108  6e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  30.43 
 
 
255 aa  107  2e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.85 
 
 
237 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  30.37 
 
 
251 aa  103  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  31.87 
 
 
252 aa  102  5e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  32.85 
 
 
252 aa  101  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  29.52 
 
 
254 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  29.85 
 
 
253 aa  99  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  31.52 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  29.92 
 
 
254 aa  98.2  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  32.09 
 
 
254 aa  97.8  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  31.52 
 
 
259 aa  96.7  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  31.52 
 
 
259 aa  97.1  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  30.29 
 
 
264 aa  95.5  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  29.89 
 
 
256 aa  95.5  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5009  exodeoxyribonuclease III Xth  30 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2415  exodeoxyribonuclease III Xth  27.11 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  30.34 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  30.34 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  27.92 
 
 
281 aa  92.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  32.35 
 
 
254 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  30.08 
 
 
260 aa  92  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0227  exodeoxyribonuclease III Xth  29.5 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  27.5 
 
 
262 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  27.5 
 
 
262 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  28.83 
 
 
267 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0233  exodeoxyribonuclease III Xth  29.14 
 
 
267 aa  89.4  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  30.45 
 
 
259 aa  89  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  30.08 
 
 
259 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0057  exodeoxyribonuclease III Xth  29.85 
 
 
259 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  29.82 
 
 
254 aa  86.3  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3929  exodeoxyribonuclease III  27.68 
 
 
263 aa  85.9  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0151  exodeoxyribonuclease III  31.34 
 
 
256 aa  85.9  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3424  exodeoxyribonuclease III  29.78 
 
 
272 aa  85.9  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.903718  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  29.43 
 
 
257 aa  85.5  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0350  exodeoxyribonuclease III Xth  28.16 
 
 
269 aa  85.5  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0362795  normal  0.625114 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  28.57 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6423  exodeoxyribonuclease III Xth  27.84 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  27.02 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3225  exodeoxyribonuclease III Xth  27.68 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  hitchhiker  0.00000209509 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0186  exodeoxyribonuclease III  29.48 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>