More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0841 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0841  exonuclease III  100 
 
 		 285 aa  589  1e-167  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.193898  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1090  exodeoxyribonuclease III Xth  64.54 
 
 		 275 aa  369  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406253  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1508  3'-exo-deoxyribonuclease  62.41 
 
 		 275 aa  355  5e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000904963  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0034  exonuclease III  59.22 
 
 		 275 aa  348  4e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1563  exodeoxyribonuclease  60.28 
 
 		 275 aa  348  5e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  57.3 
 
 		 274 aa  311  5.999999999999999e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.88161  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1528  exonuclease III  55.12 
 
 		 272 aa  300  2e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1659  exonuclease III  51.06 
 
 		 273 aa  279  3e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0110  exodeoxyribonuclease III Xth  42.76 
 
 		 259 aa  206  4e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0939885 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  43.06 
 
 		 250 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  42.35 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  41.37 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  40.93 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  40.86 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  39.93 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  39.57 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  41.2 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  38.71 
 
 		 252 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  38.71 
 
 		 252 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  38.71 
 
 		 252 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  38.71 
 
 		 252 aa  188  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  40.43 
 
 		 252 aa  188  9e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  39.93 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  38.93 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  39.64 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  39.93 
 
 		 262 aa  185  8e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  39.15 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  40.85 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  39.29 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  36.71 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  38.6 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1689  exonuclease III  37.94 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000145715  hitchhiker  0.000000000000014729 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  38.25 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  36.27 
 
 		 249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  37.89 
 
 		 253 aa  168  9e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  36.36 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1311  exodeoxyribonuclease III Xth  36.69 
 
 		 253 aa  159  5e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  37.46 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  35.92 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  33.1 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  35.82 
 
 		 247 aa  145  6e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  34.27 
 
 		 255 aa  145  9e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  34.84 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  31.67 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  33.1 
 
 		 252 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.87 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  34.05 
 
 		 254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.5 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  31.82 
 
 		 259 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  31.79 
 
 		 268 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  31.34 
 
 		 336 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  29.82 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  35.23 
 
 		 251 aa  129  6e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  31.97 
 
 		 262 aa  129  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  31.94 
 
 		 255 aa  129  7.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  31.69 
 
 		 252 aa  129  8.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  32.5 
 
 		 254 aa  128  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  32.51 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  30.85 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  32.63 
 
 		 252 aa  126  5e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  31.45 
 
 		 251 aa  125  8.000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5639  predicted protein  35.64 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.149213  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  32.4 
 
 		 264 aa  122  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  30.39 
 
 		 252 aa  122  8e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  32.49 
 
 		 256 aa  122  9e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  29.79 
 
 		 254 aa  122  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  32.86 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  29.93 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  32.58 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  31.56 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  31.45 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_5808  predicted protein  33.68 
 
 		 273 aa  119  6e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000562371  normal  0.329515 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  29.58 
 
 		 259 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  30.63 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1739  exodeoxyribonuclease III Xth  31.88 
 
 		 237 aa  116  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  28.52 
 
 		 259 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47361  predicted protein  28.44 
 
 		 489 aa  113  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0227  exodeoxyribonuclease III Xth  28.77 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0233  exodeoxyribonuclease III Xth  28.77 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  29.17 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  29.67 
 
 		 258 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  29.96 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  29.96 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  29.12 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  29.92 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3225  exodeoxyribonuclease III Xth  28.47 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  hitchhiker  0.00000209509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6475  exodeoxyribonuclease III Xth  31.37 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  28.38 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  28.57 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  28.57 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0070  exodeoxyribonuclease III Xth  29.67 
 
 		 257 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0057  exodeoxyribonuclease III Xth  28.68 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  30.25 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  26.01 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0277  exodeoxyribonuclease III Xth  26.03 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273673  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0403  exodeoxyribonuclease III  29.48 
 
 		 259 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1784  exodeoxyribonuclease III  29.48 
 
 		 259 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0948  exodeoxyribonuclease III Xth  28.72 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.875165  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0461  exodeoxyribonuclease III (xth)  32.44 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>