125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1075 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1075  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 159 aa  327  4e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1647  Rhodanese domain protein  52.38 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.018195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0757  rhodanese domain-containing protein  27.83 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187458  normal  0.496229 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  30.56 
 
 		 136 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  27.78 
 
 		 113 aa  50.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0538  rhodanese domain-containing protein  27.12 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0624  Rhodanese domain protein  30.48 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  26.85 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  27.1 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2446  rhodanese-like protein  30.19 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000105937  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 		 323 aa  47.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4501  hypothetical protein  43.75 
 
 		 184 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.57 
 
 		 389 aa  47.4  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2851  rhodanese domain-containing protein  28.3 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131553  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  34.91 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3752  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.11 
 
 		 551 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 		 459 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  29.73 
 
 		 277 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  28.8 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  28.8 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  28.7 
 
 		 476 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  33.71 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  27.73 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5788  rhodanese domain-containing protein  27.59 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00528237 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.65 
 
 		 388 aa  45.1  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  29.25 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  33.96 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  25.19 
 
 		 361 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  34.72 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  28.09 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  28.67 
 
 		 137 aa  44.7  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.12 
 
 		 380 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02424  putative glutaredoxin-like protein, putative  46.34 
 
 		 308 aa  44.7  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  30 
 
 		 107 aa  44.3  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  26.42 
 
 		 170 aa  44.3  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  26.09 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4172  rhodanese domain-containing protein  27.87 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170844 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 		 271 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2942  rhodanese-like protein  28.46 
 
 		 369 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  27.07 
 
 		 480 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  28.19 
 
 		 130 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  30.84 
 
 		 279 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  28.46 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  28.97 
 
 		 107 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2577  Rhodanese domain protein  52.5 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000018103  decreased coverage  0.0000278243 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  39.66 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  51.22 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  27.64 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  29.01 
 
 		 128 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  43.24 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  26.09 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  26.72 
 
 		 280 aa  42.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  29.29 
 
 		 113 aa  42.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  48.57 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  23.58 
 
 		 131 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  45 
 
 		 113 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  28.74 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2763  Rhodanese domain protein  30 
 
 		 105 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2167  rhodanese domain-containing protein  29.63 
 
 		 152 aa  42  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.548621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  26.8 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  42.5 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.28 
 
 		 387 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  29.58 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  44.68 
 
 		 103 aa  42  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  25.89 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  25.89 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  24.19 
 
 		 140 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  43.48 
 
 		 254 aa  41.6  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  42.22 
 
 		 124 aa  41.6  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0605  Rhodanese domain protein  28.44 
 
 		 110 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415478  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  26.17 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 130 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  26.73 
 
 		 144 aa  41.2  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  43.24 
 
 		 107 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  43.24 
 
 		 107 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  31.48 
 
 		 479 aa  41.2  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  43.24 
 
 		 107 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  43.24 
 
 		 107 aa  41.2  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  43.24 
 
 		 107 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0646  Rhodanese domain protein  29.73 
 
 		 110 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.126659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3370  glutaredoxin-like protein  39.02 
 
 		 308 aa  41.2  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.616165 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  27.27 
 
 		 126 aa  41.2  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  37.25 
 
 		 377 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  43.24 
 
 		 107 aa  41.2  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  27.82 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4199  rhodanese-like protein  34.38 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  43.24 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4265  rhodanese domain-containing protein  34.38 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  43.24 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4426  rhodanese domain-containing protein  34.38 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.338924  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  28.97 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  39.06 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  43.24 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00932  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  45.45 
 
 		 379 aa  41.2  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06090  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  45.45 
 
 		 379 aa  41.2  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0487  Rhodanese domain protein  47.22 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>