44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2942 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2942  rhodanese-like protein  100 
 
 
369 aa  715    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3284  beta-lactamase domain-containing protein  47.71 
 
 
369 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4110  Rhodanese domain protein  39.6 
 
 
370 aa  69.7  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4261  beta-lactamase domain protein  35 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4293  beta-lactamase domain protein  34.29 
 
 
376 aa  56.2  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  33.98 
 
 
375 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  23.66 
 
 
378 aa  53.1  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1375  beta-lactamase domain protein  34.86 
 
 
390 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3631  beta-lactamase domain protein  33.02 
 
 
374 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.162031  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0257  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 
397 aa  50.8  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3165  beta-lactamase domain protein  38 
 
 
421 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2422  beta-lactamase domain protein  29.75 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2641  beta-lactamase domain protein  31.37 
 
 
379 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0938  metallo-beta-lactamase family protein  24.16 
 
 
376 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  27.72 
 
 
123 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 
113 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  30.3 
 
 
113 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4316  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 
397 aa  46.2  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558515  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3386  beta-lactamase domain protein  25.69 
 
 
428 aa  46.6  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  32.65 
 
 
124 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3034  beta-lactamase domain protein  21.63 
 
 
382 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
104 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0687  beta-lactamase domain-containing protein  31.48 
 
 
378 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.596111  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0775  Rhodanese domain protein  36.63 
 
 
124 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1187  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 
393 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0871  metallo-beta-lactamase family protein  33.72 
 
 
376 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000195083 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
470 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0777  metallo-beta-lactamase family protein  31.48 
 
 
376 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1282  rhodanese-like protein  50 
 
 
397 aa  44.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0687  metallo-beta-lactamase family protein  31.48 
 
 
376 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.879597  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0739  metallo-beta-lactamase family protein  31.48 
 
 
376 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000119995  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  33.9 
 
 
472 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1977  Rhodanese domain protein  28.18 
 
 
138 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.474064  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  31.63 
 
 
124 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  29.25 
 
 
159 aa  43.9  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1075  rhodanese domain-containing protein  28.46 
 
 
159 aa  43.5  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0816  beta-lactamase domain-containing protein  28.85 
 
 
393 aa  43.5  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0867  metallo-beta-lactamase family protein  23.71 
 
 
376 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  30.39 
 
 
137 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1429  Rhodanese domain protein  29.25 
 
 
401 aa  43.1  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0673  metallo-beta-lactamase family protein  33.72 
 
 
376 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00215478  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  33.67 
 
 
476 aa  42.7  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  29.29 
 
 
141 aa  42.7  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  29.29 
 
 
141 aa  42.7  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>