58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1977 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1977  Rhodanese domain protein  100 
 
 
138 aa  280  5.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.474064  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2963  Rhodanese domain protein  44.78 
 
 
140 aa  130  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1262  rhodanese domain protein  45.52 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2518  hypothetical protein  48.7 
 
 
140 aa  120  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.956557  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3866  Rhodanese domain protein  31.86 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.138224  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  36.52 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1131  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00783742  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  29.81 
 
 
189 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  32.17 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  26.92 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  26.92 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  26.92 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  26.92 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  26.92 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  31.19 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  26.92 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  30.37 
 
 
133 aa  47.8  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  28.85 
 
 
198 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  30.25 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  27.87 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1590  Rhodanese domain protein  28.81 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  32.98 
 
 
101 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0308  rhodanese-like protein  23.08 
 
 
245 aa  44.3  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  25 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  31.91 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2942  rhodanese-like protein  28.18 
 
 
369 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  27.91 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 
101 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  24.24 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  24.24 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  24.24 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  24.24 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  24.24 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  24.24 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  28.95 
 
 
230 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  24.24 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  24.64 
 
 
130 aa  42.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  25.47 
 
 
194 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  25.47 
 
 
199 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3581  Rhodanese domain protein  27.1 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  25.25 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1797  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  29.25 
 
 
397 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.171411 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1652  Rhodanese domain protein  23.58 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  26.13 
 
 
711 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  29.25 
 
 
273 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  24.53 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  27.19 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1429  Rhodanese domain protein  28.28 
 
 
401 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  23.85 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  26.42 
 
 
189 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  30.97 
 
 
276 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  23.58 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  24.32 
 
 
711 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  31.78 
 
 
130 aa  40  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  27.18 
 
 
218 aa  40  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>