160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0308 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0308  rhodanese-like protein  100 
 
 
245 aa  495  1e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0562  Rhodanese domain protein  23.11 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  27.89 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  28.33 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1180  thiosulfate sulfurtransferase  27.67 
 
 
319 aa  64.3  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384238  normal  0.0141759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  22.13 
 
 
284 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4079  rhodanese-like protein  28.57 
 
 
321 aa  62  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.361854 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  25.48 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  22.53 
 
 
284 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  26.83 
 
 
291 aa  59.7  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  21.34 
 
 
284 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  24 
 
 
290 aa  59.3  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2110  Rhodanese domain protein  25.52 
 
 
324 aa  58.5  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  24.32 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0500  rhodanese domain-containing protein  23.08 
 
 
313 aa  57.4  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.346469  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  23.81 
 
 
273 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2858  Rhodanese domain protein  24.22 
 
 
305 aa  55.8  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0764  Rhodanese domain protein  24.71 
 
 
281 aa  55.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.99 
 
 
281 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1422  rhodanese domain-containing protein  28.89 
 
 
320 aa  53.9  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  30.7 
 
 
145 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  31.25 
 
 
320 aa  53.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  22.52 
 
 
291 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  24.07 
 
 
284 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  25 
 
 
321 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  25 
 
 
321 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  24.31 
 
 
285 aa  52.4  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.77 
 
 
281 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.77 
 
 
281 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  25.77 
 
 
281 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  25.77 
 
 
281 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.77 
 
 
281 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.77 
 
 
281 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1426  Rhodanese domain protein  28.4 
 
 
276 aa  52  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.630889  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  23.12 
 
 
285 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  28.7 
 
 
289 aa  51.2  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2047  rhodanese-like protein  25.38 
 
 
294 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000810205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4123  Rhodanese domain protein  25 
 
 
422 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.355195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  24.16 
 
 
284 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  25.29 
 
 
273 aa  50.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  26.55 
 
 
144 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  23.5 
 
 
279 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.95 
 
 
285 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1183  rhodanese-like protein  22.78 
 
 
286 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1466  Rhodanese domain protein  24.03 
 
 
282 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394652  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0100  rhodanese domain-containing protein  24.16 
 
 
286 aa  49.7  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.602678  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  25.32 
 
 
284 aa  49.7  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  22.98 
 
 
285 aa  49.3  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1774  rhodanese domain-containing protein  17.65 
 
 
315 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.608218 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1071  rhodanese domain-containing protein  23.87 
 
 
231 aa  49.3  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.148351  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2672  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.15 
 
 
281 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1047  Rhodanese domain protein  24.41 
 
 
289 aa  49.3  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2896  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.15 
 
 
281 aa  48.9  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1564  rhodanese domain-containing protein  26.79 
 
 
296 aa  48.9  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  25.17 
 
 
271 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  26.47 
 
 
290 aa  47.8  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0854  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.28 
 
 
289 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  22.88 
 
 
282 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  22.22 
 
 
277 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  22.99 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  22.42 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  25.32 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  25.56 
 
 
288 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2561  rhodanese domain-containing protein  20.83 
 
 
324 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.918662  normal  0.131407 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  22.99 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  22.89 
 
 
279 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2904  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.95 
 
 
280 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.823076  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2738  rhodanese-related sulfurtransferase  17.34 
 
 
315 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.848314  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0306  rhodanese-like protein  26.11 
 
 
293 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2791  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.95 
 
 
280 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2728  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.95 
 
 
280 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2772  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.95 
 
 
280 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  24.2 
 
 
286 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1615  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  24.8 
 
 
285 aa  46.2  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  20.74 
 
 
479 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  20.73 
 
 
276 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1396  rhodanese domain-containing protein  17.34 
 
 
315 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260045  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  23.08 
 
 
282 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  23.73 
 
 
282 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2873  Rhodanese domain protein  28.95 
 
 
327 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  20.09 
 
 
289 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  20.09 
 
 
289 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  20.09 
 
 
289 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  20.09 
 
 
289 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  20.09 
 
 
289 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  20.09 
 
 
289 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  20.09 
 
 
289 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2685  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.47 
 
 
280 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362659  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4532  rhodanese-like protein  23.73 
 
 
298 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2054  Rhodanese domain protein  23.48 
 
 
317 aa  45.8  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0105049  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1650  rhodanese domain-containing protein  23.48 
 
 
317 aa  45.8  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.368491  normal  0.100041 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1131  rhodanese domain-containing protein  29.27 
 
 
146 aa  45.8  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00783742  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1708  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.39 
 
 
276 aa  45.8  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  23.12 
 
 
277 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5900  rhodanese domain-containing protein  28.42 
 
 
303 aa  45.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0688028  normal  0.469982 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2614  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 
287 aa  45.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.155894 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  22.61 
 
 
277 aa  45.4  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  22.61 
 
 
277 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  20.31 
 
 
288 aa  45.4  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  20.25 
 
 
297 aa  45.4  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>