More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1938 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1938  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
237 aa  475  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00021369  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0858  F0F1 ATP synthase subunit A  47.66 
 
 
238 aa  202  4e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  42.86 
 
 
235 aa  196  3e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0659  F0F1-type ATP synthase, subunit a  41.53 
 
 
241 aa  179  4e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.320134  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0461  ATP synthase F0, A subunit  43.48 
 
 
235 aa  176  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000814456  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1875  F0F1-type ATP synthase, subunit a  39.15 
 
 
241 aa  171  7.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.257614  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3309  F0F1 ATP synthase subunit A  44.5 
 
 
236 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000902841  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3831  F0F1 ATP synthase subunit A  38.86 
 
 
239 aa  168  9e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000137067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2183  F0F1 ATP synthase subunit A  40.17 
 
 
242 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.22629  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2145  F0F1 ATP synthase subunit A  40.17 
 
 
242 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.186735  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  39.65 
 
 
237 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5161  F0F1 ATP synthase subunit A  37.99 
 
 
239 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4994  F0F1 ATP synthase subunit A  37.99 
 
 
239 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000342727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5553  F0F1 ATP synthase subunit A  37.99 
 
 
239 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000158416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5402  F0F1 ATP synthase subunit A  37.99 
 
 
239 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.39849e-58 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5011  F0F1 ATP synthase subunit A  38.43 
 
 
239 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5433  F0F1 ATP synthase subunit A  37.55 
 
 
239 aa  158  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5436  F0F1 ATP synthase subunit A  37.55 
 
 
239 aa  158  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0528964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5489  F0F1 ATP synthase subunit A  37.55 
 
 
239 aa  158  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5518  F0F1 ATP synthase subunit A  37.55 
 
 
239 aa  158  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000410336  hitchhiker  3.2870800000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5109  F0F1 ATP synthase subunit A  37.12 
 
 
239 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00506372  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1715  F0F1 ATP synthase subunit A  35.93 
 
 
242 aa  141  9e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1244  F0F1-type ATP synthase, subunit a  48.72 
 
 
154 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000114749  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2763  ATP synthase F0, A subunit  35.18 
 
 
254 aa  122  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  33.18 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  30.3 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  30.67 
 
 
218 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  33.9 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  27.34 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4334  F0F1 ATP synthase subunit A  30.86 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442286  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  33.8 
 
 
271 aa  96.7  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  32.91 
 
 
265 aa  96.3  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2312  F0F1 ATP synthase subunit A  29.63 
 
 
259 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  29.25 
 
 
262 aa  96.3  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  32.47 
 
 
227 aa  96.3  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  32.42 
 
 
235 aa  95.5  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  31.03 
 
 
251 aa  94.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  28.33 
 
 
232 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  29.61 
 
 
241 aa  91.7  9e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  29.36 
 
 
241 aa  90.9  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3209  ATP synthase F0, A subunit  31.75 
 
 
249 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116746  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2813  ATP synthase F0, A subunit  31.75 
 
 
249 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0159651  normal  0.290047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  28.88 
 
 
231 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  28.63 
 
 
230 aa  90.5  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  30 
 
 
194 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  28.7 
 
 
232 aa  89.4  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0197  ATP synthase F0, A subunit  30.04 
 
 
301 aa  88.6  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000520668  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0296  F0F1 ATP synthase subunit A  33.18 
 
 
280 aa  87.8  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11331  F0F1 ATP synthase subunit A  34.39 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  29.68 
 
 
234 aa  86.3  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  30.34 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  32.22 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3742  ATP synthase F0, A subunit  32.88 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  31.53 
 
 
216 aa  84  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  28.57 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1175  F0F1 ATP synthase subunit A  26.97 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.108763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1279  F0F1 ATP synthase subunit A  26.97 
 
 
280 aa  84  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0786025  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2331  ATP synthase F0, A subunit  30.99 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000417448  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  28.9 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5301  F0F1 ATP synthase subunit A  31.03 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3956  F0F1 ATP synthase subunit A  31.65 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0660881 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3882  F0F1 ATP synthase subunit A  31.65 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3868  F0F1 ATP synthase subunit A  31.65 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal  0.0791726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  31.94 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  26.75 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5437  F0F1 ATP synthase subunit A  31.19 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5206  F0F1 ATP synthase subunit A  31.19 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.391657  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5419  F0F1 ATP synthase subunit A  30.6 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171484 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  29.51 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0518  ATP synthase F0, A subunit  27.78 
 
 
324 aa  82  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  30.8 
 
 
281 aa  81.6  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  29.06 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3080  F0F1 ATP synthase subunit A  33.18 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00958832  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  29.44 
 
 
228 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  29.48 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  29.09 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  30.7 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  26.82 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  30 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  28.7 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  30 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  26.7 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  30 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2171  F0F1 ATP synthase subunit A  29.2 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000816174  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  29.52 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  31.67 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5605  ATP synthase F0, A subunit  30.17 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  30.33 
 
 
224 aa  79  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  31.67 
 
 
282 aa  79  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  28.51 
 
 
249 aa  79  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  27.16 
 
 
295 aa  79  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  30.92 
 
 
248 aa  78.6  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  28.94 
 
 
241 aa  79  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  27.92 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  27.92 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  28.51 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  29.91 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  29.57 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  28.51 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1915  ATP synthase F0, A subunit  36.31 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>