More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0331 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
261 aa  520  1e-147  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  75.1 
 
 
249 aa  372  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  77.73 
 
 
251 aa  358  4e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  77.73 
 
 
251 aa  358  4e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  76.05 
 
 
252 aa  357  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2616  F0F1 ATP synthase subunit A  82.61 
 
 
251 aa  357  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68842  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  78.93 
 
 
253 aa  357  9.999999999999999e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  77.68 
 
 
241 aa  355  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  75.31 
 
 
257 aa  353  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  73.71 
 
 
241 aa  348  4e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18541  F0F1 ATP synthase subunit A  76.5 
 
 
241 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0228025  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0986  F0F1 ATP synthase subunit A  76.5 
 
 
241 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  76.52 
 
 
241 aa  342  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  76.52 
 
 
241 aa  342  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15751  F0F1 ATP synthase subunit A  75.64 
 
 
241 aa  341  7e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  76.09 
 
 
241 aa  341  8e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  71.55 
 
 
241 aa  340  1e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16351  F0F1 ATP synthase subunit A  79.14 
 
 
188 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  39.81 
 
 
227 aa  143  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  35.98 
 
 
245 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  38.46 
 
 
229 aa  142  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  38.94 
 
 
229 aa  142  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  38.39 
 
 
225 aa  135  7.000000000000001e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  38.46 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  37.28 
 
 
234 aa  133  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  36.82 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  37.5 
 
 
229 aa  131  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  34.76 
 
 
235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  37.02 
 
 
229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  33.78 
 
 
246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  37.5 
 
 
217 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  36.32 
 
 
232 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  38.46 
 
 
229 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  36.54 
 
 
218 aa  128  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  39.18 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  36.21 
 
 
243 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  35.65 
 
 
251 aa  125  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  38.94 
 
 
234 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  37.69 
 
 
194 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  33.64 
 
 
207 aa  124  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  34.95 
 
 
226 aa  122  5e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  32.61 
 
 
251 aa  122  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  36.06 
 
 
229 aa  122  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  36.12 
 
 
223 aa  122  8e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  34.95 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  34.95 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  35.24 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  36.65 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  35.41 
 
 
232 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  33.48 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  31.7 
 
 
284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  35.58 
 
 
233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  32.74 
 
 
236 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  37.78 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  35.27 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  32.61 
 
 
231 aa  116  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  36.1 
 
 
216 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  35.58 
 
 
233 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  36.84 
 
 
232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  32 
 
 
234 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  32.44 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  36.07 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  33.18 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0467  F0F1 ATP synthase subunit A  33.61 
 
 
233 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.104154 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0197  ATP synthase F0, A subunit  32.31 
 
 
301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000520668  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  31.98 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  34.62 
 
 
230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  32.47 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  33.97 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  34.8 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  31.06 
 
 
257 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0892  F0F1 ATP synthase subunit A  32.89 
 
 
223 aa  110  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.546785  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0461  ATP synthase F0, A subunit  33.05 
 
 
235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000814456  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  37.63 
 
 
228 aa  109  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
271 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_497  ATP synthase F0, A subunit  31.38 
 
 
314 aa  105  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221508  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  33.49 
 
 
227 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0558  ATP synthase F0, A subunit  31.38 
 
 
314 aa  105  7e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000487089  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3742  ATP synthase F0, A subunit  31.75 
 
 
247 aa  105  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  33.49 
 
 
227 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0296  F0F1 ATP synthase subunit A  31.56 
 
 
280 aa  105  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0532  ATP synthase F0, A subunit  31.51 
 
 
314 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000978517  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0659  F0F1-type ATP synthase, subunit a  33.48 
 
 
241 aa  103  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.320134  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  35.48 
 
 
229 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0991  ATP synthase F0, A subunit  32.95 
 
 
308 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.773987  normal  0.702007 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  32.7 
 
 
228 aa  102  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2993  F0F1 ATP synthase subunit A  30.6 
 
 
239 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3831  F0F1 ATP synthase subunit A  32.87 
 
 
239 aa  102  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000137067  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  31.98 
 
 
224 aa  100  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  29.86 
 
 
224 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11331  F0F1 ATP synthase subunit A  32.27 
 
 
250 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0858  F0F1 ATP synthase subunit A  31.65 
 
 
238 aa  100  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  31.25 
 
 
237 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0518  ATP synthase F0, A subunit  29.12 
 
 
324 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5433  F0F1 ATP synthase subunit A  32.42 
 
 
239 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  33.49 
 
 
271 aa  99.4  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
228 aa  99  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  32.34 
 
 
235 aa  99.4  6e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5161  F0F1 ATP synthase subunit A  31.96 
 
 
239 aa  99  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>