More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4248 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 
229 aa  448  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  83.84 
 
 
229 aa  394  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  82.97 
 
 
229 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  83.84 
 
 
229 aa  387  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  84.28 
 
 
229 aa  388  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  82.1 
 
 
229 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  82.1 
 
 
229 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  78.26 
 
 
230 aa  357  8e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  55.7 
 
 
234 aa  261  8.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  56.47 
 
 
229 aa  251  6e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  54.39 
 
 
234 aa  248  5e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  53.14 
 
 
239 aa  234  8e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  53.47 
 
 
234 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  46.51 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  45.02 
 
 
233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  47.5 
 
 
233 aa  192  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  45.54 
 
 
226 aa  184  7e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  45.54 
 
 
226 aa  184  7e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  45.05 
 
 
226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  52.48 
 
 
226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000656805  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  47.21 
 
 
234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  43.56 
 
 
226 aa  177  1e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  40.61 
 
 
207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  41.26 
 
 
225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  39.52 
 
 
227 aa  159  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  39.11 
 
 
226 aa  158  8e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  41 
 
 
225 aa  156  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  42.33 
 
 
224 aa  155  6e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0723  F0F1 ATP synthase subunit A  42.36 
 
 
228 aa  152  5e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  42.44 
 
 
218 aa  149  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4472  ATP synthase F0, A subunit  47.73 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1299  ATP synthase F0, A subunit  41.01 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  39.52 
 
 
227 aa  138  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  40.58 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  38.12 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  35.5 
 
 
216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  35.64 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  35.65 
 
 
232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  33.99 
 
 
251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  34.88 
 
 
227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  34.88 
 
 
227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  35.86 
 
 
230 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  34.85 
 
 
194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  33.66 
 
 
228 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  35.29 
 
 
230 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  34.76 
 
 
241 aa  123  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  34.76 
 
 
241 aa  123  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  32.02 
 
 
231 aa  122  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  32.2 
 
 
236 aa  122  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  36.45 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  36.45 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  31.34 
 
 
228 aa  119  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  35.1 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  34.86 
 
 
271 aa  119  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  33.5 
 
 
231 aa  118  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  36.63 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  33.66 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  34.85 
 
 
239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  32 
 
 
231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  31.55 
 
 
243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  36.45 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  34 
 
 
229 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  32.71 
 
 
232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  32.86 
 
 
241 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  32.86 
 
 
241 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  34.67 
 
 
248 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  36.06 
 
 
261 aa  112  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  32.46 
 
 
248 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  31.84 
 
 
246 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  30.28 
 
 
257 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  33.18 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  37.11 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  32.38 
 
 
241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  32.86 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3102  F0F1 ATP synthase subunit A  31.55 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00224256  normal  0.218622 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  33.49 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  32.79 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  32.47 
 
 
241 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  33.49 
 
 
282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  32.88 
 
 
249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  37.14 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  34.68 
 
 
250 aa  108  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  41.06 
 
 
220 aa  108  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0892  F0F1 ATP synthase subunit A  31.71 
 
 
223 aa  108  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.546785  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  33.82 
 
 
251 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  31.67 
 
 
258 aa  108  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2993  F0F1 ATP synthase subunit A  32.29 
 
 
239 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  35.92 
 
 
253 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0467  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
233 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.104154 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  31.45 
 
 
247 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  32.72 
 
 
251 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0558  ATP synthase F0, A subunit  32.77 
 
 
314 aa  105  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000487089  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  33.47 
 
 
260 aa  105  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  31.67 
 
 
284 aa  105  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  32.08 
 
 
243 aa  105  8e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_497  ATP synthase F0, A subunit  32.34 
 
 
314 aa  105  8e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  30.52 
 
 
235 aa  104  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  35.29 
 
 
249 aa  105  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0986  F0F1 ATP synthase subunit A  34.29 
 
 
241 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18541  F0F1 ATP synthase subunit A  34.29 
 
 
241 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0228025  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>