More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1605 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 
239 aa  471  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  59 
 
 
229 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  52.72 
 
 
229 aa  241  9e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  52.3 
 
 
229 aa  240  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  53.14 
 
 
230 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  53.94 
 
 
229 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  53.53 
 
 
229 aa  239  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  51.65 
 
 
229 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  50.63 
 
 
234 aa  229  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  52.07 
 
 
229 aa  228  7e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  51.67 
 
 
229 aa  226  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  49.79 
 
 
234 aa  221  8e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  50.21 
 
 
234 aa  219  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  49.79 
 
 
233 aa  217  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  47.28 
 
 
233 aa  207  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  52.94 
 
 
233 aa  205  5e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  47.26 
 
 
226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000656805  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  43.78 
 
 
234 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  43.27 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  42.66 
 
 
226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  42.66 
 
 
226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  41.06 
 
 
207 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  42.86 
 
 
226 aa  159  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  41.87 
 
 
226 aa  157  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  37.5 
 
 
226 aa  150  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  38.46 
 
 
218 aa  145  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  39.07 
 
 
225 aa  144  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  41.62 
 
 
224 aa  143  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  39.22 
 
 
227 aa  142  5e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  39.44 
 
 
227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  35.96 
 
 
232 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  38.79 
 
 
227 aa  128  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  38.32 
 
 
227 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4472  ATP synthase F0, A subunit  39.61 
 
 
258 aa  126  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  40.48 
 
 
217 aa  125  7e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1299  ATP synthase F0, A subunit  43.26 
 
 
245 aa  122  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  35.94 
 
 
230 aa  121  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  34.33 
 
 
231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  34.58 
 
 
216 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0723  F0F1 ATP synthase subunit A  39.13 
 
 
228 aa  116  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  34.65 
 
 
228 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  35.78 
 
 
230 aa  115  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  34.98 
 
 
241 aa  115  7.999999999999999e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  34.98 
 
 
241 aa  115  8.999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  33.19 
 
 
284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  46.62 
 
 
220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  35.02 
 
 
232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  36.49 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  36.18 
 
 
241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  36.18 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  37.91 
 
 
241 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  32.23 
 
 
232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  32.86 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2993  F0F1 ATP synthase subunit A  34.5 
 
 
239 aa  108  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  30.84 
 
 
236 aa  108  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  31.63 
 
 
217 aa  108  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  35.61 
 
 
239 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  31.49 
 
 
194 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  32.02 
 
 
224 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  34.31 
 
 
223 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  31.88 
 
 
229 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3102  F0F1 ATP synthase subunit A  34.26 
 
 
229 aa  106  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00224256  normal  0.218622 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  37.13 
 
 
251 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  37.13 
 
 
251 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18541  F0F1 ATP synthase subunit A  35.78 
 
 
241 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0228025  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0986  F0F1 ATP synthase subunit A  35.78 
 
 
241 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  31.71 
 
 
228 aa  105  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  33.02 
 
 
271 aa  105  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  42.07 
 
 
228 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  32.85 
 
 
231 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15751  F0F1 ATP synthase subunit A  36.97 
 
 
241 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  36.63 
 
 
252 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  31.92 
 
 
246 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16351  F0F1 ATP synthase subunit A  36.27 
 
 
188 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  30.97 
 
 
251 aa  102  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  35.44 
 
 
237 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  35.29 
 
 
261 aa  101  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  35.41 
 
 
249 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  32.14 
 
 
231 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  32.24 
 
 
243 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  37.31 
 
 
268 aa  99.8  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  32.37 
 
 
246 aa  99  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  30.71 
 
 
364 aa  97.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  26.42 
 
 
251 aa  95.9  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  30.4 
 
 
251 aa  95.5  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0892  F0F1 ATP synthase subunit A  31.02 
 
 
223 aa  95.1  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.546785  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  34.13 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0467  F0F1 ATP synthase subunit A  32.2 
 
 
233 aa  94.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.104154 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  26.19 
 
 
235 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  32.21 
 
 
262 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3831  F0F1 ATP synthase subunit A  35.05 
 
 
239 aa  94  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000137067  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
251 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  31.63 
 
 
243 aa  92.8  4e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0423  F0F1 ATP synthase subunit A  31.6 
 
 
233 aa  92.8  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
251 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  35.75 
 
 
253 aa  92.4  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0296  F0F1 ATP synthase subunit A  30.36 
 
 
280 aa  91.7  9e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  32.85 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  30.65 
 
 
271 aa  90.9  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>