More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0483 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
241 aa  475  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  96.68 
 
 
241 aa  462  1e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  80.5 
 
 
241 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0986  F0F1 ATP synthase subunit A  78.42 
 
 
241 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15751  F0F1 ATP synthase subunit A  78.42 
 
 
241 aa  364  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  80.17 
 
 
241 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  80.17 
 
 
241 aa  364  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18541  F0F1 ATP synthase subunit A  78.42 
 
 
241 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0228025  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  80.17 
 
 
241 aa  363  1e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  73.71 
 
 
261 aa  321  7e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2616  F0F1 ATP synthase subunit A  74.03 
 
 
251 aa  315  5e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68842  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  68.53 
 
 
249 aa  310  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  69.6 
 
 
251 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  69.6 
 
 
251 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  68.72 
 
 
252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  70.56 
 
 
253 aa  303  2.0000000000000002e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  66.38 
 
 
257 aa  301  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16351  F0F1 ATP synthase subunit A  82.45 
 
 
188 aa  298  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  35.15 
 
 
245 aa  139  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  38.57 
 
 
229 aa  135  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  38.1 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  36.99 
 
 
234 aa  128  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  35.81 
 
 
227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  37.05 
 
 
230 aa  126  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  36.11 
 
 
234 aa  126  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  36.67 
 
 
229 aa  124  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  34.25 
 
 
218 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  35.1 
 
 
232 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  37.95 
 
 
229 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  35 
 
 
246 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  34.98 
 
 
231 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  37.44 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  35.27 
 
 
232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  34.45 
 
 
232 aa  118  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  31.86 
 
 
236 aa  115  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  34.76 
 
 
229 aa  115  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  35.64 
 
 
226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  37.57 
 
 
207 aa  115  7.999999999999999e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  33.8 
 
 
251 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  34.98 
 
 
239 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  35.27 
 
 
239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  36.97 
 
 
220 aa  113  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0197  ATP synthase F0, A subunit  32.66 
 
 
301 aa  113  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000520668  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  35.64 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  35.64 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  32.08 
 
 
225 aa  112  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  32.74 
 
 
231 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  34.84 
 
 
231 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  34.29 
 
 
233 aa  111  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  31.25 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  33.81 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  35.71 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  33.81 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  35.75 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  38.67 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  38.83 
 
 
194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  38 
 
 
216 aa  109  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  32.7 
 
 
235 aa  108  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  31.65 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  32.3 
 
 
243 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  34.98 
 
 
231 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  33.98 
 
 
234 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0467  F0F1 ATP synthase subunit A  35.09 
 
 
233 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.104154 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  33.18 
 
 
246 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  33.64 
 
 
226 aa  106  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2993  F0F1 ATP synthase subunit A  34.6 
 
 
239 aa  105  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  33 
 
 
226 aa  105  5e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  33.49 
 
 
230 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  31.55 
 
 
217 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  28.93 
 
 
284 aa  102  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  32.43 
 
 
224 aa  102  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0858  F0F1 ATP synthase subunit A  31.6 
 
 
238 aa  102  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  31.82 
 
 
225 aa  102  7e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  32.86 
 
 
233 aa  102  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  35.27 
 
 
228 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  32.74 
 
 
251 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  32.74 
 
 
251 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  31.6 
 
 
229 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  30.29 
 
 
235 aa  100  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  32.64 
 
 
271 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  31.47 
 
 
262 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3831  F0F1 ATP synthase subunit A  32.72 
 
 
239 aa  99  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000137067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5161  F0F1 ATP synthase subunit A  31.16 
 
 
239 aa  98.2  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4994  F0F1 ATP synthase subunit A  31.16 
 
 
239 aa  98.2  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000342727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5553  F0F1 ATP synthase subunit A  31.16 
 
 
239 aa  98.2  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000158416  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  34.78 
 
 
229 aa  98.6  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5402  F0F1 ATP synthase subunit A  31.16 
 
 
239 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.39849e-58 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5433  F0F1 ATP synthase subunit A  31.8 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  32.43 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  32.29 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  31.28 
 
 
228 aa  98.2  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5436  F0F1 ATP synthase subunit A  31.8 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0528964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5011  F0F1 ATP synthase subunit A  31.8 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5489  F0F1 ATP synthase subunit A  31.8 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5518  F0F1 ATP synthase subunit A  31.8 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000410336  hitchhiker  3.2870800000000003e-19 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0461  ATP synthase F0, A subunit  32.76 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000814456  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0892  F0F1 ATP synthase subunit A  34.08 
 
 
223 aa  96.7  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.546785  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  31.34 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0296  F0F1 ATP synthase subunit A  33.83 
 
 
280 aa  95.9  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  30.52 
 
 
227 aa  95.1  8e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>