More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0331 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
295 aa  585  1e-166  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0296  F0F1 ATP synthase subunit A  57.24 
 
 
280 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1175  F0F1 ATP synthase subunit A  52.9 
 
 
280 aa  276  4e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.108763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1279  F0F1 ATP synthase subunit A  52.56 
 
 
280 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0786025  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0751  F0F1 ATP synthase subunit A  45.99 
 
 
272 aa  245  6e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.146612  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  40.89 
 
 
216 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  37.5 
 
 
224 aa  151  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  35.43 
 
 
235 aa  122  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3831  F0F1 ATP synthase subunit A  34.56 
 
 
239 aa  119  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000137067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5011  F0F1 ATP synthase subunit A  35.48 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110706  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5436  F0F1 ATP synthase subunit A  35.48 
 
 
239 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0528964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5518  F0F1 ATP synthase subunit A  35.48 
 
 
239 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000410336  hitchhiker  3.2870800000000003e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5489  F0F1 ATP synthase subunit A  35.48 
 
 
239 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5161  F0F1 ATP synthase subunit A  35.94 
 
 
239 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4994  F0F1 ATP synthase subunit A  35.94 
 
 
239 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000342727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5402  F0F1 ATP synthase subunit A  35.94 
 
 
239 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.39849e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5553  F0F1 ATP synthase subunit A  35.94 
 
 
239 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000158416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5433  F0F1 ATP synthase subunit A  35.02 
 
 
239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  32.47 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5109  F0F1 ATP synthase subunit A  35.48 
 
 
239 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00506372  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  34.29 
 
 
218 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  33.78 
 
 
237 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  33.74 
 
 
257 aa  109  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3309  F0F1 ATP synthase subunit A  33.47 
 
 
236 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000902841  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  31.95 
 
 
246 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  30.21 
 
 
284 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  29.54 
 
 
262 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0197  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 
301 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000520668  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  30.43 
 
 
251 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  31 
 
 
234 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  31 
 
 
271 aa  100  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2750  F0F1 ATP synthase subunit A  31.89 
 
 
267 aa  100  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000190697  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  30.43 
 
 
251 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4334  F0F1 ATP synthase subunit A  32.9 
 
 
256 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442286  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2312  F0F1 ATP synthase subunit A  32.9 
 
 
259 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  32.43 
 
 
241 aa  98.2  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  30.13 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  29.91 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  33.19 
 
 
229 aa  97.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  31.2 
 
 
249 aa  96.3  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  32.89 
 
 
217 aa  95.5  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  30 
 
 
235 aa  94.7  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2145  F0F1 ATP synthase subunit A  28.28 
 
 
242 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.186735  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2183  F0F1 ATP synthase subunit A  28.28 
 
 
242 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.22629  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  32 
 
 
241 aa  93.6  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  26.41 
 
 
251 aa  94  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  32.49 
 
 
271 aa  93.2  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1915  ATP synthase F0, A subunit  34.62 
 
 
251 aa  93.2  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  28.57 
 
 
230 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3868  F0F1 ATP synthase subunit A  31.23 
 
 
251 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal  0.0791726 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0304  F0F1 ATP synthase subunit A  30.04 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000278138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3956  F0F1 ATP synthase subunit A  31.23 
 
 
251 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0660881 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3882  F0F1 ATP synthase subunit A  31.23 
 
 
251 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  30.9 
 
 
253 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  33.9 
 
 
231 aa  90.9  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11331  F0F1 ATP synthase subunit A  32.88 
 
 
250 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0461  ATP synthase F0, A subunit  29.17 
 
 
235 aa  90.1  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000814456  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  28.99 
 
 
252 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0659  F0F1-type ATP synthase, subunit a  30.13 
 
 
241 aa  89.4  7e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.320134  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  31.31 
 
 
229 aa  89  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0858  F0F1 ATP synthase subunit A  28.51 
 
 
238 aa  88.6  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  34.36 
 
 
223 aa  89  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  30.84 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  28.38 
 
 
239 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3102  F0F1 ATP synthase subunit A  37.07 
 
 
229 aa  87.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00224256  normal  0.218622 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2616  F0F1 ATP synthase subunit A  28.76 
 
 
251 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68842  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  28.41 
 
 
234 aa  87  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  28.21 
 
 
261 aa  86.7  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  29.05 
 
 
234 aa  86.7  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  35.34 
 
 
231 aa  86.3  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  28.97 
 
 
230 aa  85.5  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2331  ATP synthase F0, A subunit  31.91 
 
 
273 aa  85.5  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000417448  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  28.21 
 
 
241 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  28.18 
 
 
226 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3742  ATP synthase F0, A subunit  35.06 
 
 
247 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  26.92 
 
 
257 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  28.21 
 
 
241 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  28.18 
 
 
226 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3065  F0F1 ATP synthase subunit A  28.42 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  30.84 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  27.57 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  28.21 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  27.8 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  29.07 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  29.52 
 
 
229 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4468  F0F1 ATP synthase subunit A  29.76 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000195299  hitchhiker  0.00000000198513 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  34.75 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  30.09 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  31.31 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15751  F0F1 ATP synthase subunit A  29.49 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  28.51 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  28.04 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1715  F0F1 ATP synthase subunit A  29.86 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2171  F0F1 ATP synthase subunit A  31.2 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000816174  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04089  F0F1 ATP synthase subunit A  31.6 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0056302  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0986  F0F1 ATP synthase subunit A  28.63 
 
 
241 aa  82  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  31.05 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1875  F0F1-type ATP synthase, subunit a  28.57 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.257614  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18541  F0F1 ATP synthase subunit A  28.63 
 
 
241 aa  82  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0228025  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  33.62 
 
 
236 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>