More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1436 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  100 
 
 		 194 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  54.21 
 
 		 230 aa  212  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  54.74 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  55.56 
 
 		 232 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  56.25 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  55.32 
 
 		 231 aa  205  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  50.5 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  54.26 
 
 		 227 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  53.72 
 
 		 227 aa  193  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  55.29 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0423  F0F1 ATP synthase subunit A  56.47 
 
 		 233 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2790  F0F1 ATP synthase subunit A  56.47 
 
 		 233 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0127  F0F1 ATP synthase subunit A  56.47 
 
 		 233 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1294  F0F1 ATP synthase subunit A  56.47 
 
 		 233 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.322594  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0151  F0F1 ATP synthase subunit A  56.47 
 
 		 233 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.158772  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1052  F0F1 ATP synthase subunit A  56.47 
 
 		 233 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2648  F0F1 ATP synthase subunit A  56.47 
 
 		 233 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  48.95 
 
 		 231 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  46.84 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  44.74 
 
 		 231 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  45.56 
 
 		 228 aa  159  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  44.79 
 
 		 251 aa  158  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  45.55 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  44.69 
 
 		 246 aa  155  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  46.67 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3102  F0F1 ATP synthase subunit A  50.91 
 
 		 229 aa  151  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00224256  normal  0.218622 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0892  F0F1 ATP synthase subunit A  46.45 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.546785  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  42.16 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  44.39 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  43.24 
 
 		 243 aa  145  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0467  F0F1 ATP synthase subunit A  47.8 
 
 		 233 aa  145  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.104154 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2993  F0F1 ATP synthase subunit A  43.09 
 
 		 239 aa  142  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  41.27 
 
 		 239 aa  142  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  37.85 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  38.62 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  35.45 
 
 		 229 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  39.36 
 
 		 217 aa  127  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  34.21 
 
 		 229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  35.36 
 
 		 230 aa  125  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  35.83 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  35.35 
 
 		 227 aa  124  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  35.42 
 
 		 234 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  34.81 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  35.59 
 
 		 229 aa  122  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  35.59 
 
 		 229 aa  122  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  39.39 
 
 		 249 aa  122  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  35.08 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  34.25 
 
 		 229 aa  121  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  35.45 
 
 		 226 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  36.67 
 
 		 234 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  40 
 
 		 220 aa  117  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  35.36 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  33.68 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  34.76 
 
 		 225 aa  112  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  38.04 
 
 		 252 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  35.38 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  38.83 
 
 		 241 aa  111  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  34.04 
 
 		 224 aa  110  9e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  34.57 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  36.41 
 
 		 251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  38.83 
 
 		 241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  36.41 
 
 		 251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  34.57 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  31.38 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  32.22 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  32.31 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  38.42 
 
 		 241 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0858  F0F1 ATP synthase subunit A  32.14 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  31.49 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  38.54 
 
 		 241 aa  108  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  34.38 
 
 		 233 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  39.2 
 
 		 257 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  37.93 
 
 		 241 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  37.93 
 
 		 241 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  33.5 
 
 		 235 aa  105  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  31.51 
 
 		 261 aa  104  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  31.11 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  37.69 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1299  ATP synthase F0, A subunit  34.66 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0723  F0F1 ATP synthase subunit A  34.78 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  33.51 
 
 		 233 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16351  F0F1 ATP synthase subunit A  39.13 
 
 		 188 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  34.81 
 
 		 233 aa  101  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  30.48 
 
 		 284 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2616  F0F1 ATP synthase subunit A  40.11 
 
 		 251 aa  99.8  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  33.67 
 
 		 237 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  32 
 
 		 246 aa  99  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0296  F0F1 ATP synthase subunit A  31.19 
 
 		 280 aa  97.4  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2145  F0F1 ATP synthase subunit A  31.25 
 
 		 242 aa  97.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.186735  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  30.33 
 
 		 251 aa  97.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2183  F0F1 ATP synthase subunit A  31.25 
 
 		 242 aa  97.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.22629  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  32.29 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  37.23 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3831  F0F1 ATP synthase subunit A  31.66 
 
 		 239 aa  95.9  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000137067  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  32 
 
 		 271 aa  95.9  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15751  F0F1 ATP synthase subunit A  38.02 
 
 		 241 aa  95.5  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3309  F0F1 ATP synthase subunit A  33.5 
 
 		 236 aa  95.5  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000902841  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0986  F0F1 ATP synthase subunit A  38.02 
 
 		 241 aa  94.7  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18541  F0F1 ATP synthase subunit A  38.02 
 
 		 241 aa  94.7  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0228025  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>