More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3309 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3309  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
236 aa  473  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000902841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  73.42 
 
 
237 aa  359  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3831  F0F1 ATP synthase subunit A  67.92 
 
 
239 aa  332  4e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000137067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5433  F0F1 ATP synthase subunit A  66.67 
 
 
239 aa  317  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5161  F0F1 ATP synthase subunit A  66.67 
 
 
239 aa  315  3e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4994  F0F1 ATP synthase subunit A  66.67 
 
 
239 aa  315  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000342727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5553  F0F1 ATP synthase subunit A  66.67 
 
 
239 aa  315  3e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000158416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5402  F0F1 ATP synthase subunit A  66.67 
 
 
239 aa  315  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.39849e-58 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5436  F0F1 ATP synthase subunit A  66.25 
 
 
239 aa  315  5e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0528964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5489  F0F1 ATP synthase subunit A  66.25 
 
 
239 aa  315  5e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5518  F0F1 ATP synthase subunit A  66.25 
 
 
239 aa  315  5e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000410336  hitchhiker  3.2870800000000003e-19 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5011  F0F1 ATP synthase subunit A  66.25 
 
 
239 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5109  F0F1 ATP synthase subunit A  65.83 
 
 
239 aa  313  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00506372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2183  F0F1 ATP synthase subunit A  57.85 
 
 
242 aa  284  8e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.22629  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2145  F0F1 ATP synthase subunit A  57.85 
 
 
242 aa  284  8e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.186735  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1715  F0F1 ATP synthase subunit A  58.68 
 
 
242 aa  263  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0461  ATP synthase F0, A subunit  42.55 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000814456  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1938  F0F1 ATP synthase subunit A  43.1 
 
 
237 aa  181  9.000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00021369  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1875  F0F1-type ATP synthase, subunit a  39.67 
 
 
241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.257614  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0659  F0F1-type ATP synthase, subunit a  39.74 
 
 
241 aa  173  2.9999999999999996e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.320134  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0858  F0F1 ATP synthase subunit A  37.5 
 
 
238 aa  154  8e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  34.78 
 
 
235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1244  F0F1-type ATP synthase, subunit a  47.4 
 
 
154 aa  145  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000114749  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  36.8 
 
 
245 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  38.33 
 
 
246 aa  141  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  35.81 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  32.43 
 
 
224 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  35.17 
 
 
257 aa  119  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  33.47 
 
 
295 aa  111  8.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  32.63 
 
 
271 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0296  F0F1 ATP synthase subunit A  33.81 
 
 
280 aa  104  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1175  F0F1 ATP synthase subunit A  31.62 
 
 
280 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.108763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1279  F0F1 ATP synthase subunit A  31.62 
 
 
280 aa  103  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0786025  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2312  F0F1 ATP synthase subunit A  33.47 
 
 
259 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2763  ATP synthase F0, A subunit  32.78 
 
 
254 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4334  F0F1 ATP synthase subunit A  33.47 
 
 
256 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442286  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  35.68 
 
 
217 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  33.5 
 
 
194 aa  99.4  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  33.49 
 
 
226 aa  99  6e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  33.49 
 
 
226 aa  99  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2803  F0F1 ATP synthase subunit A  32.63 
 
 
280 aa  98.6  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00368483  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  31.72 
 
 
227 aa  98.6  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  32.05 
 
 
284 aa  98.2  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0197  ATP synthase F0, A subunit  31.69 
 
 
301 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000520668  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  31.28 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  33.65 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  28.57 
 
 
231 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0751  F0F1 ATP synthase subunit A  29.44 
 
 
272 aa  96.7  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.146612  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6362  F0F1 ATP synthase subunit A  33.47 
 
 
289 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  34 
 
 
218 aa  96.3  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73310  F0F1 ATP synthase subunit A  33.47 
 
 
289 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.529883  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  32.56 
 
 
226 aa  95.9  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  32.08 
 
 
241 aa  95.5  6e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2168  F0F1 ATP synthase subunit A  32.13 
 
 
218 aa  95.5  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  32.89 
 
 
216 aa  95.5  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3742  ATP synthase F0, A subunit  33.02 
 
 
247 aa  95.5  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  32.21 
 
 
234 aa  95.1  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5437  F0F1 ATP synthase subunit A  31.91 
 
 
289 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5206  F0F1 ATP synthase subunit A  31.91 
 
 
289 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.391657  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  32.39 
 
 
229 aa  95.1  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  31.46 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  30.9 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5605  ATP synthase F0, A subunit  31.49 
 
 
289 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  31.6 
 
 
241 aa  94  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5419  F0F1 ATP synthase subunit A  31.49 
 
 
289 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5301  F0F1 ATP synthase subunit A  31.49 
 
 
289 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  32.35 
 
 
251 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  32.35 
 
 
251 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2331  ATP synthase F0, A subunit  33.05 
 
 
273 aa  92  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000417448  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  30.29 
 
 
234 aa  91.7  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3868  F0F1 ATP synthase subunit A  32.92 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal  0.0791726 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4108  F0F1 ATP synthase subunit A  32.22 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  8.0507200000000005e-19  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3956  F0F1 ATP synthase subunit A  32.92 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0660881 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3080  F0F1 ATP synthase subunit A  37.32 
 
 
267 aa  90.9  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00958832  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3882  F0F1 ATP synthase subunit A  32.92 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  31.13 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2458  F0F1 ATP synthase subunit A  32.16 
 
 
224 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  30.57 
 
 
226 aa  90.9  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11331  F0F1 ATP synthase subunit A  32.79 
 
 
250 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2813  ATP synthase F0, A subunit  31.95 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0159651  normal  0.290047 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3209  ATP synthase F0, A subunit  31.95 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  34.15 
 
 
239 aa  90.9  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2171  F0F1 ATP synthase subunit A  32.67 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000816174  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  29.95 
 
 
231 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3311  F0F1 ATP synthase subunit A  32.92 
 
 
257 aa  89.4  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.374489  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2750  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
267 aa  89.4  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000190697  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5127  F0F1 ATP synthase subunit A  30.64 
 
 
289 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00619657  normal  0.911189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5736  F0F1 ATP synthase subunit A  30.64 
 
 
289 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000306084  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  31.37 
 
 
252 aa  88.2  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  27.1 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  32.18 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  27.12 
 
 
235 aa  88.2  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  29.67 
 
 
229 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2616  F0F1 ATP synthase subunit A  30.1 
 
 
251 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68842  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  29.67 
 
 
229 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  30.24 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0304  F0F1 ATP synthase subunit A  34.3 
 
 
268 aa  87  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000278138  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4876  F0F1 ATP synthase subunit A  31.33 
 
 
289 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>