More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2458 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2458  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 		 224 aa  448  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2168  F0F1 ATP synthase subunit A  88.99 
 
 		 218 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  40 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  33.63 
 
 		 251 aa  138  7e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3742  ATP synthase F0, A subunit  39.62 
 
 		 247 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  36.77 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  35.98 
 
 		 218 aa  128  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  31.34 
 
 		 216 aa  123  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  35.86 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1430  F0F1 ATP synthase subunit A  34.27 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00694031  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0197  ATP synthase F0, A subunit  33.89 
 
 		 301 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000520668  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 		 246 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  34.06 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  31.31 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  31.4 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  30.52 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  36.57 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  30.05 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  30.91 
 
 		 232 aa  98.2  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3831  F0F1 ATP synthase subunit A  33.48 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000137067  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  34.1 
 
 		 249 aa  97.1  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  35.06 
 
 		 243 aa  96.3  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  35.18 
 
 		 234 aa  95.9  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  32.95 
 
 		 253 aa  95.5  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  34.52 
 
 		 251 aa  95.5  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  31.73 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  31.19 
 
 		 231 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  30.77 
 
 		 258 aa  95.1  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  30 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  30.48 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1031  ATP synthase F0, A subunit  32.03 
 
 		 307 aa  94.4  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  32.95 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  33 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  34.58 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  34.98 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  34.52 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  31.13 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  32.95 
 
 		 261 aa  92.4  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  29.96 
 
 		 227 aa  92.4  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  31.43 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  30.66 
 
 		 229 aa  92  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5109  F0F1 ATP synthase subunit A  32.59 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00506372  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  33.82 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  29.52 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  29.72 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  31.88 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  29.63 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  33.92 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  30.34 
 
 		 271 aa  90.5  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  29.63 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5436  F0F1 ATP synthase subunit A  32.14 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0528964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5518  F0F1 ATP synthase subunit A  32.14 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000410336  hitchhiker  3.2870800000000003e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5489  F0F1 ATP synthase subunit A  32.14 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  34.3 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  34.78 
 
 		 229 aa  89.7  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  30.92 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5161  F0F1 ATP synthase subunit A  31.7 
 
 		 239 aa  88.6  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4994  F0F1 ATP synthase subunit A  31.7 
 
 		 239 aa  88.6  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000342727  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0467  F0F1 ATP synthase subunit A  34.78 
 
 		 233 aa  89  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.104154 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5553  F0F1 ATP synthase subunit A  31.7 
 
 		 239 aa  88.6  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000158416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5402  F0F1 ATP synthase subunit A  31.7 
 
 		 239 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.39849e-58 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5011  F0F1 ATP synthase subunit A  31.7 
 
 		 239 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110706  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  28.7 
 
 		 252 aa  88.2  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5433  F0F1 ATP synthase subunit A  32.14 
 
 		 239 aa  88.2  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1875  F0F1-type ATP synthase, subunit a  33.19 
 
 		 241 aa  88.2  9e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.257614  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0858  F0F1 ATP synthase subunit A  31.61 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  31.25 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  30.22 
 
 		 233 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  31.96 
 
 		 194 aa  85.9  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2145  F0F1 ATP synthase subunit A  28.91 
 
 		 242 aa  86.3  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.186735  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2183  F0F1 ATP synthase subunit A  28.91 
 
 		 242 aa  86.3  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.22629  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  29.78 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0461  ATP synthase F0, A subunit  32.44 
 
 		 235 aa  85.5  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000814456  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  35.68 
 
 		 234 aa  85.1  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  32.19 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  28.45 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  28.45 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  29.21 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0296  F0F1 ATP synthase subunit A  29.6 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  31.51 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  32.16 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0892  F0F1 ATP synthase subunit A  29.86 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.546785  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  33.92 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  28.02 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  32.35 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1715  F0F1 ATP synthase subunit A  30.85 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2993  F0F1 ATP synthase subunit A  31.53 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0751  F0F1 ATP synthase subunit A  27.15 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.146612  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2616  F0F1 ATP synthase subunit A  30 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  32.41 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3309  F0F1 ATP synthase subunit A  32.16 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000902841  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  29.41 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  29 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2502  F0F1 ATP synthase subunit A  30.51 
 
 		 338 aa  78.6  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  28.22 
 
 		 284 aa  78.6  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3956  F0F1 ATP synthase subunit A  29.65 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0660881 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3868  F0F1 ATP synthase subunit A  29.65 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal  0.0791726 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  35.22 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3882  F0F1 ATP synthase subunit A  29.65 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>