More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2168 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2168  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
218 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2458  F0F1 ATP synthase subunit A  88.99 
 
 
224 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  38.97 
 
 
217 aa  144  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3742  ATP synthase F0, A subunit  38.43 
 
 
247 aa  131  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  35.45 
 
 
235 aa  129  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  30.54 
 
 
251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  35.58 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  29.38 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  35.86 
 
 
224 aa  112  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1430  F0F1 ATP synthase subunit A  32.88 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00694031  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0197  ATP synthase F0, A subunit  34.41 
 
 
301 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000520668  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  34.42 
 
 
262 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  31.58 
 
 
231 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  34.12 
 
 
246 aa  101  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  32.21 
 
 
232 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  31.88 
 
 
230 aa  99  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
232 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  33.97 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  35.09 
 
 
243 aa  96.3  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  32.38 
 
 
232 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  31.31 
 
 
227 aa  94.7  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  30.45 
 
 
227 aa  94.7  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  33.49 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  30.84 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  33.49 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  36 
 
 
230 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  34.6 
 
 
229 aa  92  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  32.08 
 
 
231 aa  92.4  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  33.49 
 
 
229 aa  92.4  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  30.14 
 
 
258 aa  92  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  33.76 
 
 
228 aa  91.7  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  29.28 
 
 
237 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  33.02 
 
 
229 aa  90.9  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3831  F0F1 ATP synthase subunit A  32.16 
 
 
239 aa  90.9  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000137067  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  32.08 
 
 
229 aa  90.1  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1031  ATP synthase F0, A subunit  31.58 
 
 
307 aa  90.5  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  32.84 
 
 
234 aa  89.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  30.33 
 
 
251 aa  89  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  30.34 
 
 
271 aa  89.4  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2183  F0F1 ATP synthase subunit A  30.14 
 
 
242 aa  89  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.22629  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2145  F0F1 ATP synthase subunit A  30.14 
 
 
242 aa  89  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.186735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  33.96 
 
 
229 aa  88.6  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  32.23 
 
 
230 aa  89  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  32.04 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  32.76 
 
 
253 aa  87.8  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  32.95 
 
 
249 aa  87.8  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0467  F0F1 ATP synthase subunit A  34.16 
 
 
233 aa  87  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.104154 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  31.34 
 
 
235 aa  87.4  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  31.74 
 
 
223 aa  86.3  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  31.79 
 
 
257 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  33.12 
 
 
228 aa  86.3  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  33.18 
 
 
229 aa  85.5  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1715  F0F1 ATP synthase subunit A  33.64 
 
 
242 aa  85.1  7e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
246 aa  85.1  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3309  F0F1 ATP synthase subunit A  32.88 
 
 
236 aa  85.1  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000902841  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  30.23 
 
 
231 aa  85.1  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  33.76 
 
 
261 aa  84  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  28.77 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0858  F0F1 ATP synthase subunit A  32.3 
 
 
238 aa  84  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5109  F0F1 ATP synthase subunit A  30.84 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00506372  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1875  F0F1-type ATP synthase, subunit a  33.33 
 
 
241 aa  84  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.257614  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  30.77 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  30.37 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0461  ATP synthase F0, A subunit  31.56 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000814456  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  28.7 
 
 
251 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  28.7 
 
 
251 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5436  F0F1 ATP synthase subunit A  30.4 
 
 
239 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0528964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5489  F0F1 ATP synthase subunit A  30.4 
 
 
239 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5518  F0F1 ATP synthase subunit A  30.4 
 
 
239 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000410336  hitchhiker  3.2870800000000003e-19 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0892  F0F1 ATP synthase subunit A  28.5 
 
 
223 aa  81.6  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.546785  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  29.78 
 
 
233 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5402  F0F1 ATP synthase subunit A  30.4 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.39849e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5161  F0F1 ATP synthase subunit A  30.4 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4994  F0F1 ATP synthase subunit A  30.4 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000342727  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2502  F0F1 ATP synthase subunit A  31.14 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5011  F0F1 ATP synthase subunit A  30.4 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110706  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5553  F0F1 ATP synthase subunit A  30.4 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000158416  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  31.18 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  27.63 
 
 
241 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  27.63 
 
 
241 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5433  F0F1 ATP synthase subunit A  29.96 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2616  F0F1 ATP synthase subunit A  30.99 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68842  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  34.05 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  30.91 
 
 
234 aa  79  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  27.19 
 
 
241 aa  79  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  26.96 
 
 
284 aa  78.6  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  28.16 
 
 
229 aa  78.6  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2993  F0F1 ATP synthase subunit A  29.56 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  28.49 
 
 
241 aa  77  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  34.25 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000656805  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0296  F0F1 ATP synthase subunit A  28.7 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0423  F0F1 ATP synthase subunit A  30.48 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  31.58 
 
 
239 aa  77  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  29.24 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0151  F0F1 ATP synthase subunit A  31.43 
 
 
233 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.158772  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1294  F0F1 ATP synthase subunit A  31.43 
 
 
233 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.322594  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0127  F0F1 ATP synthase subunit A  31.43 
 
 
233 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2648  F0F1 ATP synthase subunit A  31.43 
 
 
233 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1052  F0F1 ATP synthase subunit A  31.43 
 
 
233 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>