More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1388 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 
233 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  90.99 
 
 
233 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  71.24 
 
 
233 aa  355  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  62.17 
 
 
234 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  57.02 
 
 
234 aa  261  4.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  63.73 
 
 
226 aa  240  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000656805  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  49.79 
 
 
239 aa  217  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  50.73 
 
 
234 aa  204  7e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  45.89 
 
 
229 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  45.45 
 
 
229 aa  203  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  45.69 
 
 
230 aa  202  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  47.14 
 
 
229 aa  202  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  46.75 
 
 
229 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  48.04 
 
 
229 aa  198  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  45.89 
 
 
229 aa  198  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  45.02 
 
 
229 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  48.77 
 
 
234 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  45.02 
 
 
229 aa  189  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  41.18 
 
 
207 aa  176  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  38.16 
 
 
227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  39.3 
 
 
225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  38.92 
 
 
226 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  40.2 
 
 
225 aa  151  7e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  38.42 
 
 
226 aa  149  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  42.62 
 
 
224 aa  148  6e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  35.27 
 
 
226 aa  148  7e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  35.27 
 
 
226 aa  148  8e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  35.27 
 
 
226 aa  148  8e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  37.73 
 
 
217 aa  141  9e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4472  ATP synthase F0, A subunit  40.91 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0723  F0F1 ATP synthase subunit A  33.18 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  36.65 
 
 
218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  36.02 
 
 
246 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  35.44 
 
 
227 aa  119  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  34.76 
 
 
241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  31.28 
 
 
232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  35.47 
 
 
227 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  35.47 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  34.29 
 
 
241 aa  111  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  35.32 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1299  ATP synthase F0, A subunit  36.76 
 
 
245 aa  108  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
241 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  34.18 
 
 
216 aa  106  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  34.3 
 
 
235 aa  106  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  28.95 
 
 
231 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  35.58 
 
 
261 aa  105  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  32.56 
 
 
230 aa  105  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  29.65 
 
 
232 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  35.75 
 
 
241 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  35.75 
 
 
241 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  33.5 
 
 
228 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  36.7 
 
 
241 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  33.51 
 
 
194 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  34.25 
 
 
268 aa  102  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16351  F0F1 ATP synthase subunit A  37.23 
 
 
188 aa  101  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  36.08 
 
 
220 aa  101  9e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  30.09 
 
 
230 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18541  F0F1 ATP synthase subunit A  34.29 
 
 
241 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0228025  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0986  F0F1 ATP synthase subunit A  34.29 
 
 
241 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15751  F0F1 ATP synthase subunit A  34.29 
 
 
241 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  32 
 
 
228 aa  99.8  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  31.16 
 
 
251 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  33.04 
 
 
345 aa  99.8  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  31.16 
 
 
251 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  31.48 
 
 
257 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  33 
 
 
239 aa  99.4  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  34.71 
 
 
223 aa  99  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  30.7 
 
 
252 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  32.51 
 
 
232 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
257 aa  98.2  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  31.2 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  32.56 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  31.2 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  30.09 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2993  F0F1 ATP synthase subunit A  35.5 
 
 
239 aa  97.1  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  31.6 
 
 
282 aa  96.7  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  34.3 
 
 
231 aa  96.3  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  31.4 
 
 
224 aa  96.3  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  31.86 
 
 
228 aa  96.3  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  32.64 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  32.09 
 
 
247 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  32.09 
 
 
261 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  31.11 
 
 
271 aa  95.9  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  32.43 
 
 
341 aa  95.5  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  30.77 
 
 
251 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  31.19 
 
 
229 aa  95.5  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2502  F0F1 ATP synthase subunit A  31.74 
 
 
338 aa  95.1  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  33.51 
 
 
241 aa  94.4  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  33.81 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  32.5 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  31.73 
 
 
249 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2879  F0F1 ATP synthase subunit A  33.67 
 
 
248 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.775771  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  32.64 
 
 
248 aa  92.8  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  29.91 
 
 
260 aa  92.4  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2616  F0F1 ATP synthase subunit A  33.17 
 
 
251 aa  92  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68842  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  32.34 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0467  F0F1 ATP synthase subunit A  31.5 
 
 
233 aa  90.9  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.104154 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  32.59 
 
 
340 aa  91.3  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677372  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  28.7 
 
 
247 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>