More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3931 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 
229 aa  448  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  99.13 
 
 
229 aa  447  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  84.28 
 
 
229 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  80.79 
 
 
229 aa  374  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  78.17 
 
 
229 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  77.29 
 
 
229 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  79.04 
 
 
229 aa  360  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  76.09 
 
 
230 aa  347  7e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  56.9 
 
 
229 aa  262  4e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  57.02 
 
 
234 aa  257  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  55.32 
 
 
234 aa  247  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  52.3 
 
 
239 aa  240  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  48.88 
 
 
234 aa  209  3e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  50 
 
 
233 aa  205  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  44.49 
 
 
233 aa  197  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  45.02 
 
 
233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  48.24 
 
 
234 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  51.49 
 
 
226 aa  180  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000656805  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  43.17 
 
 
207 aa  176  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  42.38 
 
 
226 aa  174  8e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  42.38 
 
 
226 aa  174  8e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  43.33 
 
 
226 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  43.39 
 
 
226 aa  167  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  39.81 
 
 
225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  41.12 
 
 
226 aa  159  3e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  39.72 
 
 
227 aa  159  5e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  41.03 
 
 
225 aa  158  6e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4472  ATP synthase F0, A subunit  50 
 
 
258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  43.9 
 
 
218 aa  155  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  40.43 
 
 
224 aa  149  5e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  38.61 
 
 
217 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  41.75 
 
 
217 aa  142  4e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0723  F0F1 ATP synthase subunit A  40.74 
 
 
228 aa  142  5e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1299  ATP synthase F0, A subunit  36.98 
 
 
245 aa  132  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  35.12 
 
 
236 aa  132  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  37.14 
 
 
227 aa  131  9e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  35.5 
 
 
216 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  36.27 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  38.42 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  38.61 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  35.82 
 
 
230 aa  128  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  33.82 
 
 
251 aa  125  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  36.74 
 
 
227 aa  124  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  36.74 
 
 
227 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  36.59 
 
 
239 aa  122  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  31.75 
 
 
231 aa  122  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  35.59 
 
 
194 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  34.33 
 
 
231 aa  122  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0467  F0F1 ATP synthase subunit A  36.57 
 
 
233 aa  122  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.104154 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  33.18 
 
 
228 aa  122  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  34.48 
 
 
231 aa  121  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  36.89 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  36.89 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  33.78 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  34.31 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  33.5 
 
 
228 aa  118  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  36.63 
 
 
252 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3102  F0F1 ATP synthase subunit A  33.01 
 
 
229 aa  116  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00224256  normal  0.218622 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  33.5 
 
 
243 aa  116  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  33.84 
 
 
246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  35.38 
 
 
229 aa  114  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  35.58 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  37.21 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  31.67 
 
 
243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2993  F0F1 ATP synthase subunit A  32.63 
 
 
239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  33.65 
 
 
249 aa  112  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  40.51 
 
 
220 aa  111  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  33.18 
 
 
232 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0892  F0F1 ATP synthase subunit A  32.85 
 
 
223 aa  111  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.546785  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  37.02 
 
 
261 aa  111  9e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  37.8 
 
 
257 aa  111  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  33.81 
 
 
241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  33.81 
 
 
241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  35.9 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  33.03 
 
 
284 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  32.33 
 
 
282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0558  ATP synthase F0, A subunit  33.62 
 
 
314 aa  108  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000487089  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  35.81 
 
 
231 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_497  ATP synthase F0, A subunit  33.19 
 
 
314 aa  108  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221508  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0532  ATP synthase F0, A subunit  32.77 
 
 
314 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000978517  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  28.44 
 
 
257 aa  107  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  28.17 
 
 
251 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  32.86 
 
 
241 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  30.59 
 
 
246 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  32.86 
 
 
241 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  32.86 
 
 
241 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
237 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  31.9 
 
 
241 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  36.89 
 
 
253 aa  105  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  35.64 
 
 
249 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  32.99 
 
 
241 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  33.76 
 
 
250 aa  102  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  35.45 
 
 
243 aa  102  6e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  34.91 
 
 
251 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  33.16 
 
 
243 aa  101  9e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  33.64 
 
 
252 aa  101  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0423  F0F1 ATP synthase subunit A  36.79 
 
 
233 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  31.22 
 
 
258 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
261 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>