More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2699 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  56.31 
 
 
228 aa  231  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  48.18 
 
 
230 aa  206  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  45.56 
 
 
194 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  40.37 
 
 
232 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  42.27 
 
 
251 aa  159  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  44.78 
 
 
231 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  38.74 
 
 
230 aa  151  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  42.52 
 
 
239 aa  151  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  41.71 
 
 
231 aa  151  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0892  F0F1 ATP synthase subunit A  41.04 
 
 
223 aa  149  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.546785  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  38.25 
 
 
227 aa  148  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  37.79 
 
 
227 aa  148  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  37.74 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  44.72 
 
 
236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  35.68 
 
 
232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2993  F0F1 ATP synthase subunit A  47.49 
 
 
239 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  39.09 
 
 
243 aa  142  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  39.82 
 
 
246 aa  141  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0467  F0F1 ATP synthase subunit A  40.35 
 
 
233 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.104154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  35.61 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  34.86 
 
 
232 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  42.77 
 
 
223 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3102  F0F1 ATP synthase subunit A  44.63 
 
 
229 aa  134  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00224256  normal  0.218622 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  33.01 
 
 
218 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  33.33 
 
 
229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  32.89 
 
 
229 aa  129  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  35.02 
 
 
231 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  35.87 
 
 
207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  33.18 
 
 
229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  32.99 
 
 
216 aa  125  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  32.73 
 
 
229 aa  125  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  34.57 
 
 
229 aa  123  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  33.7 
 
 
230 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  34.69 
 
 
234 aa  122  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  35.35 
 
 
228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 
229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  34.24 
 
 
234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  33.82 
 
 
229 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  32.35 
 
 
229 aa  118  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  32.99 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  30.23 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  31.39 
 
 
235 aa  116  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  32.2 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0423  F0F1 ATP synthase subunit A  35.91 
 
 
233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0127  F0F1 ATP synthase subunit A  36.41 
 
 
233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2790  F0F1 ATP synthase subunit A  36.41 
 
 
233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1052  F0F1 ATP synthase subunit A  36.41 
 
 
233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1294  F0F1 ATP synthase subunit A  36.41 
 
 
233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.322594  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2648  F0F1 ATP synthase subunit A  36.41 
 
 
233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0151  F0F1 ATP synthase subunit A  36.41 
 
 
233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.158772  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  36.06 
 
 
241 aa  108  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  29.05 
 
 
234 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  29.72 
 
 
225 aa  106  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  29.15 
 
 
226 aa  105  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  31.28 
 
 
225 aa  105  5e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  32 
 
 
233 aa  105  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  29.36 
 
 
227 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1299  ATP synthase F0, A subunit  33.9 
 
 
245 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  29.08 
 
 
227 aa  102  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  35.1 
 
 
241 aa  102  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  34.62 
 
 
241 aa  102  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  31.32 
 
 
226 aa  101  7e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  28.1 
 
 
234 aa  102  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  31.82 
 
 
233 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  31.32 
 
 
226 aa  101  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  30.67 
 
 
284 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  30.77 
 
 
226 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  32.86 
 
 
251 aa  98.2  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  32.86 
 
 
251 aa  98.2  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  32.69 
 
 
241 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  27.91 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  32.69 
 
 
241 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  31.9 
 
 
217 aa  97.4  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  32.69 
 
 
241 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2458  F0F1 ATP synthase subunit A  32.58 
 
 
224 aa  95.5  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  28.99 
 
 
226 aa  94.7  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000656805  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  34.1 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  27.27 
 
 
220 aa  94  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  31.94 
 
 
249 aa  93.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  28.94 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0751  F0F1 ATP synthase subunit A  30.57 
 
 
272 aa  92.4  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.146612  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0986  F0F1 ATP synthase subunit A  34.62 
 
 
241 aa  92  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18541  F0F1 ATP synthase subunit A  34.62 
 
 
241 aa  92  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0228025  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  30.39 
 
 
224 aa  91.7  9e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16351  F0F1 ATP synthase subunit A  33.88 
 
 
188 aa  91.7  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  30.52 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  27.49 
 
 
271 aa  90.9  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15751  F0F1 ATP synthase subunit A  34.62 
 
 
241 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0858  F0F1 ATP synthase subunit A  32.27 
 
 
238 aa  90.1  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0197  ATP synthase F0, A subunit  30.25 
 
 
301 aa  89.7  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000520668  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  27.78 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  30.33 
 
 
217 aa  89.7  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  27.49 
 
 
257 aa  89  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2168  F0F1 ATP synthase subunit A  31.28 
 
 
218 aa  88.6  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  30.73 
 
 
241 aa  88.2  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1175  F0F1 ATP synthase subunit A  31.16 
 
 
280 aa  88.2  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.108763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1279  F0F1 ATP synthase subunit A  31.16 
 
 
280 aa  88.2  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0786025  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  25.88 
 
 
251 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  31.31 
 
 
235 aa  88.2  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>