More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0064 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
345 aa  687    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  76.59 
 
 
342 aa  498  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  75.14 
 
 
340 aa  489  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677372  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  72.82 
 
 
341 aa  421  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2247  F0F1 ATP synthase subunit A  78.47 
 
 
324 aa  398  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.608191  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2502  F0F1 ATP synthase subunit A  74.17 
 
 
338 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4487  F0F1 ATP synthase subunit A  46.91 
 
 
406 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.553444  normal  0.0963007 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4495  F0F1 ATP synthase subunit A  48.17 
 
 
384 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  48.52 
 
 
364 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4476  F0F1 ATP synthase subunit A  47.44 
 
 
384 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  39.28 
 
 
373 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4340  F0F1 ATP synthase subunit A  46.76 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.35318  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1055  ATP synthase F0, A subunit  44.03 
 
 
391 aa  186  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0061  ATP synthase F0 subunit A  46.05 
 
 
339 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  39.89 
 
 
373 aa  179  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0179  ATP synthase, subunit A (H(+)-transporting two-sector ATPase)  40.44 
 
 
376 aa  172  6.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.412196  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  45.45 
 
 
355 aa  169  6e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  44.3 
 
 
400 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03040  putative ATP synthase A chain  45.19 
 
 
361 aa  157  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  34.51 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1229  ATP synthase F0, A subunit  43.25 
 
 
380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.896245 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  37.66 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  34.71 
 
 
268 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  39.09 
 
 
261 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1515  ATP synthase F0, A subunit  34.09 
 
 
248 aa  120  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  38.68 
 
 
284 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  33.05 
 
 
241 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  34.91 
 
 
243 aa  109  6e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  37.32 
 
 
261 aa  109  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0170  ATP synthase F0, A subunit  42.46 
 
 
339 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.222204  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  32.13 
 
 
295 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  36.09 
 
 
234 aa  106  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  35.16 
 
 
257 aa  106  5e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  30.74 
 
 
283 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  33.19 
 
 
243 aa  105  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  34.35 
 
 
281 aa  104  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  33.77 
 
 
234 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  30.95 
 
 
272 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  35.41 
 
 
247 aa  100  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  31.2 
 
 
216 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  31.28 
 
 
207 aa  100  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  30.61 
 
 
260 aa  99.8  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  32.17 
 
 
263 aa  99.4  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  33.04 
 
 
233 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  31.74 
 
 
251 aa  99.4  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  32.35 
 
 
260 aa  99  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  35.32 
 
 
229 aa  99  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  33.19 
 
 
261 aa  98.2  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  32.11 
 
 
241 aa  97.4  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  30.23 
 
 
263 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  31.95 
 
 
267 aa  97.1  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  31.79 
 
 
263 aa  96.7  6e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  34.17 
 
 
234 aa  96.3  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1304  ATP synthase F0, A subunit  33.73 
 
 
266 aa  96.3  7e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000065102  normal  0.293813 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  30.62 
 
 
250 aa  96.3  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  35.05 
 
 
229 aa  96.3  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  31.15 
 
 
283 aa  95.9  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  29.62 
 
 
251 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  33.21 
 
 
271 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  29.62 
 
 
251 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  31.15 
 
 
249 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  33.93 
 
 
233 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  34.54 
 
 
230 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  32.91 
 
 
246 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  29.62 
 
 
251 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1299  ATP synthase F0, A subunit  34.01 
 
 
245 aa  93.6  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  28.85 
 
 
252 aa  94  4e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  29.76 
 
 
253 aa  94  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  28.79 
 
 
251 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  31.62 
 
 
241 aa  92.4  9e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  31.2 
 
 
241 aa  92.4  9e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  30.13 
 
 
259 aa  92.4  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  30.94 
 
 
250 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  33 
 
 
229 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  30.77 
 
 
248 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  31.54 
 
 
243 aa  91.3  2e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  33.2 
 
 
227 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  32.5 
 
 
229 aa  90.9  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  32.34 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  30.13 
 
 
267 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  31.4 
 
 
251 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  33.67 
 
 
229 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  31.13 
 
 
249 aa  90.5  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  33.06 
 
 
226 aa  90.5  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000656805  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  31.13 
 
 
249 aa  90.1  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3209  ATP synthase F0, A subunit  32.22 
 
 
249 aa  90.1  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116746  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2813  ATP synthase F0, A subunit  32.22 
 
 
249 aa  90.1  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0159651  normal  0.290047 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  32 
 
 
229 aa  89.7  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  28.74 
 
 
247 aa  90.1  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  27.42 
 
 
270 aa  89.7  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  29.84 
 
 
262 aa  89.4  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  31.36 
 
 
285 aa  89.4  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  31.02 
 
 
226 aa  88.6  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  31.02 
 
 
226 aa  88.6  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  28.91 
 
 
250 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  31.62 
 
 
265 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  31.11 
 
 
229 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  29.06 
 
 
249 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  32.49 
 
 
247 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  31.83 
 
 
276 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>