More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4100 on replicon NC_009040
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  99.56 
 
 
227 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
227 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  64.57 
 
 
230 aa  290  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  65 
 
 
232 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  61.64 
 
 
231 aa  269  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  63.93 
 
 
232 aa  268  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  61.61 
 
 
232 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  63.23 
 
 
231 aa  262  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  61.78 
 
 
228 aa  255  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0423  F0F1 ATP synthase subunit A  58.33 
 
 
233 aa  237  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2648  F0F1 ATP synthase subunit A  58.77 
 
 
233 aa  231  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0127  F0F1 ATP synthase subunit A  58.77 
 
 
233 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1294  F0F1 ATP synthase subunit A  58.77 
 
 
233 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.322594  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1052  F0F1 ATP synthase subunit A  58.77 
 
 
233 aa  231  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2790  F0F1 ATP synthase subunit A  58.77 
 
 
233 aa  231  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0151  F0F1 ATP synthase subunit A  58.77 
 
 
233 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.158772  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  54.26 
 
 
194 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  47.42 
 
 
231 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  44.86 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  43.19 
 
 
231 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  43.81 
 
 
246 aa  168  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  46.26 
 
 
228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  40.8 
 
 
216 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  41.51 
 
 
243 aa  160  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0892  F0F1 ATP synthase subunit A  41.98 
 
 
223 aa  159  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.546785  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0467  F0F1 ATP synthase subunit A  41.55 
 
 
233 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.104154 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  38.32 
 
 
251 aa  149  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3102  F0F1 ATP synthase subunit A  39.71 
 
 
229 aa  147  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00224256  normal  0.218622 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  41.09 
 
 
229 aa  146  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  38.86 
 
 
239 aa  146  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  37.2 
 
 
218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  38.25 
 
 
228 aa  142  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  39.44 
 
 
223 aa  142  6e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2993  F0F1 ATP synthase subunit A  41.36 
 
 
239 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  39.07 
 
 
229 aa  131  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  40.69 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  38.14 
 
 
229 aa  129  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  39.13 
 
 
230 aa  129  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  36.07 
 
 
230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  38.79 
 
 
239 aa  128  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  38.81 
 
 
234 aa  125  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  37.21 
 
 
229 aa  125  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  36.74 
 
 
229 aa  124  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  34.06 
 
 
227 aa  123  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  34.88 
 
 
229 aa  123  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  38.14 
 
 
229 aa  122  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  37.67 
 
 
229 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  34.48 
 
 
233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  31.43 
 
 
235 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  31.84 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  35.47 
 
 
233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  33.8 
 
 
217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  33.01 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  30.51 
 
 
284 aa  109  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0197  ATP synthase F0, A subunit  29.63 
 
 
301 aa  108  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000520668  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  42.11 
 
 
220 aa  108  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  34.78 
 
 
233 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  33.18 
 
 
226 aa  105  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000656805  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  32.02 
 
 
234 aa  105  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  32.38 
 
 
234 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  32.52 
 
 
207 aa  103  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  29.2 
 
 
251 aa  102  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  28.97 
 
 
262 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  31.65 
 
 
249 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0858  F0F1 ATP synthase subunit A  35.44 
 
 
238 aa  100  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  33.19 
 
 
257 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2168  F0F1 ATP synthase subunit A  31.31 
 
 
218 aa  94.7  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0558  ATP synthase F0, A subunit  31.54 
 
 
314 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000487089  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3742  ATP synthase F0, A subunit  34.08 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  32.35 
 
 
251 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2458  F0F1 ATP synthase subunit A  30.48 
 
 
224 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  32.35 
 
 
251 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  34.43 
 
 
252 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_497  ATP synthase F0, A subunit  31.15 
 
 
314 aa  93.6  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221508  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0532  ATP synthase F0, A subunit  31.8 
 
 
314 aa  93.2  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000978517  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  36.07 
 
 
226 aa  92.8  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  32.19 
 
 
241 aa  92.8  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  36.67 
 
 
241 aa  91.7  9e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  40.67 
 
 
241 aa  91.7  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  40.67 
 
 
241 aa  91.7  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  40.67 
 
 
241 aa  91.7  9e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  36.67 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16351  F0F1 ATP synthase subunit A  40.67 
 
 
188 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  33.91 
 
 
253 aa  90.9  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  30.26 
 
 
235 aa  90.5  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  34.04 
 
 
226 aa  89.4  5e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  34.04 
 
 
226 aa  89.4  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  33.49 
 
 
261 aa  88.2  9e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  33.18 
 
 
225 aa  88.2  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  34.22 
 
 
224 aa  87.4  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  33.51 
 
 
226 aa  88.2  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  30.67 
 
 
251 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  30.65 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  28.03 
 
 
251 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0296  F0F1 ATP synthase subunit A  27.97 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  30.67 
 
 
251 aa  87  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  30.67 
 
 
251 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  29.91 
 
 
251 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2616  F0F1 ATP synthase subunit A  33.04 
 
 
251 aa  85.9  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68842  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  28.23 
 
 
246 aa  85.5  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>