More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3246 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 		 241 aa  478  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  54.07 
 
 		 249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  52.05 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  52.87 
 
 		 250 aa  254  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  51.03 
 
 		 260 aa  252  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  53.28 
 
 		 250 aa  252  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  52.44 
 
 		 247 aa  247  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  50.41 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  50 
 
 		 249 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  51.85 
 
 		 249 aa  244  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  52.05 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  50 
 
 		 249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  51.63 
 
 		 247 aa  240  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  51.53 
 
 		 251 aa  240  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  50.83 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  47.01 
 
 		 258 aa  235  5.0000000000000005e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  45.27 
 
 		 252 aa  232  3e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  50 
 
 		 248 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  47.95 
 
 		 250 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  47.97 
 
 		 249 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  50.41 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  47.95 
 
 		 248 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  47.97 
 
 		 247 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  47.74 
 
 		 253 aa  225  6e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  44.88 
 
 		 261 aa  222  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  44.17 
 
 		 243 aa  221  8e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  46.27 
 
 		 261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  46.09 
 
 		 260 aa  218  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  46.09 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  46.5 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  46.09 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  46.09 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  42.5 
 
 		 243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  47.93 
 
 		 243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  43.28 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  45.27 
 
 		 251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  46.09 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  45.27 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  47.46 
 
 		 282 aa  202  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  47.33 
 
 		 248 aa  198  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  44.13 
 
 		 261 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  44.13 
 
 		 261 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  47.91 
 
 		 247 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  39.76 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1893  F0F1 ATP synthase subunit A  46.22 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0190421 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2594  F0F1 ATP synthase subunit A  44.35 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546841 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2879  F0F1 ATP synthase subunit A  44.49 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.775771  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  38.59 
 
 		 283 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  38.62 
 
 		 265 aa  125  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  37.38 
 
 		 207 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  35.05 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2119  ATP synthase F0, A subunit  36.64 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00507952  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  34.04 
 
 		 258 aa  121  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  34.2 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  38.01 
 
 		 364 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  33.33 
 
 		 229 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  35.46 
 
 		 295 aa  118  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  37.32 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  33.46 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2611  F0F1 ATP synthase subunit A  35.47 
 
 		 266 aa  116  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  36.6 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  34.68 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  35.61 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  33.51 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  34.93 
 
 		 340 aa  113  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  34.22 
 
 		 229 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  33.04 
 
 		 373 aa  112  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  32.19 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  33.05 
 
 		 345 aa  112  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0061  ATP synthase F0 subunit A  33.19 
 
 		 339 aa  111  9e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  36.55 
 
 		 373 aa  111  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  34.33 
 
 		 263 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  35.08 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  32.52 
 
 		 341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2344  F0F1 ATP synthase subunit A  34.48 
 
 		 266 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801138 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2502  F0F1 ATP synthase subunit A  30.74 
 
 		 338 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  32.8 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  34.02 
 
 		 229 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  35.8 
 
 		 284 aa  108  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  31.97 
 
 		 342 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0179  ATP synthase, subunit A (H(+)-transporting two-sector ATPase)  32.6 
 
 		 376 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.412196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  35.23 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  32.4 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  35.56 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  34.47 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  33.62 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  32.99 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  36.98 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0330  ATP synthase F0, A subunit  34.74 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  31.94 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  32.99 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  37.5 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1301  ATP synthase F0, A subunit  33.06 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  34.2 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  35.71 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1055  ATP synthase F0, A subunit  32.87 
 
 		 391 aa  99.8  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  33.92 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  29.49 
 
 		 246 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  33.19 
 
 		 259 aa  99  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03040  putative ATP synthase A chain  32.34 
 
 		 361 aa  99.4  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>