More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2885 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
340 aa  675    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677372  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  76.22 
 
 
342 aa  513  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  73.86 
 
 
345 aa  486  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  71.51 
 
 
341 aa  449  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2247  F0F1 ATP synthase subunit A  72.54 
 
 
324 aa  411  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.608191  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2502  F0F1 ATP synthase subunit A  64.79 
 
 
338 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4487  F0F1 ATP synthase subunit A  46.91 
 
 
406 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.553444  normal  0.0963007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  48.94 
 
 
364 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4495  F0F1 ATP synthase subunit A  47.33 
 
 
384 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  49.16 
 
 
373 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4476  F0F1 ATP synthase subunit A  46.18 
 
 
384 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4340  F0F1 ATP synthase subunit A  46.42 
 
 
381 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.35318  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1055  ATP synthase F0, A subunit  44.65 
 
 
391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0061  ATP synthase F0 subunit A  46.7 
 
 
339 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  38.59 
 
 
373 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0179  ATP synthase, subunit A (H(+)-transporting two-sector ATPase)  38.84 
 
 
376 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.412196  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  44.3 
 
 
400 aa  161  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  45.11 
 
 
355 aa  159  8e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03040  putative ATP synthase A chain  44.35 
 
 
361 aa  154  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  38.66 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1229  ATP synthase F0, A subunit  43.37 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.896245 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  34.04 
 
 
303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  36.69 
 
 
268 aa  129  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1515  ATP synthase F0, A subunit  33.96 
 
 
248 aa  121  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  35.83 
 
 
261 aa  120  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  34.93 
 
 
241 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  34.03 
 
 
243 aa  107  2e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  32.89 
 
 
261 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0170  ATP synthase F0, A subunit  41.94 
 
 
339 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.222204  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  37.86 
 
 
284 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  31.72 
 
 
207 aa  104  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  33.98 
 
 
257 aa  103  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  32.81 
 
 
253 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  30.11 
 
 
283 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  31.9 
 
 
243 aa  100  3e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  34.07 
 
 
261 aa  98.6  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  32.48 
 
 
263 aa  97.4  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  32.05 
 
 
281 aa  97.4  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  31.58 
 
 
260 aa  97.1  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  32.29 
 
 
216 aa  96.7  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  36.36 
 
 
229 aa  96.7  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1304  ATP synthase F0, A subunit  34.53 
 
 
266 aa  96.7  6e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000065102  normal  0.293813 
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  33.2 
 
 
241 aa  95.5  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  29.91 
 
 
263 aa  95.1  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  32.74 
 
 
234 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  35.45 
 
 
234 aa  95.5  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
251 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
251 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
251 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  33.66 
 
 
234 aa  94.7  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  33.03 
 
 
229 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  32.56 
 
 
251 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  31.69 
 
 
252 aa  94.4  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  32.13 
 
 
229 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  30.2 
 
 
272 aa  94.4  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  35.35 
 
 
229 aa  94  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  29.96 
 
 
263 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  32.17 
 
 
250 aa  93.6  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  31.71 
 
 
295 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  32.46 
 
 
247 aa  92.8  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  31.27 
 
 
249 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  32.2 
 
 
260 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  32.24 
 
 
271 aa  92  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  34.38 
 
 
233 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1299  ATP synthase F0, A subunit  33 
 
 
245 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3209  ATP synthase F0, A subunit  32.64 
 
 
249 aa  90.9  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116746  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  32.59 
 
 
233 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2813  ATP synthase F0, A subunit  32.64 
 
 
249 aa  90.9  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0159651  normal  0.290047 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  31.38 
 
 
267 aa  90.9  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  33.84 
 
 
229 aa  90.1  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  31.94 
 
 
251 aa  89.7  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  32.66 
 
 
251 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  28.44 
 
 
249 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  31.71 
 
 
251 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  30.74 
 
 
239 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  27.03 
 
 
270 aa  88.2  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  30.62 
 
 
250 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  32.83 
 
 
230 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  32.67 
 
 
247 aa  87  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  31.13 
 
 
249 aa  86.7  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  31.3 
 
 
241 aa  86.7  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  33.66 
 
 
247 aa  86.7  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  31.13 
 
 
249 aa  86.7  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  29.46 
 
 
285 aa  86.3  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  31.54 
 
 
248 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  32.6 
 
 
283 aa  85.9  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  32.02 
 
 
229 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2030  F0F1 ATP synthase subunit A  29.74 
 
 
288 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175167  normal  0.027211 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  30.87 
 
 
241 aa  85.9  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  29.88 
 
 
265 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  31.8 
 
 
276 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  28.63 
 
 
251 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0187  F0F1 ATP synthase subunit A  30 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.666395  hitchhiker  0.00551328 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06110  F0F1 ATP synthase subunit A  28.28 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2333  F0F1 ATP synthase subunit A  30.47 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000306591  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  32.08 
 
 
227 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4468  F0F1 ATP synthase subunit A  32.79 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000195299  hitchhiker  0.00000000198513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  29.88 
 
 
248 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  31.14 
 
 
229 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  28.51 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>