More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3713 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 		 284 aa  563  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  60.93 
 
 		 295 aa  351  8e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  44.09 
 
 		 275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  42.69 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  41.38 
 
 		 267 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  42.91 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  45.73 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  40.6 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  40.08 
 
 		 263 aa  176  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  40.39 
 
 		 265 aa  171  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  41.35 
 
 		 285 aa  166  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  40.25 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  40.55 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  37.78 
 
 		 261 aa  152  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  36.6 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  35.74 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2119  ATP synthase F0, A subunit  37.79 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00507952  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  33.58 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  38.17 
 
 		 281 aa  145  9e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  35.32 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  35.9 
 
 		 294 aa  129  7.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1301  ATP synthase F0, A subunit  33.86 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  33.21 
 
 		 272 aa  126  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2611  F0F1 ATP synthase subunit A  36.91 
 
 		 266 aa  126  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  33.96 
 
 		 266 aa  125  6e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0330  ATP synthase F0, A subunit  36.84 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2344  F0F1 ATP synthase subunit A  36.64 
 
 		 266 aa  122  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801138 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  37.75 
 
 		 247 aa  122  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  41.67 
 
 		 342 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4495  F0F1 ATP synthase subunit A  37.22 
 
 		 384 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4340  F0F1 ATP synthase subunit A  37.67 
 
 		 381 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.35318  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  35.65 
 
 		 207 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4476  F0F1 ATP synthase subunit A  37.22 
 
 		 384 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  37.34 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  31.75 
 
 		 243 aa  115  8.999999999999998e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  36.52 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  38.68 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  32 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  30.77 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  33.03 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0142  ATP synthase F0, A subunit  34.6 
 
 		 284 aa  112  5e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  35.32 
 
 		 261 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  35.32 
 
 		 247 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  35.27 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  35.32 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  37.02 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  35.27 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  35.02 
 
 		 263 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4487  F0F1 ATP synthase subunit A  34.89 
 
 		 406 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.553444  normal  0.0963007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  35.8 
 
 		 241 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  34.68 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  38.24 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  34.51 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  32.7 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  34.27 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  34.11 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  33.74 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2502  F0F1 ATP synthase subunit A  33.74 
 
 		 338 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  33.94 
 
 		 364 aa  105  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  34.96 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  38.31 
 
 		 400 aa  105  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  37.86 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677372  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  31.3 
 
 		 258 aa  104  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  37.24 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  37.24 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  33.47 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  35.39 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  29.43 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  36.82 
 
 		 251 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  33.8 
 
 		 373 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  31.66 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  36.41 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  34.72 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  30.24 
 
 		 241 aa  97.8  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  33.06 
 
 		 373 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  32.4 
 
 		 250 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  34.58 
 
 		 251 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  32.53 
 
 		 249 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  29.72 
 
 		 252 aa  95.5  9e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  30.74 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  34.65 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2247  F0F1 ATP synthase subunit A  34.51 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.608191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  32.54 
 
 		 248 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0061  ATP synthase F0 subunit A  35.89 
 
 		 339 aa  94  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0179  ATP synthase, subunit A (H(+)-transporting two-sector ATPase)  30.74 
 
 		 376 aa  93.2  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.412196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  34.01 
 
 		 247 aa  92.8  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1893  F0F1 ATP synthase subunit A  38.14 
 
 		 249 aa  92.4  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0190421 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  34.4 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  30.52 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  34.45 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  34.31 
 
 		 224 aa  91.3  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  30.8 
 
 		 250 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  32.81 
 
 		 247 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  34.04 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  31.64 
 
 		 250 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  34.47 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  33.07 
 
 		 250 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0858  F0F1 ATP synthase subunit A  28.83 
 
 		 238 aa  89.7  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  28.09 
 
 		 218 aa  89.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03040  putative ATP synthase A chain  31.75 
 
 		 361 aa  89  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>