More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29610 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  100 
 
 		 272 aa  531  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  47.13 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  44.7 
 
 		 265 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  46.04 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2611  F0F1 ATP synthase subunit A  44.36 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  41.92 
 
 		 262 aa  199  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2344  F0F1 ATP synthase subunit A  45.11 
 
 		 266 aa  198  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801138 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  43.8 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  42.54 
 
 		 276 aa  191  9e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  42.75 
 
 		 266 aa  190  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  42.75 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  40.81 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2119  ATP synthase F0, A subunit  41.79 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00507952  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  40.46 
 
 		 263 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  40.15 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  38.85 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  38.8 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  39.53 
 
 		 294 aa  169  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1301  ATP synthase F0, A subunit  36.82 
 
 		 282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  39 
 
 		 283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  40.51 
 
 		 285 aa  162  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  37.31 
 
 		 261 aa  161  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  37.45 
 
 		 295 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  34.91 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  35.74 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0330  ATP synthase F0, A subunit  40.93 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  36.36 
 
 		 247 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  31.09 
 
 		 270 aa  132  7.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  37.34 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  36.4 
 
 		 257 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  32.49 
 
 		 312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  36.05 
 
 		 251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  36.19 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  35.62 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  35.62 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  37.44 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  35.74 
 
 		 249 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  35.96 
 
 		 250 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  34.65 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  34.65 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  34.65 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  36.91 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  35.71 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  34.18 
 
 		 250 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  34.2 
 
 		 249 aa  99.4  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  33.92 
 
 		 241 aa  99.8  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0142  ATP synthase F0, A subunit  32.14 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  34.65 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  33.77 
 
 		 249 aa  97.8  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  34.63 
 
 		 250 aa  97.8  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  33.77 
 
 		 249 aa  96.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  31.23 
 
 		 282 aa  96.3  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  37.44 
 
 		 249 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  34.5 
 
 		 248 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  31.52 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  31.62 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  31.62 
 
 		 247 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  31.2 
 
 		 261 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  31.47 
 
 		 252 aa  92.8  6e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  29.25 
 
 		 263 aa  92.8  6e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  33.61 
 
 		 260 aa  92.4  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  28.14 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  34.43 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  34.74 
 
 		 355 aa  90.5  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  33.62 
 
 		 248 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 250 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  32.44 
 
 		 247 aa  89  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  31.37 
 
 		 261 aa  89  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  34.87 
 
 		 373 aa  88.2  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03040  putative ATP synthase A chain  31.4 
 
 		 361 aa  87.8  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0659  F0F1-type ATP synthase, subunit a  33.06 
 
 		 241 aa  87.8  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.320134  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  31.89 
 
 		 247 aa  87  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  32.74 
 
 		 247 aa  86.3  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  33.61 
 
 		 258 aa  86.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  32.35 
 
 		 342 aa  86.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  32.13 
 
 		 261 aa  85.9  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  31.23 
 
 		 341 aa  85.9  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  30.4 
 
 		 267 aa  85.9  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  33.02 
 
 		 253 aa  85.5  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  31.1 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  35.6 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  31.94 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  32.48 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  34.05 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  31.17 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677372  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  31.49 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  29.63 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  31.6 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  34.86 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  38.65 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  31.28 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2594  F0F1 ATP synthase subunit A  32.36 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  34.62 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4487  F0F1 ATP synthase subunit A  33.2 
 
 		 406 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.553444  normal  0.0963007 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  28.94 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0061  ATP synthase F0 subunit A  32.49 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1249  ATP synthase F0, A subunit  30.36 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4495  F0F1 ATP synthase subunit A  34.96 
 
 		 384 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  31.05 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2333  F0F1 ATP synthase subunit A  27.48 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000306591  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>