More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1644 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 		 258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  35.96 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  37.8 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  38.66 
 
 		 340 aa  135  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677372  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  37.45 
 
 		 341 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  37.66 
 
 		 345 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2502  F0F1 ATP synthase subunit A  39.08 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  37.13 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2247  F0F1 ATP synthase subunit A  38.2 
 
 		 324 aa  123  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.608191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  35.74 
 
 		 312 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  34.04 
 
 		 241 aa  121  9e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  29.78 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  36.57 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  37.07 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  32.47 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  29.27 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  38.1 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  32.47 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  32.26 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  30.22 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  32.27 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  30.96 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  34.48 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  31.09 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  32.2 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  35.27 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  30.93 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  31.6 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  29.88 
 
 		 249 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  35.44 
 
 		 373 aa  108  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  31.6 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  31.2 
 
 		 243 aa  108  9.000000000000001e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1515  ATP synthase F0, A subunit  37.93 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  32.61 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  34.73 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  29.48 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  29.08 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  32.61 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03040  putative ATP synthase A chain  34.94 
 
 		 361 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  30.3 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  30.08 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  30.21 
 
 		 250 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  33.49 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  32.17 
 
 		 251 aa  105  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  32.47 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  31.3 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  37.44 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  33.03 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  33.03 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  32.55 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  35.86 
 
 		 364 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  33.77 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  34.52 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4495  F0F1 ATP synthase subunit A  34.91 
 
 		 384 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  31.25 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  29.36 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  31.05 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  31.22 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  36.11 
 
 		 373 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  30.67 
 
 		 241 aa  102  8e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  29.36 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4340  F0F1 ATP synthase subunit A  35.42 
 
 		 381 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.35318  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  30.13 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  36.36 
 
 		 355 aa  100  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  32.6 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  31.86 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4487  F0F1 ATP synthase subunit A  34.96 
 
 		 406 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.553444  normal  0.0963007 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  33.06 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  30.04 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  35.29 
 
 		 261 aa  99  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  28.81 
 
 		 229 aa  98.6  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  28 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4476  F0F1 ATP synthase subunit A  38.43 
 
 		 384 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  31.53 
 
 		 229 aa  98.6  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  33.03 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  32.55 
 
 		 237 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2879  F0F1 ATP synthase subunit A  34.67 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.775771  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  29.89 
 
 		 271 aa  96.3  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  35.27 
 
 		 281 aa  96.3  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  32.6 
 
 		 226 aa  95.9  6e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  32.6 
 
 		 226 aa  95.9  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  35.45 
 
 		 247 aa  95.5  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  36.27 
 
 		 234 aa  95.5  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2458  F0F1 ATP synthase subunit A  30.77 
 
 		 224 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  32 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2145  F0F1 ATP synthase subunit A  32.41 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.186735  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  32 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  30.47 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2183  F0F1 ATP synthase subunit A  32.41 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.22629  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  29.55 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  30.3 
 
 		 283 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  29.96 
 
 		 251 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  31.7 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  31.72 
 
 		 226 aa  93.6  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  31.58 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0179  ATP synthase, subunit A (H(+)-transporting two-sector ATPase)  33.21 
 
 		 376 aa  92.8  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.412196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1055  ATP synthase F0, A subunit  33.05 
 
 		 391 aa  92.8  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  34.95 
 
 		 194 aa  92.4  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06110  F0F1 ATP synthase subunit A  28.15 
 
 		 255 aa  92.4  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>