More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0311 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 		 400 aa  798    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  41.94 
 
 		 373 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03040  putative ATP synthase A chain  40.4 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  40.33 
 
 		 355 aa  209  5e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  38.02 
 
 		 364 aa  208  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1055  ATP synthase F0, A subunit  46.1 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  40.7 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0179  ATP synthase, subunit A (H(+)-transporting two-sector ATPase)  42.99 
 
 		 376 aa  196  6e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.412196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0061  ATP synthase F0 subunit A  43.7 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  44.4 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  40.7 
 
 		 342 aa  179  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  44.49 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677372  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  44.13 
 
 		 341 aa  164  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1229  ATP synthase F0, A subunit  40.64 
 
 		 380 aa  163  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.896245 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4487  F0F1 ATP synthase subunit A  39.94 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.553444  normal  0.0963007 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2502  F0F1 ATP synthase subunit A  43.36 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4495  F0F1 ATP synthase subunit A  50.22 
 
 		 384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4340  F0F1 ATP synthase subunit A  47.08 
 
 		 381 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.35318  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4476  F0F1 ATP synthase subunit A  49.33 
 
 		 384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2247  F0F1 ATP synthase subunit A  44.53 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.608191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  38.86 
 
 		 251 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1515  ATP synthase F0, A subunit  39.82 
 
 		 248 aa  125  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0170  ATP synthase F0, A subunit  42.94 
 
 		 339 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.222204  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  34.6 
 
 		 241 aa  116  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  36.84 
 
 		 249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  37.39 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  38.72 
 
 		 261 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  39.8 
 
 		 285 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  32.92 
 
 		 261 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  33.89 
 
 		 248 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  33.61 
 
 		 263 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  34.25 
 
 		 268 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  27.9 
 
 		 303 aa  110  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  34.29 
 
 		 250 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  38.07 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  34.39 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  38.07 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0330  ATP synthase F0, A subunit  34 
 
 		 280 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 249 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  36.89 
 
 		 281 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 249 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  32.93 
 
 		 249 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 248 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  36.49 
 
 		 263 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  37.56 
 
 		 251 aa  106  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  38.42 
 
 		 260 aa  106  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 247 aa  106  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  34.39 
 
 		 251 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  29.51 
 
 		 260 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  34.7 
 
 		 251 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  35.92 
 
 		 263 aa  104  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  30.65 
 
 		 258 aa  104  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  34.45 
 
 		 250 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  35.81 
 
 		 261 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  36.86 
 
 		 295 aa  103  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  32.99 
 
 		 247 aa  103  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  37.24 
 
 		 253 aa  102  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  35.22 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  32.86 
 
 		 249 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  36.09 
 
 		 261 aa  101  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  34.33 
 
 		 267 aa  100  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  32.44 
 
 		 250 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  31.55 
 
 		 250 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  30.8 
 
 		 243 aa  97.4  4e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  31.56 
 
 		 252 aa  97.1  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  32.23 
 
 		 250 aa  97.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  31.98 
 
 		 207 aa  96.3  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  32.65 
 
 		 247 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  32.84 
 
 		 249 aa  95.5  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  32.59 
 
 		 246 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  27.54 
 
 		 267 aa  94.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  35.93 
 
 		 283 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  33 
 
 		 283 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  32.42 
 
 		 250 aa  92  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  29.36 
 
 		 250 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  33.74 
 
 		 272 aa  91.3  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  33.17 
 
 		 248 aa  89.7  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  31.42 
 
 		 312 aa  89.7  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  30.9 
 
 		 241 aa  89.4  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  37.19 
 
 		 265 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  28.44 
 
 		 243 aa  89  1e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  33.49 
 
 		 258 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  32.18 
 
 		 234 aa  88.6  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  36.13 
 
 		 261 aa  88.2  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  32.86 
 
 		 282 aa  88.6  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  33.62 
 
 		 247 aa  88.6  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  32.81 
 
 		 275 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  34.98 
 
 		 265 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  27.01 
 
 		 251 aa  87.8  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  31.11 
 
 		 261 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  29.78 
 
 		 261 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1304  ATP synthase F0, A subunit  30.58 
 
 		 266 aa  85.9  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000065102  normal  0.293813 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  29.46 
 
 		 247 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  32.5 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  30.33 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  33.5 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  34.85 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2594  F0F1 ATP synthase subunit A  32.23 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546841 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  34.15 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1893  F0F1 ATP synthase subunit A  36.44 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0190421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>