More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1264 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 
262 aa  513  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  51.74 
 
 
261 aa  249  5e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  41.92 
 
 
272 aa  199  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  40.82 
 
 
276 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  39.85 
 
 
283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2611  F0F1 ATP synthase subunit A  42.61 
 
 
266 aa  166  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  36.47 
 
 
272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  37.45 
 
 
275 aa  163  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2119  ATP synthase F0, A subunit  35.45 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00507952  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2344  F0F1 ATP synthase subunit A  42.61 
 
 
266 aa  162  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  39.25 
 
 
263 aa  162  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  38.78 
 
 
267 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  40.19 
 
 
266 aa  157  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  38.11 
 
 
265 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  37.1 
 
 
259 aa  156  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  39.22 
 
 
283 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  39.22 
 
 
285 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  37.12 
 
 
263 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  35.27 
 
 
281 aa  151  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  36.26 
 
 
265 aa  149  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  37.65 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  34.62 
 
 
261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  33.58 
 
 
284 aa  145  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  35.19 
 
 
295 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  37.1 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  36.93 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1301  ATP synthase F0, A subunit  32.68 
 
 
282 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  31.34 
 
 
270 aa  132  5e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  38.46 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  34.12 
 
 
263 aa  122  6e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0330  ATP synthase F0, A subunit  35.75 
 
 
280 aa  118  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  31.25 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0142  ATP synthase F0, A subunit  31.4 
 
 
284 aa  115  5e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  31.82 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  35.8 
 
 
258 aa  112  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  35.15 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  34.73 
 
 
247 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  35.56 
 
 
247 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
251 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  30.68 
 
 
303 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
251 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
251 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  33.74 
 
 
250 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  29.7 
 
 
261 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  27.82 
 
 
243 aa  103  2e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  35.42 
 
 
248 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
250 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  32.64 
 
 
249 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  31.8 
 
 
253 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  33.61 
 
 
249 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  33.88 
 
 
248 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  33.61 
 
 
249 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  31.73 
 
 
257 aa  99.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  31.09 
 
 
251 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  30.04 
 
 
258 aa  99.8  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  32.35 
 
 
251 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  32.35 
 
 
260 aa  99  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  32.05 
 
 
248 aa  98.6  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
250 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  32.1 
 
 
282 aa  96.7  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  32.22 
 
 
249 aa  97.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  32.61 
 
 
373 aa  95.9  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  33.47 
 
 
252 aa  95.5  7e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  32.77 
 
 
373 aa  95.5  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  35.05 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  32.64 
 
 
251 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  35.56 
 
 
249 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  32.77 
 
 
250 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  26.42 
 
 
243 aa  92.4  6e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4487  F0F1 ATP synthase subunit A  31.88 
 
 
406 aa  92.4  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.553444  normal  0.0963007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  33.5 
 
 
268 aa  91.3  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  29.96 
 
 
241 aa  90.9  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  31.45 
 
 
260 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  31.72 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  30.97 
 
 
243 aa  90.1  3e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  30.4 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  31.71 
 
 
241 aa  89  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  30.9 
 
 
250 aa  88.6  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  33.82 
 
 
194 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  34.91 
 
 
355 aa  88.2  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4495  F0F1 ATP synthase subunit A  34.27 
 
 
384 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  27.9 
 
 
261 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  27.9 
 
 
247 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  28.27 
 
 
261 aa  85.9  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0723  F0F1 ATP synthase subunit A  31.33 
 
 
228 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  31.51 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  27.89 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  31.58 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  29.58 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  31.28 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  30.45 
 
 
229 aa  82  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  30.67 
 
 
364 aa  82  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  31.36 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1893  F0F1 ATP synthase subunit A  32.46 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0190421 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  26.09 
 
 
235 aa  81.6  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  31.46 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0858  F0F1 ATP synthase subunit A  26.52 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4476  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4340  F0F1 ATP synthase subunit A  32.86 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.35318  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  31.17 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>