More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1066 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 
261 aa  513  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  64.82 
 
 
294 aa  326  3e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  61.39 
 
 
281 aa  325  5e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  57.75 
 
 
272 aa  298  5e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1301  ATP synthase F0, A subunit  55.64 
 
 
282 aa  297  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  51.92 
 
 
283 aa  252  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  47.33 
 
 
270 aa  241  7.999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  48.19 
 
 
247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0142  ATP synthase F0, A subunit  46.61 
 
 
284 aa  206  4e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  40.48 
 
 
261 aa  168  7e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  38.61 
 
 
275 aa  168  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  37.31 
 
 
272 aa  161  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  39.85 
 
 
259 aa  159  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  37.78 
 
 
284 aa  152  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2119  ATP synthase F0, A subunit  34.6 
 
 
270 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00507952  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  37.79 
 
 
263 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  37.4 
 
 
263 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  37.97 
 
 
265 aa  148  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  36.51 
 
 
265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  38.28 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  37.4 
 
 
295 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  34.62 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  41.07 
 
 
283 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0330  ATP synthase F0, A subunit  35.74 
 
 
280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  34.96 
 
 
285 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  38.37 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  37.74 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2611  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  40.44 
 
 
276 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2344  F0F1 ATP synthase subunit A  34.12 
 
 
266 aa  123  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801138 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  36.25 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  35.09 
 
 
342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  36.64 
 
 
251 aa  109  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  37.32 
 
 
345 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  32.89 
 
 
340 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677372  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  37.8 
 
 
268 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0061  ATP synthase F0 subunit A  35.84 
 
 
339 aa  100  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  33.77 
 
 
341 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  35.59 
 
 
251 aa  99  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  32.94 
 
 
243 aa  97.8  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  36.02 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  32.68 
 
 
312 aa  95.9  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  31.64 
 
 
243 aa  95.9  6e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  36.11 
 
 
400 aa  95.9  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  35.09 
 
 
252 aa  95.5  8e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  35.44 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  32.72 
 
 
355 aa  94.7  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  34.74 
 
 
263 aa  94  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1893  F0F1 ATP synthase subunit A  36.25 
 
 
249 aa  93.6  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0190421 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4487  F0F1 ATP synthase subunit A  36.41 
 
 
406 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.553444  normal  0.0963007 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  30.47 
 
 
247 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  30.47 
 
 
261 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  32.47 
 
 
303 aa  92.4  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  32.13 
 
 
261 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  37.78 
 
 
248 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4495  F0F1 ATP synthase subunit A  37.61 
 
 
384 aa  92  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03040  putative ATP synthase A chain  31.22 
 
 
361 aa  91.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  33.03 
 
 
267 aa  91.7  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  32.63 
 
 
282 aa  90.1  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  34.32 
 
 
251 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  33.2 
 
 
250 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  36.36 
 
 
207 aa  88.6  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  32.63 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  32.63 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  32.65 
 
 
249 aa  87  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  32.65 
 
 
249 aa  86.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  31.84 
 
 
249 aa  86.3  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  32.63 
 
 
251 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  29.31 
 
 
241 aa  85.5  7e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  36.2 
 
 
247 aa  85.5  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  32.89 
 
 
364 aa  85.9  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2502  F0F1 ATP synthase subunit A  29.03 
 
 
338 aa  85.5  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  29.43 
 
 
258 aa  85.5  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  34.91 
 
 
373 aa  85.1  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  31.08 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  37.17 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  36.44 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0170  ATP synthase F0, A subunit  37.76 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.222204  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  35.1 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  31.56 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4340  F0F1 ATP synthase subunit A  34.86 
 
 
381 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.35318  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  32.52 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  31.12 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  33.64 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1304  ATP synthase F0, A subunit  32.18 
 
 
266 aa  82  0.000000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000065102  normal  0.293813 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0461  ATP synthase F0, A subunit  33.06 
 
 
235 aa  82  0.000000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000814456  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  35.29 
 
 
247 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4476  F0F1 ATP synthase subunit A  34.4 
 
 
384 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  31.82 
 
 
250 aa  81.6  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  32.1 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1938  F0F1 ATP synthase subunit A  29.48 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00021369  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  32.63 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  32.64 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  33.05 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  32.74 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  34.62 
 
 
250 aa  79  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1055  ATP synthase F0, A subunit  29.47 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2594  F0F1 ATP synthase subunit A  29.74 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546841 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  34.98 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>